Mundarija: Kirish I bob. Biologik ketma – ketliklar

Avtomatlashtirilgan zanjir bilan tugaydigan DNK sekvensiyasi natijalariga misol.

Birinchi DNK sekanslari 1970-yillarning boshlarida akademik tadqiqotchilar tomonidan zahmatli usullar asosida olingan ikki o'lchovli xromatografiya. Rivojlanishidan keyin lyuminestsentsiya-va asoslangan ketma-ketlik usullari DNK sekvensori, DNK sekvensiyasi osonlashdi va kattaligi tezroq.

Shaxsning ketma-ketligini aniqlash uchun DNK sekvensiyasidan foydalanish mumkin genlar, kattaroq genetik mintaqalar (ya'ni genlar klasterlari yoki operonlar), to'liq xromosomalar yoki butun genomlar har qanday organizm. DNK sekvensiyasi ham bilvosita ketma-ketlikning eng samarali usuli hisoblanadi RNK yoki oqsillar (ular orqali ochiq o'qish ramkalari). Darhaqiqat, DNK sekvensiyasi ko'plab biologiya va tibbiyot kabi boshqa fanlarning asosiy texnologiyasiga aylandi, sud tibbiyotiva antropologiya.
Molekulyar biologiya
Tartiblashda ishlatiladi molekulyar biologiya genomlarni va ular kodlagan oqsillarni o'rganish. Sekvensiya yordamida olingan ma'lumotlar tadqiqotchilarga genlardagi o'zgarishlarni, kasalliklar va fenotiplar bilan assotsiatsiyalarni aniqlash va dori vositalarining potentsial maqsadlarini aniqlashga imkon beradi.
Evolyutsion biologiya
DNK nasldan naslga o'tish jihatidan axborot makromolekulasi bo'lganligi sababli DNK sekvensiyasi ishlatiladi evolyutsion biologiya turli xil organizmlar qanday bog'liqligini va ular qanday rivojlanganligini o'rganish.
Metagenomika
Maydon metagenomika suv havzasida mavjud bo'lgan organizmlarni aniqlashni o'z ichiga oladi, kanalizatsiya, havodan filtrlangan axloqsizlik, axlat yoki organizmlardan tampon namunalari. Muayyan muhitda qaysi organizmlar mavjudligini bilish tadqiqot uchun juda muhimdir ekologiya, epidemiologiya, mikrobiologiyava boshqa sohalar. Tartiblash tadqiqotchilarga a tarkibida qaysi turdagi mikroblar bo'lishi mumkinligini aniqlashga imkon beradi.
Virusologiya
Ko'pgina viruslar yorug'lik mikroskopida ko'rish uchun juda kichik bo'lgani uchun, sekvensiya virusologiyani aniqlash va o'rganish uchun virusologiyaning asosiy vositalaridan biridir. Virusli genomlar DNK yoki RNK asosida bo'lishi mumkin. RNK viruslari genomlar ketma-ketligi uchun vaqtni sezgirroq, chunki ular klinik namunalarda tezroq parchalanadi. An'anaviy Sanger ketma-ketligi va keyingi avlod ketma-ketligi asosiy va klinik tadqiqotlarda viruslarni ketma-ketligi, shuningdek, paydo bo'layotgan virusli infektsiyalar diagnostikasi uchun ishlatiladi, molekulyar epidemiologiya virusli patogenlar va dori-darmonlarga chidamliligini tekshirish. 2,3 milliondan ortiq noyob virusli sekanslar mavjud GenBank. Yaqinda NGS virusli genomlarni yaratish uchun eng mashhur yondashuv sifatida an'anaviy Sanger-dan oshib ketdi.
Virusli sekvensiya paytida foydalanish mumkin epidemiyalar epidemiyaning kelib chiqishini aniqlash uchun. Davomida 1997 yilda parranda grippi tarqalishi, virusli sekvensiya grippning pastki turi kelib chiqqanligini aniqladi qayta jihozlash o'rtasida bedana va parrandachilik. Bu qonunchilikka olib keldi Gonkong bozorda tirik bedana va parrandalarni birgalikda sotishni taqiqlagan. Virusli sekvensiya shuningdek, a yordamida virusli epidemiya qachon boshlanganligini taxmin qilish uchun ham ishlatilishi mumkin molekulyar soat texnika.
Tibbiy texnik mutaxassislar genetik kasalliklar (yoki nazariy jihatdan to'liq genomlar) ni genetik kasalliklar xavfini aniqlash uchun bemorlardan tartiblashi mumkin. Bu shakl genetik testAmmo ba'zi bir genetik testlar DNK sekvensiyasini o'z ichiga olmaydi, shuningdek, DNK sekvensiyasi ko'proq bakteriyalarni aniqlash uchun foydali bo'lishi mumkin. aniq antibiotiklarni davolash, shu bilan yaratish xavfini kamaytiradi mikroblarga qarshi qarshilik bakteriyalar populyatsiyasida.