Кимёда компьютер моделлаштириш нима?

19. Молекуляр механика усулларида боғланмаган атомлар орасидаги таъсирлашув турлари. Мисоллар келтиринг.
MM usuli kvant-kimyoviy usullarga nisbatan juda tezkor usul sanaladi. Lekin, aniqligi yarim empirik va noempirik usullarnikiga nisbatan past. MM usullarida N, O kabi atomlaridagi bog’lanmagan elektron juft ta’sirlashuvlari to’liq inobatga olinmagan. Valent burchak, torsion burchak, elektrostatik tasirlashuv, vander-vals tasirlashuv inobatga olingan . Tautomerlar, konformerlar va boshqa birikmalarning umumiy energiyasi hisobida tajriba bilan mos tushadigan ma’lumotlar olingan. Ayrim MM usullari atom zaryadlari va hosil bo’lish issiqligini hisoblashga parametrlangan. Keyingi vaqtlarda MM usulining tezkorligi asosida kvant-kimyo va MM usullari birlashtirgan, gibrid usullar (QM/MM) yaratish ustida izlanishlar olib borilmoqda. Bunga misol qilib Morokumaning ONIOM usulini misol qilib keltirish mumkin. Metalloorganik birikmalarni hisoblash usullari cheklangan. Molekulyar mexanika usullaridan faqat UFF, Ghemical va mm+ metalloorganik hamda kompleks birikmalarni modellashtirishga mo‘ljallangan. MNDO, AM1 va PM3 yarim empirik usullari faqat bir nechta metallarni tutgan organik birikmalarni hisoblay oladi:
Misol: gossipolni aminlar bn hosil qilgan shiff asoslarini metallar bn hosil qilgan suframolekulyar kompleksi o’zaro Valent burchak, torsion burchak, elektrostatik tasirlashuv, vander-vals tasirlashuv hisobiga bog’langan.

20. MAKROMOLEKULALARNI HISOBLASHQA QO’LLANILADIGAN MM USULLARI

BIO+ kuch maydoni CHARM kuch maydonining rivojlantirilgani bb makromolekulalarni modellash un yaratilgan bio+ kuch maydonining parametrlari asosan aminokislotalarni modellash uchun yaroqli. Parametrlashtirish ikkita imkoniyatidan birini select parameter set punkti yordamida tanlash m.n
BIO+ kuch maydonining potensial funksiyalarining analitik ko’rinishi AMBER kuch maydoninikiga o’xshash uning o’ziga xosligi shundaki bo’linmagan electron juftlarni hisoblamaydi va vodorod bog’iga javob beradigan had yo’q. bu kamchiliklar keyinchalik mualliflar tomonidan b artaraf etildi.

20.