Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

Z:ZSPA-1 kompleksining termodinamik stabilizatsiyasi
ÿ[kkal mol -1]
17±3
10±4
-8
(-24)
-
-4,5±0,1
ÿ
0,5±0,05
1,1±0,1
-45±10
(-29±10)
-
-2,5±0,5
-5,0±0,6
3. F5C/S39C (ho'kiz)
1,5±0,1
Entropiya balansi [kal mol-1 K-1]
-
-9,2±0,4
-
5. N21C/A56C (ho'kiz)
3,1±0,3
1,2±0,1
-8,4±0,4
(-74±9)
0. ZSPA-1d
ÿ
-8,0±0,4
-
-
-3,6±1,2
-2,5±1,9
52±7
4. F5C/S41C (ox)
(qizil)
-7,8±0,3
2. F5C/P38C (ho'kiz)
-
-
0,4±0,9
12±4
8±6
Bog'lanish termodinamiÿi
Protein
ÿ
-3,0±0,9
-1±3
-
-4,6±0,8
-6,4±1,5
[µM]
-
-
-8
(-24)
-
0,8±0,05
1,1±0,1
-9,6±0,5
10±4
-7,4±0,4
-7,9±0,4
-1,0±1,4
ÿ[kkal mol -1]
-90±9
-5,0±0,5
0,13±0,02
-
1. D2C/S39C (ox)
(qizil)
-
-
4±5
-
-3,3±0,4
-
-8,2±0,4
-8,0±0,4
T
-
-
-7,4±1,0
11±2 109±7
-4,9±0,9
-2,9±1,0
ÿ
9.1-jadval ZSPA-1 va beshta ZSPA-1 mutantlarining Z domeniga ulanishi uchun termodinamika . Olingan ma'lumotlar
21 ° C da . a ÿC°P , bind x ln(T/385) sifatida hisoblangan, b Yuqorida ko'rsatilgan tenglamadan c Muqobil qiymatlar matnda
muhokama qilinganidek, ÿS°rtdagi noaniqliklarni ifodalaydi, d Dincbas-Renqvist va boshq 2004 yildan olingan ma'lumotlar, ( ox)
oksidlangan holat va (qizil) qaytarilgan holat. Ishdagi 3-jadvaldan
o'zgartirilgan jadval (IV)
54
Hÿbind
Ssolva
Sÿbog'lash
Sconfbc
Kd
Srt
Gÿbog'lash
Sÿbog'lash
c
ÿ[kkal mol -1]
Machine Translated by Google

---

Xulosa va istiqbol
10 Xulosa va istiqbol
bir xil saytni nishonga olish (DeLano va boshq. 2000). Shunday qilib, bu sirtga ega bo'lgan ko'rinadi
katta konformatsion entropiya jazosi bilan yaqinlikni o'ziga xoslikdan ajratish (Tompa)
har bir oqsilning bog'lanish yuzasiga moslashish uchun (DeLano va boshq. 2000). Ushbu bog'lovchi sayt
affibody molekulasi. Ko'pgina o'ziga xos tuzilmagan oqsillar qo'shilish va bog'lanishni ko'rsatadi.
Murakkab hosil bo'lishining asosiy harakatlantiruvchi kuchi, elektrostatik o'zaro ta'sirlar esa uning atrofida halqa hosil qiladi
ZSPA -1 affikorasi barcha shu xususiyatlarga ega va ZSPA-1 qanchalik yaxshi ekanligini ko'rish hayratlanarli.
Z domeniga nisbatan ancha yuqori yaqinlikka ega bo'lgan affibody molekulalari tanlangan.
tahlil.
Fc fragmentining menteÿe mintaqasi to'rtta ma'lum bo'lgan tabiiy oqsillar bilan o'zaro ta'sir qiladi
Z: Fc kompleksidagi kabi domen yon zanjirlari.
affibody molekulasi o'zaro ta'sir qilish uchun tasodifiy sirtdan foydalanadi. Bu tufayli ajablanarli emas edi
boshqa oqsillar va peptidlarni bog'lash uchun ichki xususiyat. Fc-kompleks kristalini taqqoslash
2002). Xuddi shu ta'sirni ZSPA-1 uchun ham ko'rish mumkin, garchi hech qanday tartibga soluvchi sabab bo'lmasa ham. The
kompleks, so'ngra erkin affikorning to'liq biofizik tavsifi. Mutantlar edi
bog'lovchi saytlar yuqori ketma-ketlik identifikatori tufayli o'zini tanib olish xavfini oshiradi
Bu ba'zi vaqtinchalik komplekslar uchun muhim tartibga solish funktsiyasiga ega, deb ishoniladi,
yadro va bir nechta maxsus aloqalarni ta'minlaydi. Z domeni affibody molekulasi bilan bog'lanadi
funktsional sabablar bundan mustasno, tasodifiy peptid kutubxonalari uchun ham kuzatilgan asosiy maqsad edi
umumiy bog'lovchi sayt yordamida, lekin interfeysning turli xil konformatsion qayta tashkil etilishi bilan
Affibody-maqsadli oqsil kompleksining tuzilishi hidrofobik ta'sirni ko'rsatadi
Murakkab hosil bo'lish Z-domenining induktsiyalangan moslashuvini va ZSPA-1 ning birlashtirilgan katlamasini o'z ichiga oladi.
Ushbu natijalar asosida ishlab chiqilgan va ularning bog'lanishga ta'siri termodinamik tomonidan tasdiqlangan
ikki oqsil o'rtasida.
Affikor Fc retseptorlari yuzasiga taqlid qila oladi, bu esa Z ning o'xshash qayta tuzilishini keltirib chiqaradi.
55
Ushbu tezisda taqdim etilgan ish ZSPA-1 affibody: Z domenining tarkibiy tahlilidan iborat.
Bu bog'lovchini tanlashda Fc bilan raqobatbardosh elyusiya va boshqa
tuzilmalar konvergent bog'lanish joyi juda qulay, moslashuvchan va hidrofobik ekanligini ko'rsatdi.
Z ning yaqinligini affibody iskalasida stabillashtiruvchi mutatsiyalarni kiritish orqali oshirish mumkin. Boshqa
Fc bilan kompleksda bo'lgani kabi bir xil sirtni va shunga o'xshash konformatsiyada foydalanish, esa
Machine Translated by Google

---