Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

ZSPA-1 (II, III) affikorining biofizik tavsifi
8 ZSPA-1 affikorining biofizik tavsifi (II, III)
u hali ham kutubxonadan bog'lovchi sifatida tanlangan bog'lovchi yaqinlik uchun energiya jihatdan noqulay bo'ladi.
Tanlash uchun ishlatiladigan faj-displey kutubxonasi a bilan solishtirganda kichik edi (4 x 107 a'zo).
affibody molekulasi mavjud bo'lishi mumkin, ammo nisbatan kichik kutubxonada mavjud emas edi. Keyinchalik, boshqa
past millimolyar konsentratsiyalarda dimerga to'g'ri keladi va kutilganiga yaqinlashadi
barcha mumkin bo'lgan variantlarning to'liq namunasi (~1017), bu Z domenini "yaxshiroq" bog'lashini ko'rsatadi
oqsil ichidagi barqarorlashtiruvchi kuchlarning muvozanati. Uning xususiyatlariga qaramay, ehtimol
filtrlash va CD tajribalari. Jel filtrlashda elutsiya profili konsentratsiyaga bog'liq,
shakli. Ikkala xususiyat ham o'z-o'zidan birlashuvchi oqsillar uchun xarakterlidir (Hansson va boshq. 2001), bu erda
Z domenining uch spiralli iskala bog'langan holatida to'liq saqlanib qolgan bo'lsa ham
domenning o'zi (II). 58 ta aminokislotadan 13 tasining keng mutatsiyasi juda nozik ta'sir qiladi
39
Keyinchalik tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, ulardan o'ntasi o'z maqsadiga bog'lanishda bevosita ishtirok etadi, Z
bir millimolyar konsentratsiyada yuklanganda ushlab turish hajmi Z domeniga qaraganda. Shuningdek,
tasodifiy o'zgarishiga ruxsat berildi. ZSPA -1da barcha 13 ta qoldiq o'zgargan va strukturaviy ekanligi aniqlandi
juda kichik hajmdagi kutubxona.
Phe-32 asl glutaminga qaytib, nosimmetrik cho'qqiga olib keladi, faqat biroz kichikroq.
ZSPA -1 affikorasi fag kutubxonasidan tanlab olingan, Z ning 13 ta sirt ta'sirlangan aminokislotalaridan iborat.
birgalikda bu ZSPA-1 eng yaxshi bog'lovchi bo'lgani uchun tanlangan degan fikrni kuchli qo'llab-quvvatlaydi
turli o'lchamdagi molekulalar orasidagi tez muvozanat. Qizig'i shundaki, bitta nuqta mutatsiyasi
bu xatti-harakatning sababini aniqlash uchun amalga oshiriladi (III).
kuchliroq Z domen bog'lovchilari haqiqatan ham kattaroq affibody kutubxonalaridan tanlangan. Olingan
mikromolyar konsentratsiyalarda ushlab turish hajmi (8.1a-rasm). Cho'qqi juda assimetrik xususiyatga ega
Kamaytirilgan ushlab turish hajmi kattaroq o'rtacha molekulyar hajmni ko'rsatadi va qoldiq a ni ko'rsatadi
kutilganidan ko'ra dinamik va erigan globula kabi harakat qiladi (II). Keyinchalik chuqurroq tergov o'tkazildi
8.1 Eritilgan globulaning xususiyatlari
ZSPA-1 bu bepul affibody uchun to'g'ri kelmaydi. Dastlabki tizimli tadqiqotlar ZSPA-1 ko'proq ekanligini ko'rsatdi
ZSPA-1 ikkala jeldan ham ko'rinib turibdiki, millimolyar konsentratsiyada o'z-o'zidan assotsiatsiyaga uchraydi
Machine Translated by Google

---