|
Таблица 1. Изоляты, использованные в данном исследовании
Изоляты
Локация
Морфологи-
ческая
идентифи-
кация
Идентификац
ии
на основе
молекулярног
о анализа
Последователь-
ности с лучшим
совпадением
Идентич-
ность (%)
Fus22
Андижанская
обл,
Шахристанский
рай.
Fusarium
oxysporum
Fusarium
oxysporum
f. sp. phaseoli
DQ016286
99%
Fus30
Андижанская
обл, Асакинский
рай.
Fusarium
oxysporum f.
sp. vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
DQ837695
99%
Fus34
Кашкадаринска
я обл.
Fusarium
oxysporum
f .sp.
vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
DQ837695
99%
Fus37
Хорезмская обл.
Шавватский р-
н.
Fusarium
solani
Fusarium solani
JF740858 96%
Fov316r1
Ташкентская
обл.
Fusarium
oxysporum f.
sp. vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum ,
race 3
EU246573.1 100%
Fov316r2
Ташкентская
обл.
Fusarium
oxysporum f.
sp. vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum ,
race 3
EU246573.1 100%
Fov316r3
Ташкентская
обл.
Fusarium
oxysporum f.
sp. vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum ,
race 3
EU246573.1 100%
Fo319r1
Наманганская
обл.
Fusarium
solani
Fusarium solani
JF740846
99%
Fov328r1
Патогенетичес-
кая коллекция
ИГиЭБР
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
DQ837695
99%
Fov347
Сырдарьинская
обл.
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum ,
race 3
EU246573.1 100%
496
Кашкадаринска
я обл.
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum
DQ837695
99%
509
Ташкентская
обл.
Зангатинский
рай.
Fusarium
oxysporum
Fusarium
oxysporum
f. sp. phaseoli
DQ016286
98%
527
Ташкентская
обл. Ангрен
Fusarium
oxysporum
Fusarium
oxysporum f.sp
vasinfectum,race
3
EU246573.1 100%
547
Андижанская
обл.
Исбаканский
рай.
Fusarium
oxysporum
Fusarium
oxysporum
f. sp. phaseoli
DQ016286
99%
295
Результаты и их обсуждение.
Данные секвенирования 14 изолятов рода Fusarium, по трем
однокопийным генам BT, EF-1 и rDNA были сопоставлены с генетическим банком NCBI. Анализ
сопоставления (blast) подтвердил, что наши изоляты относятся к Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum,
Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and Fusarium solani. Полученные данные коррелировали с данными
филогенетического анализа, который разделил все образцы на три группы (Рис. 1).
Рис 1. Молекулярная филогения изолятов, созданная на основе комбинированного анализа,
по трем генам EF-1, β-tubulin, rDNA
Первая группа была представлена Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, которая состояла из 6
кладов. Первый клад отмечен красным и представлен американским изолятом Fov3 (известная раса 3), а
также узбекскими изолятами Fov316r1, Fov316r2, Fov316r3, Fov347, также относящимися к расе 3. Второй
клад (желтый цвет) представлен образцами Fov326r1, FUS30, FUS34, 496, которые сгруппировались
вместе с группой “А” Fov110. Третий клад представлен группой расы 1,2 и 6. Четвертый, пятый и шестой
клады представлены отдельными представителями раса 4, Fov124 группа “B” и группы “С’,
представленной Fov112.
Вторая группа представлена образцами 509, 547, FUS22, относящимися к Fusarium oxysporum f. sp.
phaseoli. Третья группа включала в себя два изолята FUS37 и Fov 319r1, относящихся к Fusarium solani
Согласно полученным данным, можно сказать о высокой точности метода, позволяющего
идентифицировать и отличать не только виды, но и близкородственные специализированные формы и
расы патогенов. Применение данного метода существенно облегчит идентификацию патогенов рода
Fusarium, широко распространенных в нашей республике.
Использованная литература:
1. Elias K.S. and Schneider R.W. Genetic diversity within and among races and vegetative compatibility
groups of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici as determined by isozyme analysis // Phytopathology. 1992.
Vol.82. P.1421-1427.
2. Elias K.S., Zamir D., Lichtman-pleban T., and Katan T. Population structure of Fusarium oxysporum f.
sp. lycopersici: Restriction fragment length polymorphisms provide genetic evidence that vegetative compatibility
group is an indicator of evolutionary origin // Mol. Plant-Microbe Interact. 1993. Vol.6. P.565-572.
3. Kamel A. Abd-Elsalam, Moawad R. Omar, Quirico Migheli, Hergard I. Nirenberg. 2004. Genetic
characterization of Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum isolates by random amplification of polymorphic DNA
(RAPD) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) // Journal of Plant Diseases and Protection. 111
(6), 534–544, 2004, ISSN 0340-8159.
4. Wang P.H., Lo H.S, Yeh Y. Identification of F.o.cucumerinum and F.o.luffae by RAPD-generated
DNA probes // Lett. Appl. Microb. 2001. Vol.33. P.397-401.
5. White, T. J., T. Burns, S. Lee, and J. Taylor. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal
ribosomal RNA genes for phylogenetics // In M.A. Innis, D. H. Gelfand, J. J. Sninsky, and T. J. White (eds.), PCR
Protocols. Academic Press, San Diego, CA, USA. P. 315-322.
6. Марупов А, Бойжигитов Ф, Иргашева Н. Ғўзанинг вилт касаллиги // AGRO ILM 2(22). 2012. С.
39-40.
296
Do'stlaringiz bilan baham: |
