Mirzo Ulug’bek nomidagi O’zbekiston Milliy Universiteti Biologiya fakulteti Biologiya yo’nalishi 20-01 guruh talabalari Rajabova Dilshoda va Qodiraliyeva Nozimaxonning Genomika fanidan

6. Yirtilgan kuchaytirilgan polimorfik ketma-ketlik (CAPS):

• 6. Yirtilgan kuchaytirilgan polimorfik ketma-ketlik (CAPS):
• CAPS belgisi 1993 yilda Konieczny va Ausubel tomonidan genetik xaritalash uchun tasvirlangan.
• CAPS RFLP bilan bir xil va PCR-RFLP deb ataladi.
• CAPS markerlari texnikasi polimorfizm hosil qilish uchun monomorf PCR mahsulotini hazm qilishga asoslangan.
• U RFLP ni ko'rsatish uchun endonukleaza cheklash orqali hazm bo'ladigan kuchaytirilgan DNK fragmentlaridan foydalanadi.
• Ovqat hazm qilish mahsulotlari elektroforez jarayonida etidiy bromid bilan bo'yash orqali ularning differentsial migratsiya tezligi uchun tekshiriladi.
• CAPS primeri genomik ma'lumotlar banki yoki cDNK ketma-ketligidagi mavjud ketma-ketlik ma'lumotlari asosida ishlab chiqilishi mumkin.

Ahamiyati:

• Bu markerlar tabiatan kodominant bo'lib, lokalizatsiyaga xosdir.
• U genlarni xaritalash uchun ishlatiladi

7. Ifodali ketma-ket teglar (ESTlar):

• 7. Ifodali ketma-ket teglar (ESTlar):
• ESTlar tasodifiy cDNK klonlarining qisman ketma-ketligi bilan sintez qilingan molekulyar markerlardir.
• cDNK sintez qilingandan so'ng, ikki xil turdagi ESTni yaratish uchun ikkala uchidan (3' yoki 5' uchidan) bir necha yuz nukleotidlar (500-800bp) ketma-ketlashtiriladi.
• cDNKning 5' uchining ketma-ketligi odatda oqsilni kodlaydigan 5' EST hosil qiladi.
• Ushbu hududlar turlar bo'ylab saqlanib qoladi va genlar oilasida deyarli o'zgarmaydi.
• cDNKning 3' uchining ketma-ketligi kodlanmagan yoki tarjima qilinmagan hududlar (UTR) bo'lgan 3' EST hosil qiladi va u turlar orasida kamroq saqlanadi.
• Shuning uchun ESTlar cDNK ning pastki ketma-ketligi bo'lib, butun cDNK uchun tegni ifodalaydi.
• Ahamiyati:
• EST butun genom ketma-ketligi va qiziqish genini o'rganish uchun ishlatiladi.
• Bunga qo'shimcha ravishda, u qiziqish genini klonlash va gen xaritalash uchun ishlatiladi.