Microsoft Word Conf-селекция rtf

 
ПРОТЕОМНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ДЛЯ ОЦЕНКИ СЕЛЕКЦИОННОГО МАТЕРИАЛА И 
РАЗРАБОТКИ БЕЛКОВЫХ МАРКЕРОВ 
 
Мавлонов Г.Т., Шерматов Ш.Э. 
Центр Геномики и Биоинформатики АН РУз, МСВХ и Ассоциации «Узпахтасаноат»
 
Протеомный подход широко используется для характристики селекционного материала [1], 
разработки белковых [2,3] и метаболитных маркеров ген-модифицированных организмов [4]. В данной 
работе проводили оптимизацию идентификации белков различных видов хлопчатника с целью сравнения 
селекционного материала и поиска маркеров хозяйственно-ценных свойств. При оценке потенциального 
значения белка в качестве молекулярного маркера хозяйственной важности линий, сортов 
руководствовались результатами сравнительного двумерного электрофореза [5] сумарного белка из 
исследуемых селекционных материалов хлопчатника.
Материалы и методы
.
Объектами исследования были выбраны семена, проростки и семядольные листья хлопчатника: G. 
arboreum L. (диплоидный геном A
2
, линия 2-160), G. hirsutum L. (аллотетраплоидный геном [AD]
1
, сорт C-
6524) и G. longicalyx L. (диплоидный геном F).
Экстракцию белка из исследуемых объектов проводили «фенольным» методом оптимизированным 
для хлопчатника, количественное определение белка проводили твердофазным вариантом метода 
Бредфорда [6]. Цифровую обработку сканированных изображений двумерного электрофореза проводили 
с помощью Alfa Imager (Bio-Rad, США) и программы Alfa-Ease-FC
TM
. Количественную характеристику 
отдельных пятен проводили с помощью программ Melanie-7.05 (SIB, Швейцария), Quantity One
R
(Bio-Rad, 
США). Выявленные в двумерных электрофореграммах белковые пятна, которые представляли интерес, 
вырезали скальпелем и после трипсинолиза в кусочках геля полученные пептиды секвенировали 
жидкостной хроматографией – масс-спектрометрией на приборе Micromass Q-TOF2, тандемная масс-
спектрометрия контролировалас с помощью программы MassLynx Max-Ent3 (Micromass, Англия). Поиск 
аналогов секвенированных пептидов проводили в базе данных протеомного сервера Швейцарского 
института биоинформатики http://www.expasy.org с применением алгоритма BLAST-X.