Xxiv международная медико-биологическая конференция молодых исследователей Фундаментальная наука и клиническая

Цель исследования: 
определить ингибирующие свойства телби-
вудина на протеазе 6M03 COVID-19 методом молекулярного моде-
лирования
Материалы и методы исследования: 
В ходе работы использова-
лись следующие программные пакеты: ChemOffice 2016, HyperChem 
08, Gaussian 09W и Molegro molecular viewer. В качестве биологиче-
ской мишени выбрана протеаза COVID-19 6M03. Химическая струк-
тура белка взята из базы белков: https://www.rcsb.org/structure/6M03. 
Коронавирус содержат геном, состоящий из длинной цепи РНК. 
Этот геном действует так же, как информационная РНК, когда он 
заражает клетку, и управляет синтезом двух полипротеинов, кото-
рые включают механизм, необходимый вирусу для репликации но-
вых вирусов. Протеазы в свою очередь играют важную роль в раз-
резании полипротеинов на функциональные части. Таким образом 
можно понизить активность протеазы SARS-CoV-2 путем ингиби-
рования данного белка при помощи лиганда в виде телбивудина. Из-
менения, которые будут вызваны низкомолекулярным соединением 
приведут к нарушению нативной структуры белка и, как следствие, 
уменьшению его активности.
Результаты и их обсуждение:
Между телбивудином и протеа-
зой SARS-CoV-2 образовался комплекс с 9 водородными связями 
с разной энергией(E): от -0,069 до -2,065 соответсвенно. Образо-

---

676
ФАРМАКОЛОГИЯ, ФАРМАКОГНОЗИЯ, ФАРМАЦЕВТИКА, ТОКСИКОЛОГИЯ
вались: 1 водородная связь(E=-2,065) между His163 и кислородом 
гидроксогруппы сахарного остатка в положении 3’, 1 водородная 
связь(E=-0,069) между His164 и кислородом гидроксильной группы 
сахарного остатка в положении 3’, 2 водородные связии (E=-1,458 и 
-0,551) между Сys145 и кислородом пиримидинового основания в по-
ложении 2 и 1связь(E=-0,329) между кислородом сахарного остатка 
в положении 4’, 1 водородная связь(E=-1,885) между Leu 141 и кис-
лородом пиримидинового основания в положении 2, 2 водородные 
связи(E=-0,227 и — 0,754) между Ser144 и кислородом пиримидино-
вого основания в положении 2, 1 водородная связь(E=-1,469) между 
Gly 143 и кислородом пиримидинового основания в положении 2.
Выводы: 
Телбивудин теоретически способен ингибировать про-
теазу COVID-19, образуя водородные связи и изменяя конформа-
цию белка, вследствие чего биополимер теряет свою биологическую 
функцию. 

---

ФАРМАКОЛОГИЯ, ФАРМАКОГНОЗИЯ, ФАРМАЦЕВТИКА, ТОКСИКОЛОГИЯ
677