Mirzo Ulug’bek nomidagi O’zbekiston Milliy Universiteti Biologiya fakulteti Biologiya yo’nalishi 20-01 guruh talabalari Rajabova Dilshoda va Qodiraliyeva Nozimaxonning Genomika fanidan

3. Kuchaytirilgan fragment uzunligi polimorfizmi (AFLP):

• 3. Kuchaytirilgan fragment uzunligi polimorfizmi (AFLP):
• Zabeau va Vos 1993 yilda AFLP texnikasini ixtiro qildilar.
• AFLP dastlab KeyGene tomonidan 1990 yilda ishlab chiqilgan.
• Bu barmoq izlarini olish uchun PCR asosidagi texnikadir. U PCR va RFLP ni ham o'z ichiga oladi.
• AFLP ning asosi tanlangan bo'laklarni kuchaytirish, so'ngra o'ziga xos organizmning butun genomik DNKsini hazm qilishni cheklashdir.
• AFLP uchun qadamlar quyidagicha:
• DNK ekstraktsiyasi va uni cheklash hazm qilish, so'ngra qisqa adapter ketma-ketliklari bilan bog'lash.
• Cheklangan fragmentlarni PCR orqali kuchaytirish
• Jel elektroforez yoki PAGE natijalarini tahlil qilish, keyin avtoradiografiya.
• Ahamiyati:
• AFLP har qanday organizm uchun DNK ning oldindan ketma-ketligini talab qilmasdan tezda marker fragmentlarini yaratish qobiliyatiga ega.
• Bundan tashqari, u RAPD va ISSR (oddiy ketma-ketlikni takrorlash) ga nisbatan boshlang'ich shablon DNKning faqat kichik bo'laklariga muhtoj va ancha yuqori takrorlanish qobiliyatiga ega.
• AFLP asosan ekinlarni yaxshilash dasturlari, turli xil ekin turlarining ota-onasi va genomik talqini uchun ishlatiladi.
• Kamchiliklari:
• AFLP katta DNK namunalarini talab qiladi va tozalashni talab qiladi

4. Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) belgilari:

• 4. Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) belgilari:
• Oddiy ketma-ketlikni takrorlash (ISSR) usuli PCRga asoslangan usuldir.
• Bu haqda Ztetikiewicz va boshqalar xabar berdi. 1994 yilda.
• ISSR markerlari mikrosatellit yadro mintaqalaridan tashkil topgan yagona primer yordamida 2 ta oʻxshash mikrosatellitlar takroriy hududlari orasidagi DNK segmentlarini PCR orqali kuchaytirish orqali ishlab chiqilgan.
• Astarlar odatda 16-25 bp uzunlikda va biriktirilmagan yoki 3' yoki 5' uchida biriktirilishi mumkin.
• Ahamiyati:
• Bu RAPD texnikasi kabi oddiy, tez va tejamkor va astar uzunligi uzun bo'lgani uchun RAPD bilan solishtirganda yuqori takrorlanish qobiliyatiga ega.
• ISSR tahlil qilish uchun genom haqida oldingi bilimlarni talab qilmaydi va juda polimorfik markerdir.
• ISSR genetik xilma-xillikni aniqlash, filogenetik tahlil qilish, navlarning yaqinligini aniqlash va o'simliklardagi somaklonal o'zgarishlarni aniqlash uchun ishlatiladi.
• ISSR ning oddiy tuzilishi tufayli u genlarni xaritalash, genlarni belgilash, shtammni aniq identifikatsiyalash va ota-onalar tomonidan tan olinishini o'rganish uchun qo'llaniladi.
• Kamchiliklari:
• ISSR ko'p joylashuv xususiyati tufayli bir xil o'lchamdagi fragmentlarning kamroq takrorlanishi va homologiyasi yo'q.