I bob alfa Beta gidrolazalar supero ilasi fermentlari katalitik

Mavzuning
dolzarbligi
. Tibbiy bioinformatika fanining eng tez
rivojlanayotgan yo'nalishlaridan biridir. So'nggi 25 yil ichida kuzatilgan 
tibbiyotning ushbu yo'nalishi "Inson genomi" xalqaro loyihasining boshlanishi bilan 
bog'liq. Ushbu mavzuni chuqur o’rganish,ushbu mavzu haqidagi bilimlarni 
rivojlantirish bugungi kunda asosiy masalalardan biridir. 
Mavzuning o’rganilgan darajasi: 
Botti et al. 1998 
S.A Botti, C.E Felder, J.L Sussman, I Silman Electrotactins: a class of adhesion
 
proteins with conserved electrostatic and structural motifs
 
Protein Eng., 11 (1998), 
pp. 415-420 View Record in ScopusGoogle Scholar
 
Bourne et al. 1999
 
Y Bourne, P Taylor, P.E Bougis, P Marchot mavzu boyicha shu va boshqa 
adabiyotlardan foydalanildi. 
Kurs ishining maqsad va vazifalari. 
Alfa/Beta gidrolazalar supero ilasi 
fermentlari katalitik aminokislotalarining qiyosiy bioinformasion tahlili mavzusini 
o’rganish hama mutatsion kasalliklarning oldini olish chora tadbirlarini 
rivojlantirishdan iborat. 
 
Kurs
ishining
tuzilishi
:Kurs ishi kirish ,asosiy qism, xulosa 3 ta rasm, 
foydalanilgan adabiyotlar ro’yxati, Jami 27 betdan iborat 
 

---

6 
I BOB Alfa Beta gidrolazalar supero ilasi fermentlari katalitik 
aminokislotalarining qiyosiy bioinformasion taxlili 
1.1.
 
Alfa/beta-gidrolaza qatlam fermentlarining bioinformatik tahlili 
Alfa-beta gidrolazalarning super oilasi turli xil katalitik funktsiyalarga ega 
bo'lgan tizimli bog'liq fermentlarning eng katta guruhlaridan biridir. Bioinformatik 
tahlil lipaza va amidaza katalitik faolliklari bir xil tuzilmaviy doirada qanday amalga 
oshirilishini o'rganish uchun ishlatilgan. Funktsional diskriminatsiya uchun javobgar 
bo'lishi kerak bo'lgan subfamilaga xos pozitsiyalar - lipazlar va peptidazalar ichida 
saqlanib qolgan, ammo ular orasidagi farqli pozitsiyalar aniqlangan. Subfamilaga 
xos pozitsiyalardagi mutatsiyalar Candida antarctica lipase B (CALB) ga amidaza 
faolligini kiritish uchun ishlatilgan. Molekulyar modellashtirish tanlangan 
qoldiqlarning mutantlarning tegishli kutubxonasi tomonidan amid substratining 
bog'lanishi va katalitik konversiyasiga ta'sirini baholash uchun amalga oshirildi. 
Amidaza katalitik faolligining bilimga asoslangan mezonlarini qondiradigan reaktiv 
ferment-substrat komplekslarini tanlash uchun silika skriningi qo'llanildi. Gly39, 
Thr103, Trp104 va Leu278 subfamiliyaga xos pozitsiyalarda almashtirish bilan 
tanlangan CALB variantlari ishlab chiqarildi va eksperimental o'lchangan amidaza 
faolligining sezilarli yaxshilanishini ko'rsatdi. Ushbu natijalarga asoslanib, biz 
fermentlardagi struktura-funksiya munosabatlarini o'rganish uchun tizimli vositani 
ishlab chiqish va bu ma'lumotni ratsional ferment muhandisligi uchun ishlatish 
uchun subfamilaga xos pozitsiyalarning qiymatini yanada chuqurroq o'rganishni 
taklif qilamiz. 
Qiyosiy bioinformatik tahlil fermentlarning struktura-funktsiya munosabatlarini 
o'rganishning asosidir. Shu bilan birga, umumiy ajdoddan kelib chiqqan va tabiiy 
tanlanish jarayonida sezilarli funktsional o'zgarishlarga uchragan ko'plab fermentlar 
statistik jihatdan ishonchli qiyosiy tahlil uchun maqbul ketma-ketlik o'xshashligiga 
ega emas. Shu bilan birga, ularning faol sayt tuzilmalari, umuman olganda, saqlanib 
qolishi mumkin, boshqa qismlar esa sezilarli darajada farq qilishi mumkin. Shu 
sababli, eng funktsional jihatdan muhim tarkibiy elementlar - faol sayt 
tuzilmalarining qiyosiy tahlilini amalga oshirish ham mantiqiy, ham jozibali 

---

7 
ko'rinadi; ya'ni substratni bog'lashda va katalitik mexanizmda ishtirok etadigan 
aminokislota qoldiqlari. PDB ma'lumotlar bazasidan foydalanish asosida fermentlar 
tarkibidagi funktsional muhim aminokislotalar qoldiqlari va bo'shliqlarini 
strukturaviy tahlil qilish va identifikatsiya qilish dasturlari bilan birgalikda ferment 
faol sayt tuzilmalari kutubxonasini yaratish uchun kompyuter algoritmi ishlab 
chiqilgan. Taklif etilgan metodologiya ba'zi a,b-gidrolaz superfamiliya fermentlarini 
solishtirish uchun ishlatilgan. Tushunish katalitik maydonlarning yuqori 
strukturaviy o'xshashligini, shu jumladan katalitik triadaning konservativ tashkil 
etilishini va oksianion teshik qoldiqlarini, taqqoslangan uzoq gomologlar orasida 
keng funktsional xilma-xillikka qaramasdan aniqladi. Metodologiya turli toifadagi 
fermentlarning katalitik va substrat bog'lanish joylarining strukturaviy tashkil 
etilishini solishtirish, shuningdek, fermentlar evolyutsiyasini o'rganish va ferment 
faol sayt tuzilmalari ma'lumotlar bankini yaratish uchun ishlatilishi mumkin. 
 
1-rasm