Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

ZSPA-1 (II, III) affikorining biofizik tavsifi
30 ºC da qayd etilgan spektrlar
C) 1M TMAO bilan ZSPA- 1
8.5-rasm 15N-HSQC
A) ZSPA-1. B) F32Q
qo'shilgan D) W35K
tushuntirish ma'lum bir ikkilamchi qo'llab-quvvatlash uchun aminokislotalarning irsiy xususiyati bo'lishi mumkin
45
affitelning barqarorligi 1 va 2 spirallarning vaqtincha ochilishiga olib keladi. Mutatsion tadqiqotlar
xususiyatlarni mutantlar natijalari bilan tasdiqlash mumkin emas. Boshqa mumkin
tushuntirish.
uning bog'lanmagan holati, NMR ma'lumotlari past bo'lsa ham, barcha spirallarning mavjudligiga mos keladi
eksperimental ma'lumotlarga mos keladigan natijalarni yaratish (III).
yovvoyi turga nisbatan past barqarorlik va erigan globula uchun asosiy hal qiluvchi omil bo'ladi
tuzilishi, buning o'rniga ikkilamchi bashorat dasturlari iloji boricha spiral moyilligini taklif qiladi
Natijalarni umumlashtirish uchun ZSPA-1 erigan globulyar xususiyatlarning bir nechta belgilarini ko'rsatadi
tuzilmalar (Combet va boshq. 2000). Bu bir nechta ikkilamchi bashorat dasturlari tomonidan qo'llab-quvvatlanadi
muammoning yaxshi aniqlangan qatlamga aylanishiga sabab sifatida ortib borayotgan hidrofobiklikni qo'llab-quvvatlamang
ZSPA-1 yuzasida hidrofobik qoldiqlarning ko'payishi haqidagi birinchi faraz
Machine Translated by Google

---

Z:ZSPA-1 kompleksining termodinamik stabilizatsiyasi
9 Z:ZSPA-1 kompleksining termodinamik barqarorlashuvi
ularning bog'lanish interfeysida va Z-domenidagi yon zanjirlarning o'xshash o'zgarishini keltirib chiqaradi.
Z bilan bog'langanda bir xil tanib olish joyi 20 dan 70 nM gacha bo'lgan Kd bilan bog'lanadi (Cedergren et
46
al. 1993 yil; Jendeberg va boshqalar. 1995). Yuqorida aytib o'tilganidek, ikkala kompleks bir nechta o'xshashliklarga ega
Renqvist va boshqalar. 2004). Boshqa tomondan, tabiiy bog'lovchi hamkor IgG (Fc qismi) dan foydalanadi
kompleks ichida aniq belgilangan konformatsiya. Boshqa tomondan, uning erkin shaklida, mahalliy
shakllanishi noqulay entropiya jazosiga olib keladi.
Hozirgacha olingan ma'lumotlar juda murakkab tizimni ko'rsatdi, chunki ZSPA-1 affikor faqat qabul qilingan
ZSPA-1 ni barqarorlashtirish, moslashuvchan tuzilishdan kompleksga qarab yuqori tartibli tuzilishga o'tish
ulanish interfeysi optimal bo'lmasligi mumkin. Bu konformatsiyaning natijasi ham bo'lishi mumkin
xona harorati.
°C) xona haroratida allaqachon ochilgan oqsil (Dincbas-Renqvist va boshq. 2004). Yoki oddiygina,
Masalan, ZSPA-1 ning past termal barqarorligi, bu sezilarli fraktsiyaga olib keladi (pH 5,7 va 30 da ~ 16%)
(ya'ni erigan globul holatida) sezilarli populyatsiya ham butunlay ochilgan shaklda mavjud edi
bu erda 1 va 2 spirallar vaqtinchalik ochilishni boshdan kechirdi. Mahalliy davlatning past barqarorligi tufayli
ZSPA-1 va Z o'rtasidagi suboptimal bog'lanish uchun bir nechta tushuntirishlar bo'lishi mumkin ; uchun
holat eng yaxshi erigan globul xususiyatlariga ega bo'lgan agregatsiyaga moyil protein sifatida tasvirlangan,
9.1 -rasm ZSPA-1 affibodi qabul qilishi mumkin bo'lgan turli holatlarni ko'rsatadigan sxematik chizma .
ZSPA-1 harorat, bufer va pH (Dincbas) ga qarab Kd = 0,5 dan 2 mkM gacha bo'lgan Z bilan bog'lanadi.
Machine Translated by Google

---