Omânia Ministerul Educaţiei, Cercetării, Tineretului şi Sportului

LABORATOARE DE CERCETARE

L.3.1. Laborator zonal de genotipizare a animalelor

1. Date de contact

Denumire laborator	Laborator zonal de genotipizare a animalelor
Acronim	LZGA
Logo
Adresă site	www.usamvcluj.ro/cercetare
Director	Prof. dr. Vlaic Augustin
Facultatea	Zootehnie si Biotehnologii
Telefon	[phone] int.160
Fax	[phone]
E-mail	[e-mail]

2. Obiective

Genotipizarea speciilor animale la locii unor gene de interes economic asociate cu cantitatea şi calitatea unor produse (lapte, carne). Identificarea şi caracterizarea moleculară a noi alele la locii celor 6 proteine majore din lapte la bivolul românesc, Sura de stepă, rasa de caprine Carpatină şi folosirea lor ca markeri genetici în selecţie. Utilizarea polimorfismelor genetice ale proteinelor din laptele animal ca markeri genetici în identificarea autenticităţii şi originii laptelui şi a produselor lactate autohtone. Genotipizarea ovinelor autohtone pentru rezistenţa/susceptibilitatea la scrapie. Sexarea embrionilor şi detectarea sexului pe baza de markeri ADN din probe de carne/alte ţesuturi, în cazul litigiilor. Determinarea cariotipului în identificarea de mutaţii cromozomiale.

3. Domenii de competenţă

Genetică moleculară. Selecţia asistată de markeri genetici (MAS). Trasabilitatea produselor de origine animală. Filogenie. Eredopatologie.

4. Echipa de cercetare

Prof. dr. Vlaic Augustin - şef laborator; domenii de expertiză: coordonarea activităţii în laborator, prelucrarea şi interpretarea rezultatelor analizelor genetice efectuate, achiziţia de echipamente, reactivi. Conf. dr. Coşier Viorica - locţiitor şef laborator; domenii de expertiză în utilizarea tehnicilor de genetică şi biologie moleculară. Prof. dr. Oroian Teofil - membru în echipa de cercetare; domenii de expertiză în selecţia asistată de markeri genetici. Conf. dr. Cighi Vasile - membru în echipa de cercetare; domenii de expertiză în selecţia asistată de markeri genetici. Dr. ing. Bălteanu Valentin - manager calitate, responsabil de proceduri; domenii de expertiză în utilizarea tehnicilor moleculare şi interpretarea rezultatelor. Dr. ing. Carşai Crina Teodora - responsabil proceduri; domenii de expertiză în utilizarea tehnicilor moleculare la taurine şi caprine. Dr. ing. Şuteu Mihai - responsabil proceduri; domenii de expertiză în utilizarea tehnicilor moleculare la suine. Drd. ing. Banyai Flavius - responsabil de proceduri; domenii de expertiză în utilizarea tehnicilor moleculare la cabaline.

5. Activitatea de cercetare în ultimii 5 ani (2008-2013)

Recoltarea şi prelucrarea primară a probelor destinate analizelor genetice. Extracţia ADN şi ARN din diferite probe biologice (sânge, păr, carne, spermă, celule somatice), cuantificarea şi purificarea. Amplificarea ADN prin PCR şi Real Time PCR şi variante ale tehnicii PCR (PCR-RFLP, RT-PCR, RAPD, Multiplex PCR). Electroforeza ADN, ARN şi de proteine în geluri specifice (agaroză, poliacrilamidă). Citirea şi interpretarea electroforegramelor în vederea stabilirii genotipurilor. Genotipizarea ovinelor la locusul PrnP (proteinei prionice) care determină scrapia (extracţia ADN, amplificarea PCR preSnapShot, purificarea produsului PCR, secvenţierea prin tehnica Primer extension, electroforeza de capilaritate, analiza şi interpretarea profilelor de tip SNP din electroforegrame şi stabilirea genotipurilor). Secvenţierea de novo a fragmentelor de ADN (ABI Prism 3130 xl). Analiza de fragmente (microsateliţi, SNP) (ABI Prism 3130 xl) la loci de interes economic sau în scop de identificare în populaţiile de animale.

