Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

Protein-oqsil o'zaro ta'siri
elektrostatik o'zaro ta'sirlar va IL-2 ni chuqurroq bo'shliqlarni ta'minlaydigan konformatsiyada ushlab turish va
Protein barqarorligini saqlashda ishtirok etadigan bir xil o'zaro ta'sirlar ham vositachilik qiladi
IL-2Ra bilan solishtirganda kontaktlarning uchdan bir qismi, ular deyarli bir xil yaqinlikka ega. Optimallashtirilgan
oqsil-oqsil o'zaro ta'siri. Aniq farq shundaki, oqsil-oqsil o'zaro ta'siri bo'lishi mumkin
oqsil bog'lanishning kuchli tomonlarini anglatadi, uning o'ziga xosligi esa bog'lanishning cheklanishini anglatadi
IL-2 ni IL-2a retseptorlari bilan bir xil issiq nuqta yordamida bog'laydigan retseptordan mustaqil ravishda
lekin IL-2 ni boshqa konformatsiyada tuting. Shunga qaramay, kichik molekula faqat bittasini ishlatadi
issiqlik sig'imi ÿC°p,bog'lanishning o'zgarishini ham aniqlash mumkin. Proteinning boshqasiga yaqinligi
shakllanishi (Doyl 1997). Agar bog'lanish entalpiyalari turli haroratlar uchun aniqlansa, u holda
issiq nuqtalarda kislotalar bilan birga hududdagi konformativ moslashuvchanlikni oshiradi.
yozilishi mumkin:
Ka = [ M1M2]/[ M1][ M2] = kon/koff = 1/ Kd
boshqa oqsillar va peptidlar. Ehtimol, bunga ma'lum aminokislotalarning yuqori chastotasi ta'sir qiladi
hidratsiya / suvsizlanish yoki konformatsion o'zgarishlar yoki bog'lanishdan entalpik hissalar
21
mos ravishda.
Aftidan, issiq nuqtalar merosxo'rlikka ega, bu ularni bog'lash uchun jozibador qiladi
bog'lanish mexanizmini tushunish, masalan, entropik ta'sirlardan kelib chiqadi
doimiy Kd va assotsiatsiya va dissotsiatsiya uchun tezlik konstantalari, kon va koff bilan bog'liq
samarali bog'lash.
assotsiatsiya konstantasini ta'minlash o'zaro ta'sirning termodinamik tavsifini ham beradi
O'zaro ta'sir kuchi assotsiatsiya konstantasi Ka yoki dissotsiatsiya bilan tavsiflanadi
M1 + M2 ÿ M1M2
O'zaro ta'sir qiluvchi oqsillarning bog'langan va erkin holatlari o'rtasidagi energiya farqi. Ga qo'shimcha sifatida
interfeysda kamroq ko'milgan suv bilan yaxshiroq qadoqlash ko'proq sabab bo'lishi mumkin
biri ikkinchisidan afzal ligand. M1 va M2 birikmalari orasidagi assotsiatsiya muvozanati
entalpiya ham, entropiya ham yoqadi. Assotsiatsiya konstantasi erkin bilan belgilanadi
4.6 Yaqinlik va o'ziga xoslik
Machine Translated by Google

---