Magniy uchta barqaror izotopga ega: 24 Mg, 25 Mg va 26 Mg. Hammasi tabiatda sezilarli miqdorda mavjud (yuqoridagi izotoplar jadvaliga qarang). Taxminan 79% Mg 24 ni tashkil qiladi Mg. Izotop 28 Mg radioaktiv bo'lib, 1950-1970 yillarda ilmiy tajribalarda foydalanish uchun bir nechta atom elektr stantsiyalarida ishlab chiqarilgan. Bu izotop nisbatan qisqa yarimparchalanish davriga ega (21 soat) va undan foydalanish yuk tashish vaqti bilan cheklangan.
Nuklid 26 Mg alyuminiynikiga o'xshash izotopik geologiyada qo'llanilishini topdi.
Mg 26 ning radiogenik qiz mahsulotidir Yarim yemirilish davri 717 000 yil bo'lgan Al. Barqarorning haddan tashqari miqdori 26 Mg ba'zi uglerodli xondrit meteoritlarining Ca-Al ga boy qo'shimchalarida kuzatilgan. Bu g'ayritabiiy mo'l-ko'lchilik uning ota-onasining 26 parchalanishi bilan bog'liq Al qo'shimchalarida va tadqiqotchilar bunday meteoritlar quyosh tumanligida 26-asrdan oldin paydo bo'lgan degan xulosaga kelishdi. Al chirigan edi. Bular Quyosh tizimidagi eng qadimgi ob'ektlardan biri bo'lib, uning dastlabki tarixi haqida saqlanib qolgan ma'lumotlarni o'z ichiga oladi.
Magniy nomi yunoncha Magnetlar qabilasiga tegishli joylarni bildiruvchi so'zdan kelib chiqqan bo'lib, Tesaliyadagi Magnesia yoki Magnesia ad Sipylum, hozir Turkiyada joylashgan. Bu magnetit va marganets bilan bog'liq bo'lib, ular ham shu hududdan kelib chiqqan va alohida moddalar sifatida farqlashni talab qiladi. Ushbu tarix uchun marganetsga qarang.
1618 yilda Angliyaning Epsom shahridagi fermer o'z sigirlariga u yerdagi quduqdan suv berishga harakat qildi. Sigirlar suvning achchiq ta'midan ichishdan bosh tortishdi, biroq dehqon suvning tirnalgan va toshmalarni davolayotganini payqadi. Ushbu modda Epsom tuzlari nomi bilan mashhur bo'ldi va uning mashhurligi tarqaldi. Oxir-oqibat u gidratlangan magniy sulfat, MgSO deb tan olindi.
Metallning o'zi birinchi marta 1808 yilda Angliyada ser Humphry Davy tomonidan ajratilgan. U magniy va simob oksidi aralashmasida elektrolizdan foydalangan. Antuan Bussi uni 1831-yilda izchil shaklda tayyorlagan. Davyning nom berish boʻyicha birinchi taklifi magniy edi, ammo magniy nomi hozir ingliz tilida va barcha asosiy Yevropa tillarida, rus tilidan tashqari qoʻllaniladi.