Mavzu: Oqsillarni o’rganishda foydalaniladigan fizik va kimyoviy usullar

Oqsillarning birlamchi tuzilishi, peptid bog‘lari

Oqsillar (polipeptidlar) peptid bog‘lari orqali bog‘langan aminokislotalar tashkil topgan biopolimerlardan ekanligi. Peptid bog‘lari tadqiqotlarining tarixi. Peptid bog‘larining kimyoviy tuzilishi. Sis-,trans-izomeriya. Peptid bog‘larining stexiometrik parametrlari, sterik cheklanish xolatlari. Ramachandran kartalari. Oqsillaming regulyar va noregulyar tuzilishi.

Oqsillarning ikkilamchi tuzilishi

Oqsillar ikkilamchi tuzilishni vujudga kelishida vodorod bog‘larining roli. Oqsillar ikkilamchi tuzilishining eng muhim elementi muntazamspiral xoli 5 ekanligi. Oqsillaming spiral xolda o‘ralishida asosan dipol momentlarining shakllanishi va aminokislota qoldig‘ining yon radikallarini katta rol o‘ynashi. Spiral tuzilishning ko‘rinishi. Tuzilish: Zanjirlaming joylanish qabatida paralel va antiparalel ko‘rinishlar. Oqsil molekulasi satxida sirtmoq (petlya)ni lokalizatsiyasi. Shpilka (to‘g‘nog‘ich) oqsil molekulasi ikkilamchi tuzilishining elementlaridan biri ekanligi.

Oqsillarning uchlamchi tuzilishi

Oqsil molekulasining fazoviy tuzilishi turg‘unligi. Oqsillar sintezida uchlamchi tuzilishning muayyan shaklga kelishi. Gidrofob yadro. Oqsil molekulasining formasi, kompaktliligi uning dinamikasi. Ba’zi oqsillar va peptidlaming uchlamchi tuzilishi turg‘unligida disulfid bog‘larining roli. Oqsil globulasining tarkibida ikkilamchi tuzilish elementlarining mavjudligi va o‘zaro bog‘liqligi. Oqsil molekulasining uchlamchi tuzilishni awldan aytib berish uchun aminokislotalar ketma-ket

Oqsillarning to‘rtlamchi tuzilishi

To‘rtlamchi tuzilishning stexiometriyasi va geometriyasi. To‘rtlamchi tuzilishni turg‘unlashtirishda subbirliklami o‘zaro ta’sirini axamiyati. Oqsil molekulasi to‘rtlamchi tuzilishini tadqiqot qilish metodlari. To’rtlamchi strukturaning tadqiqot usullari. Oqsil molekulasi to‘rtlamchi tuzilishining biologik axamiyati. Oqsillaming asosiy sinflari.

a-Spiral oqsillar