Сборник содержит материалы научной мультиконференции «Биотех- нология медицине будущего»

Выявление корреляции генов устойчивости к антибиотикам
в кишечном метагеноме с расстройствами аутистического спектра
Ковтун А.С.
1,2
, Алексеева М.Г.
1
, Аверина О.В.
1
, Ребриков Д.В.
3
, Даниленко В.Н.
1
1
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва, Россия 
2
Московский физико-технический институт (национальный исследовательский 
университет), Долгопрудный, Россия 
3
Российский национальный исследовательский медицинский университет имени 
Н.И. Пирогова, Москва, Россия
Опубликованные данные по корреляции применения антибиотикотерапии и появ- 
ления у детей расстройств аутистического спектра (РАС) указывают на возможную 
тригерную роль антибиотиков в развитии симптоматики аутизма [1]. Применение 
антибиотиков приводит к изменениям в составе и нарушениям в функционировании 
микробиоты кишечника (МК), наблюдаемым у детей с РАС, которое рассматривается 
как расстройство оси микробиота-кишечник-мозг. С другой стороны, показана поло- 
жительная роль антибиотиков в улучшении симптоматики РАС у детей после антибио-
тикотерапии. Целью данного исследования является изучение особенностей распро-
странения генов лекарственной устойчивости (ГЛУ) на мобильных генетических 
элементах у бактерий МК среди больных детей с РАС в мегаполисе г. Москва. В работе 
исследовались 50 метагеномов МК детей в возрасте от 3 до 5 лет, среди них: 20 образцов 
– контрольная группа; 30 образцов – дети с РАС. Поиск ортологов генов устойчивости
в метагеномах проводился с использованием базы данных ГЛУ ResFinder [2]. Выпол-
нялся поиск ортологов ГЛУ к следующим группам антибиотиков: аминоглико-
зидам, бета-лактамным антибиотикам, гликопептидам, макролидам, тетрациклинам, 
хинолонам. На основе результатов сравнительного анализа можно утверждать, что 
МК детей является резервуаром генов устойчивости к аминогликозидам, макролидам, 
бета-лактамам и антибиотикам тетрациклинового ряда. Селекция по ГЛУ может при- 
водить к отбору видов и штаммов бактерий, обладающих способностью синтезировать 
продукты, приводящие к РАС. Сигнатурный подход анализа метагенома МК должен 
быть расширен до 3 компонентов: вид бактерии, сформированная группа функци-
ональных генов и значимая группа ГЛУ. Отобранные ГЛУ могут быть кандидатами
в биомаркеры РАС: aac(6’)-aph(2”), ant(6)-Ia, erm(B).
1. Vargason T., McGuinness D.L., Hahn J. Gastrointestinal symptoms and oral antibiotic use 
in children with autism spectrum disorder: retrospective analysis of a privately insured U.S. 
population // J. Autism Dev. Disord. – 2018 – V. 49 – № 2 – p. 647-659.
2. Zankari E., Hasman H., Cosentino S., Vestergaard M., Rasmussen S., др. всего 8 человек. 
Identification of acquired antimicrobial resistance genes // J Antimicrob. Chemother. – 
2012 – V. 67 – № 11 – p. 2640-2644.
Исследование поддержано грантом РНФ № 17-15-01488.

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
174