Strukturaviy biologiya burchagi
Keling, izoelektrik nuqta ta'rifidan boshlaylik:
Izoelektrik nuqta (pI) - oqsilning sof zaryadi nolga teng bo'lgan pH. Proteinlar bo'lsa, izoelektrik nuqta asosan ettita zaryadlangan aminokislotalarga bog'liq: glutamat (d-karboksil guruhi), aspartat (ß-karboksil guruhi), sistein (tiol guruhi), tirozin (fenol guruhi), histidin (imidazol yon zanjirlari), lizin (ε -ammoniy guruhi) va arginin (guanidinium guruhi). Bundan tashqari, oqsil terminal guruhlari (NH) zaryadini hisobga olish kerak2 men COOH). Ularning har birida kislotaning ajralish konstantasi bor, u pK deb ataladi.
Bundan tashqari, oqsilning aniq zaryadi pH (bufer) pH bilan chambarchas bog'liq. Buni hisobga olgan holda, ma'lum bir pHda protein zaryadini hisoblash uchun Henderson-Hasselbax tenglamasidan foydalanishimiz mumkin:
Salbiy zaryadlangan makromolekulalar uchun –:
– musbat zaryadlangan makromolekulalar uchun:
* Arg tadqiqotga kiritilmagan va boshqa barcha shkalalardan o'rtacha pK olingan
ProMoST-da amalga oshirilgan yanada rivojlangan algoritm kuydirilgan aminokislotalarning lokalizatsiyasini hisobga oladi:
N va C terminallari uchun zaryadlanmagan aminokislotalarga qarab har xil pK qiymatlari qo'llaniladi:
Endi, bir nechta ma'lumotlarga ega bo'lgan holda, biz izoelektrik nuqtani hisoblaydigan oddiy kompyuter dasturini yozishga harakat qilishimiz mumkin. Biz bepul DevC++ kompilyatoridan foydalanamiz, chunki dastur C++ dasturlash tilida yoziladi. Keyingi bo'limni o'qish uchun siz hech bo'lmaganda C ++ tilida asosiy bilimlarga ega bo'lishingiz kerak.
Aminokislota
Musbat va manfiy zaryadga ega bo'lgan funktsional guruhlari bilan molekula hosil qilish.
1 ml oqsil eritmasidagi 1 ml Ninhidrin qiziganidan keyin binafsha rangni ko'rsatadi. Bu alfa-aminokislotalarning mavjudligini ko'rsatadi.
Sanger reaktivi sovuq sharoitda yumshoq gidroksidi muhitda amino guruh bilan reaksiyaga kirishadi.
Amino guruhi bilan reaksiyaga kirishib, azot chiqaradi va tegishli gidroksil hosil qiladi.
Adabiyotlar:
1. Семчиков Ю.Д. Высокомолекулярные соединения. М.: АСАДЕМА, 2005, 367 с.
2. Мусаев У.Н., Бабаев Т.М., Курбанов Ш.А., Хакимжонов Б.Ш., Мухамедиев М.Г. Полимерлар кимёсидан практикум. Тошк.: Университет, 2001.
3. Тагер А.А. Физико-химия полимеров. Учебное пособие. М.: Химия, 1978.
4. Стрепихеев А.А. Деревицкая В.А. Основы химии высокомолекулярных соединений. Учебное пособие, М.: 1976.
5. Оудиан Дж. Основы химии полимеров. М.: Химия, 1978
6. Шур А.М. Высокомолекулярные соединения. Учебник, М.: Высшая школа, 1981.
Do'stlaringiz bilan baham: |