6. Infrastructura de cercetare

Nr. crt.	Echipament	Activitatea la care se utilizează	Anul achiziţiei
1.	Termocycler cu gradient	5.3.	2006
2.	Real Time-PCR	5.3.	2007
3.	Sistem de preluare şi documentare a imaginilor (Geldoc)	5.5.	2006-2007
4.	Sistem complet de electroforeză orizontală, verticală şi de focusare izoelectrică	5.4.; 5.6.	2006
5.	Autoclar vertical	5.1.	2006
6.	Termostat	5.2.	2006
7.	Balanţă analitică	5.1.; 5.2.; 5.4.	2006
8.	Centrifugă cu răcire	5.2.; 5.6.	2006
9.	Vortex – 2 buc.	5.1.; 5.2.	2006
10.	Sistem de obţinere apă pură	5.3.; 5.6.; 5.7.; 5.8.	2007
11.	Maşină cuburi gheaţă	5.2.; 5.3.; 5.6.	2007
12.	Ultracongelator (deep fcezer)	5.2.; 5.3.; 5.6.; 5.7.	2007
13.	Hotă CARBO 150 FA	5.2.; 5.6.; 5.7.; 5.8.	2011
14.	Spectrofotometru UV – VIS Nanodrop	5.2.; 5.6.	2007
15.	Baie de apă cu ultrasunete	5.1.; 5.2.; 5.6.	2007
16.	Analizator genetic ABI Prism 3130xl; Sequence Application, Module şi Gene Mapper, Software	5.5.; 5.6.; 5.7.; 5.8.	2007-2008

7. Proiecte de cercetare reprezentative

Nr. crt.	Titlul proiectului şi programul de finanţare	Director/Responsabil proiect	Perioada de derulare
1.	Studiul variabilităţii genetice pentru crearea de linii în populaţii de ciprinide (Cyprinus carpio) din Nord–Vestul Transilvaniei prin utilizarea markerilor genetici şi a biotehnologiilor associate pentru conservarea durabilă a genofondului; CEEX, Modul I, nr. 45/2005	Prof. dr. Oroian Teofil	2005-2008
2.	Crearea, dezvoltarea, implementarea sistemului calităţii şi acreditarea unui laborator zonal de genotipizare a animalelor de fermă; CEEX Modul IV, nr. 7578/2006	Prof. dr. Vlaic Augustin	2006-2008
3.	Producerea de hibrizi prin încrucişarea raselor Ţigaie şi Suffolk în vederea creşterii cantităţii şi calităţii cărnii de ovine; CNCSIS, tip A, nr. 1145/2006.	Prof. dr. Vlaic Augustin	2006-2008
4.	Creşterea rezistenţei la scrapie în populaţiile de ovine din România prin selecţia asistată la nivel molecular pentru dezvoltarea durabilă a creşterii şi exploatării ovinelor, asigurarea securităţii alimentare şi a sănătaţii populaţiei; CEEX, M1, nr. 2246/2006	Conf. dr. Coşier Viorica	2006-2008
5.	Cercetări privind polimorfismul HinfI din interiorul genei Pit1 şi utilizarea acestuia în selecţia asistată de markeri moleculari (MAS) la rasele româneşti de taurine; CNCSIS, tip A, nr. 1125/2006	Conf. dr. Coşier Viorica	2006-2008
6.	Studiul impactului polimorfismului markerului genetic cazeina alfa-s1 la rasa de caprine Carpatină asupra calităţii laptelui, randamentului de obţinere a brânzeturilor şi proprietăţilor senzoriale; PN2, nr. 52104/2008	Prof. dr. Vlaic Augustin	2008-2012
7.	Caracterizarea polimorfismelor proteinelor din laptele speciilor de fermă şi studierea posibilităţii utilizării lor ca markeri genetici de identificare a autenticităţii declarate a produselor lactate; PN2, PCE (IDEI), ID 2545/2008	Prof. dr. Vlaic Augustin	2008-2012
8.	Aprecierea fenotipică şi caracterizarea genetică prin tehnici moleculare a unor populaţii de mistreţi Sus Scrofa ferus cu stabilirea factorilor de impact asupra ecosistemelor din areal, pentru evitarea vulnerabilităţii genetice a speciei; PN2, nr. 52105/2008	Prof. dr. Oroian Teofil	2008-2012
9.	De la rustic la ameliorat: Studiul polimorfismului unor gene cheie implicate în dezvoltarea şi capacitatea lactogenă a glandei mamare la taurine şi caprine; PN2, TE, nr. 113/2010	Dr. ing. Carşai Crina Teodora	2010-2013

8. Realizări reprezentative (în ultimii 5 ani)

Nr. articole publicate - 80 Nr. analize pentru terţi – 7 beneficiari (234 probe) Nr. teze de doctorat finalizate - 10

