Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

Affibody-maqsadli juftlikning tarkibiy tahlili (I, II)
kompleksdagi oqsillar kichik, spiral 1 bilan cheklangan, bu ZSPA-1 uchun biroz qisqaroq,
ikkita oqsilning 8-56 qoldig'i. Ikkilamchi tuzilishdagi farqlar
Z-domenidagi kabi 4 o‘rniga 6 qoldig‘idan va Z-dagi 2 va 3 spiral orasidagi halqadan boshlanadi.
ularning bog'lanmagan holatlari hal qilindi (Lendel va boshq. 2006). Bu erda umumiy tuzilishi
5.6 ga o'zgartirildi. NMR tajribalari uchun harorat 30 ºC dan tanlangan
6,8 bo'ladi, bu Z va ZSPA -1 uchun nazariy pI qiymatlari o'rtasida bo'lishi mumkin.
iskala Z-domeniga. Z va ZSPA-1 o'rtasidagi magistral rms og'ishi faqat 0,9 Å uchun
Yaqinda affitel-affitel kompleksining NMR tuzilmalari va ishtirok etgan affitel molekulalari
(www.expasy.org), ammo ZSPA-1 o'sha sharoitlarda bizning namunalarimizda asta-sekin cho'kib ketganligi sababli, pH
shakllanishi. Kompleksda ZSPA-1 o'xshash va ixcham uchta spiral to'plamini qabul qila oladi
Z-domeni o'zgartirildi (Nord va boshq. 1995; Nord va boshq. 1997; Eklund va boshq. 2002).
davlat. Bundan tashqari, affibody molekulalari bir qator maqsadlar uchun muvaffaqiyatli tanlangan
affibody molekulalari o'zlarining murakkab holatlarida, shuningdek, bog'lanmagan holatlardagi uchtadan ikkitasi uchun.
34
Z-domenining va kompleksda yuzaga keladigan affitel molekulasining qo'shilgan qatlamlanishi
Murakkab bog'langan affitel molekulasi aniq emas edi, chunki sirtda 13 ta qoldiq (58 tadan) mavjud.
iskala oqsili, tekshirilgan uchtasi uchun umumiy tuzilmani saqlab qolish qobiliyatiga ega
Kompleksning tuzilishi yon zanjirlarni o'zgartirish kombinatsiyasini ochib beradi (ya'ni induktsiyalangan moslashuv)
oqsillar. Z-domeni iskala strukturaviy xossalari saqlanib qolganligi
Wikman va boshqalar. 2006) ushbu tuzilmalar Z domenining ajoyib xususiyatlarini yanada isbotlaydi
Yon zanjirning konformatsiyasi va yadro ichidagi qadoqlash tartibi ikkalasida juda o'xshash
va boshqalar. 2001; Rönnmark va boshqalar. 2002; Sandström va boshqalar. 2003; Wikman va boshqalar. 2004; Orlova va boshqalar. 2006;
MGts spektrometrlari va 5 mm uch rezonansli (1 H, 13C, 15N) problar bilan jihozlangan Varian Inova 800 MGts
asbobida .
Buning o'rniga ZSPA-1da 310-spiral konformatsiya hosil qiladi. (7.1-rasm)
ota-ona Z iskala ikkala affibody oqsillarida ham kompleksda, ham erkin holda saqlanadi.
pM yaqinliklari bilan (Nord va boshq. 1997; Gunneriusson va boshq. 1999; Hansson va boshq. 1999; Nord
NMR spektrlarining ko'rinishi. NMR ma'lumotlari Bruker Avance 500 MGts va 600 da olingan
7.2 Strukturaviy tahlil
Machine Translated by Google

---