Microsoft Word Conf-селекция rtf

Результаты и их обсуждение
. При сравнительной протеомике важно выбрать полипептид – 
«внутренный маркер» для исследуемых пар, желательно с постоянной координатой и интенсивностью в 
двумерной электрофореграмме. В случае сравнения белков сухих семян таковым маркером был выбран 
один из центральных пятень (№ 1 по рис.1). Трипсинолиз и Internal Q-TOF MS/MS секвинирование 
выбранных пятен с последующей идентификацией белка по протеомной базе данных (
www.expasy.org
) 
показало, что №1 является актином, 2 – главным латексным белком хлопчатника и 3 – не имел 
достоверной гомологии, хотя имеет один фрагмент гомологичный к фрагменту актина. (табл.).
В последующих экспериментах по двумерному электрофорезу пятна 1 и 2 служили в качестве 
внутренного стандарта при оценке других пятень, в частности № 2 для белков корешков и 
корневых/флоэмных выпотов. 

---

301
 
 
Рис.1. 
Двумерный электрофорез фракции фенол-растворимых белков семян G.arboreum (левая часть геля) 
и G.hirsutum (правая часть). Цифры на верхней части рисунка – значение рН в геле, цифры у круглого 
конца стрелок – номера пятен (соответствуют обозначениям в таблице). 
Таблица. 
Q-TOF MS/MS секвинирование и идентификация белков семян двух видов хлопчатника 
№
( рис. 
1) 
Последовательность фрагментов 
Номер белка в 
базе EMBL, 
название 
M, kDa 
(теор/эксп) 
pI 
Значение 
«E» 
1 VAPEEHPVLLAEVPLNPK 
FPSIVGRPR 
Q7XZK0
Актин 
41/49 6.5 
0.001 
2 VQCDLHEGEFGTPGVVICWR 
GSIVHWTLDYEK 
VEVMDHEK 
Q7X953 
Латексный белок 
14.6/18.0 5.9 
0.005 
3 SVELPDGQVITIGNEK 
VLLTEAPLDPK 
Q7XZK0
фраг. актина 
41/9 9.2 
1.8 
Для оценки физиологического или хозяйственного значения белка в составе протеома полезным 
оказывается характеристика количественного изменения этого белка под воздействием различных 
факторов. В эксперименте удобно пользоваться для этой цели элиситорами. В нашей работе мы 
использовали известные элиситоры метиловые эфиры: жасмоновой кислоты (MJA) и салициловой 
кислоты (MSA). Результаты показали, что ингибиторы трипсина листьев хлопчатника положительно 
контролируется метил-жасмонатом (рис.2) и негативно салицилатом .