9. Principalele articole științifice publicate în reviste ISI (în ultimii 5 ani)

IDENTIFICATION OF AN INTRONIC REGULATORY MUTATION AT THE BUFFALO ALPHA(S1)-CASEIN GENE THAT TRIGGERS THE SKIPPING OF EXON 6, Balteanu Valentin Adrian; Carsai Teodora Crina; Vlaic Augustin, 2013, MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, Volume: 40, Issue: 7, Pages: 4311-4316. A SIGNATURE PROTEIN-BASED METHOD TO DISTINGUISH MEDITERRANEAN WATER BUFFALO AND FOREIGN BREED MILK, Caira Simonetta; Pinto Gabriella; Balteanu Valentin A.; Chianese Lina; Addeo Francesco, 2013, FOOD CHEMISTRY, Volume: 141, Issue: 1, Pages: 597-603. A HIGH THROUGHPUT GENOTYPING APPROACH REVEALS DISTINCTIVE AUTOSOMAL GENETIC SIGNATURES FOR EUROPEAN AND NEAR EASTERN WILD BOAR, Manunza Arianna; Zidi Ali; Yeghoyan Seryozha; Balteanu Valentin Adrian; Carsai Teodora Crina; Scherbakov Oleg; Ramirez Oscar; Eghbalsaied Shahin; Castello Anna; Mercade Anna; Amills Marcel, 2013, PLOS ONE, Volume: 8, Issue: 2, Article Number: e55891. EVIDENCE OF ALTERNATIVE SPLICING OF PORCINE BETA-CASEIN (CSN2), Şuteu M, Vlaic A., Bălteanu VA., Wavreille J., Renaville R., 2012, ANIMAL GENETICS, Volume: 43, Issue: 4, Pages: 474-475. THE GENETIC RESISTANCE OF RAMS FROM TURCANA BREED TO OVINE TRANSMISSIBLE SPONGIFORM ENCEPHALOPATHY (SCRAPIE), V. Coşier, A. Vlaic, Vioara M., R. Constantinescu, 2011, ROMANIAN BIOTECHNOLOGICAL LETTERS, Volume: 16, Issue: 4, Pages: 6328-6335. MOLECULAR MARKERS USED IN GENETIC BIO-CONSERVATION OF THE ROMANIAN GREY STEPPE BREED, Creanga S, Maciuc V., Bălteanu V.A., 2011, CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY, Volume: 22, Supplement: 1, Pages: S54-S54. Notă: Profesor Dr. Vlaic Augustin este membru în Econogene Consortium, care în perioada 2009-2012 a publicat 3 articole ISI.

10. Vizibilitatea naţională şi internaţională

Prof. dr. Vlaic Augustin: Membru în Comitetul editorial al unor reviste ştiinţifice de profil: Bulletin of University of Agricultural Sciences and Veterinary Medicine Cluj-Napoca, Series: Agriculture, Horticulture, Animal Science and Biotechnologies, Veterinary Medicine, 2008-2011, Publisher. Revista de Zootehnie, 2008-2009, membru în colectivul de redacţie. Revista “Notulae Scientia Biologicae”, 2010-2012, editor. Conf. dr. Coşier Viorica: Membru în Comitetul editorial/ştiinţific lărgit al unor reviste ştiinţifice: Aacl Bioflux Aquaculture, Aquarium, Conservation&Legislation -International Journal of the Bioflux Society, ISSN 1844-9166: http://www.bioflux.com.ro/aacl Hvm Bioflux, Human&Veterinary Medicine: http://www.hvm.bioflux.com.ro/ Participarea la conferinte naţionale, internaţionale: The 8^th, 9^th, 10^th, 11^th, and 12^th, International Symposium PROSPECTS FOR 3rd MILLENIUM AGRICULTURE, Cluj-Napoca Romania (2008, 2009, 2010, 2011, 2012). Symposium Animal Husbandry, veterinary medicine and economics in rural development and the healty and food safety production, Univeristy of NoviSad, 20-27 iunie 2010. Acvapedia 2012, The International Aquaculture and Aquatic Life Sciences Conference, Szarvas, 27-29 noiembrie, Ungaria. International PhD Student Conference, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Faculty of Agronomy, Cehia, 25.11.2009. 3^rd International Symposium “Safe food. Plant Production, Animal Production, Management”. University of Technology and Life Sciences, Bydgoszcz, Poland. 18-20. 09, 2008. Simpozionul Ştiinţific Internaţional: USAMVB, Timişoara, 2008-2012. Simpozionul Ştiinţific Internaţional: USAMV Iaşi, Facultatea de Zootehnie, 2008-2011. XI International Conference on Goats, Gran Canaria, Spain, 27.09.2012.

11. Oferta de cercetare și servicii pentru mediul economic

Analize de genotipizare a taurinelor la loci proteinelor majore din lapte. Analize de genotipizare a caprinelor la loci proteinelor majore din lapte. Stabilirea sexului din probe de carne de la taurine. Extracţia ADN, cuantificarea, purificarea ADN din sânge de la Bivolul românesc Analize de genotipizare la toate speciile de animale (extracţia ADN, ARN, proteine, cuantificarea şi purificarea, amplificarea, electroforeza, secvenţierea, citirea şi interpretarea rezultatelor).