Rasm Turli dnk molekulalari orasidagi gibridlanish

DNK gibridizatsiyasi, nuklein kislotalarning gibridlanishi- ulanish in vitro Bir molekulada bir-birini to'ldiruvchi bir zanjirli nuklein kislotalar. To'liq to'ldiruvchilik holatida birlashish oson va tez sodir bo'ladi, qisman qo'shimcha bo'lmagan taqdirda esa, zanjirlarning birlashishi sekinlashadi, bu esa to'ldiruvchilik darajasini baholashga imkon beradi. DNK-DNK va DNK-RNKning gibridlanishi mumkin.

Tajriba jurnali

1. 
   Ikki zanjirli DNK tegishli buferda isitiladi. Tashqi sharoitlarning o'zgarishi tufayli komplementar azotli asoslar orasidagi vodorod bog'lari termodinamik jihatdan noqulay bo'lib, zanjirlar ajralib chiqadi.
   
2. 
   Denatüratsiyalangan DNK preparati boshqa denaturatsiyalangan DNK bilan aralashtiriladi.
   
3. 
   Preparatlar asta-sekin sovutiladi, bir zanjirli DNK esa bir-biriga tavlanadi (komplementar asoslar o'rtasida vodorod bog'lari hosil bo'ladi), shu bilan "gibrid" DNK molekulasini hosil qiladi.
   

Bir zanjirli DNKning tavlanish tezligini tahlil qilish bir turdagi turlar yoki individlar o'rtasidagi DNK ketma-ketligidagi o'xshashlik va farqlarni baholashga imkon beradi.

DNKning erish nuqtasini hisoblash

DNKning ikkilamchi tuzilishi biologiya, genetik diagnostika va molekulyar biologiya va nanotexnologiyaning boshqa usullarida muhim rol o'ynaydi. Shuning uchun DNK yoki RNK molekulalarining erish nuqtasini aniq aniqlash barcha molekulyar biologik usullarda, masalan, mikroarraylar uchun namunalar yoki oligonükleotidlarni tanlash yoki PCR primerlarini tanlash uchun eng muhim rol o'ynaydi. Qisqa oligonukleotidlar uchun erish nuqtasini hisoblash uchun bir nechta oddiy formulalar mavjud. Qisqa oligonukleotidning erish nuqtasini (T m) qo'pol hisoblash (<20 нуклеотидов) проводят по прямому подсчету количества нуклеотидов (G+C - сумма всех гуанинов и цитозинов , L - длина олигонуклеотида):
K + va DMSO ionlarining kontsentratsiyasini hisobga olgan holda qisqa oligonukleotid (va uzoq DNK bo'laklari uchun) uchun T m ni hisoblashning o'rtacha formulasi:
Biroq, bu tenglamalar oliginukleotidning gibridlanishi paytida bog'lanishning boshlanishini hisobga olmaydi, ketma-ketlikning o'ziga xos xususiyatlarini va oligonukleotid duplekslariga xos bo'lgan yakuniy effektni hisobga olmaydi. Shuning uchun, bu formula ko'proq mos keladi, bu erda DNK ketma-ketligi o'rtacha hisoblanadi va duplekslarning uzunligi 40 dan ortiq nukleotidlardir.