Ma’ruza materiallari 1-Mavzu: Kirish. Biologik kimyo kursining maqsad va vazifalari, metodlari, tarixi reja

Fermentlarning tuzilishi

Fermentlar tuzilishiga ko’ra ikkita guruhga bo’linadi.

1. Oddiy oqsillardan, ya`ni faqat -aminokislotalardan tashkil topgan fermentlar bir komponentli fermentlar deb ataladi.

2. Agar fermentlar murakkab oqsillardan tashkil topgan bo’lsa, ya`ni ularning tarkibida aminokislotalardan tashqari, boshqa birikmalar uchrasa, ularni ikki komponentli fermentlar deb ataladi. Uning oqsil qismini apoferment, oqsil emas qismini koferment deb ataladi.

Kofermentlar - fermentativ reaksiyalarda bevosita ishtirok etadi. Kofermentlar-vitaminli va vitamin bo’lmagan kofermentlarga bo’linadi.

Vitaminli kofermentlarga quyidagilar kiradi: tiamin (TMF, TDF, TTF); flavin (FMN, FAD); pantoten (K₀A, difosfo-K₀A); NAD⁺, NADF⁺; biotin; karnitin.

Vitamin bo’lmagan kofermentlarga quyidagilar kiradi: nukleotidlar; monosaxaridlarning fosfatli birikmalari; metalloporfirinlar va hakozolar. Masalan: nikotinamidli kofermentlarning (NAD⁺, NADH) katalitik faol guruh sifatida tarkibidagi nikotinamid guruhi ishtirok etadi. Reaksiya mexanizmini quyidagicha ifodalash mumkin:

oksidlangan shakli qaytarilgan shakli

Fermentlarning faol markazi. Fermentativ reaksiyalarda ishtirok etadigan substrat molekulalari ularni katalizlovchi ferment molekulalariga nisbatan birmuncha kichik bo’lganligi sababli ferment bilan substratning o’zaro ta`sirida ferment molekulalarining hamma qismi emas, balki faol markaz deb ataladigan ma`lum qismigina ishtirok etadi. Demak, faol markaz bu ferment molekulalarining substratni biriktiruvchi qismidir. Fermentlarning katalitik faolligi va spetsifikligi ham Shu faol markazga bog`liq bo’ladi. Bir komponentli fermentlarning faol markazi sifatida ularning molekulasini tashkil qiluvchi polipeptid zanjirlarining yon radikallaridagi aminokislotalarning funksional guruhlari va polipeptid zanjirlardagi ba`zi bir aminokislotalar tarkibidagi funksional guruhlar ya`ni tsisteinning -SH guruhi, serinning -OH guruhi, dikarbon aminokislotalarning karboksil guruhlari, lizinning amino guruhi, triptofanning indol guruhlari faoliyat ko’rsatadi. Fermentning faol markazi polipeptid zanjirning uchlamchi struktura hosil bo’lishi tufayli vujudga keladi. Bunda polipeptid zanjirning turli tomonlarida joylashgan aminokislotalar qoldig`i bir-biriga yaqin kelib, faol markazni tashkil qilishda ishtirok etadi.

Fermentlarning faol markazi ular molekulasining juda kam qismini tashkil qiladi.

Bir nechta omillar ferment kataliziga javobgar bo’ladi. Agar boshqa bir mexanizmlar haqida gapiradigan bo’lsak faol markaz qismi katalizatorli guruhlarni taminlash uchun xizmat qiladi. Ba’zi fermentlar faoliyatida ana shu guruhlar qatnashishi mumkin va bunda amino kislotalar protonlarni qabul qiladi.Bunda masalan, ovqat xazm qilish sistemasida ferment barcha kerakli birliklarni ichaklarga o’tkazadi va undagi umumiy kislota hisobiga kovalent katalizatorlarga ega bo’ladi.Ferment o’tkazuvchanligi natijasida kerakli komplekslar faoliyati stabillashadi va jarayonda energiya faoliyati yuqori darajada ko’tariladi.Fermentlar inson organizmi uchun juda kerakli va energiya almashinuvi va oqsil faoliyatida ham asosiy bo’lgan reaksiyalar hisoblanib, barcha jarayon farmentning faol markazi hisobiga amalga oshiriladi⁴⁰