7 Ma’ruza Epigenetika va epigenomika

№7 Ma’ruza
Epigenetika va epigenomika.
Reja:

1. 
   Epigenom va epigenetika haqida tushincha. «Odam epigenomi» loyixasi, genlar ishlashini boshqarish turlari (transkriptsiya, post-transkripsiya, post-translyasiya darajasida), epigenetik modifikatsiya turlari, DNKni metillashni o‘rganish usullari, genom uchastkalarini metillash, genlarni metillash, CpG orolchalari,
   
2. 
   «Epigenetik soatlar», genom DNKni bisulfitli ishlash, bisulfit sekvenslash, Metilspetsifik PZR (MSP), gistonlarni modifikatsiyalash turlari (atsetillash, metillash, fosforillash, ubikvitinillash va boshqalar).
   

Tayanch iboralar: Epigenom, epigenetika, «Odam epigenomi» loyixasi, transkriptsiya, post-transkripsiya, post-translyasiya, epigenetik modifikatsiya, DNKni metillash, CpG orolchalari, «Epigenetik soatlar», genom DNKni bisulfitli ishlash, bisulfit sekvenslash, Metilspetsifik PZR (MSP), gistonlarni modifikatsiyalash (atsetillash, metillash, fosforillash, ubikvitinillash va boshqalar).
1. Epigenom va epigenetika haqida tushincha. «Odam epigenomi» loyixasi, genlar ishlashini boshqarish turlari (transkriptsiya, post-transkripsiya, post-translyasiya darajasida), epigenetik modifikatsiya turlari, DNKni metillashni o‘rganish usullari, genom uchastkalarini metillash, genlarni metillash, CpG orolchalari,
Epigenomika - molekulyar biologiyaning yuqori o'tkazuvchanlik usullaridan foydalangan holda hujayraning genetik materialining (epigenom [en]) epigenetik modifikatsiyalari yig'indisini o'rganadigan bo'limi. Epigenomika genomika va proteomikaga o'xshaydi, ular mos ravishda hujayraning genomi va proteomini o'rganadi [1].
Epigenetik modifikatsiyalar DNK nukleotidlar ketma-ketligini o'zgartirmasdan, gen ekspressiyasiga ta'sir qiluvchi hujayra DNKsi va gistonlarining qaytariladigan kovalent kimyoviy modifikatsiyalaridir [2]. DNK va gistonlarning kovalent modifikatsiyalarini kiritish mexanizmlari va ularning gen ekspressiyasiga ta'siri epigenetikaning o'rganish predmeti bo'lib, epigenomika natijani - epigenetik modifikatsiyalarni va ularning genom bo'ylab tarqalishini ChIP-seq, bisulfit sekvensiyasi kabi molekulyar usullar yordamida o'rganadi. , va boshqalar.
Eng ko'p o'rganilgan epigenetik modifikatsiyalar DNK metilatsiyasi va giston modifikatsiyalaridir. Epigenomni global darajada o'rganish nisbatan yaqinda genomni o'rganishning yuqori samarali usullarini ishlab chiqish tufayli mumkin bo'ldi.
Epigenetika (qadimgi yunoncha ἐpi- biror narsa ustida boʻlish yoki biror narsaga joylashishni bildiruvchi prefiks) genetika boʻlimi. Epigenetika hujayra o'sishi va bo'linishi davrida gen faolligining irsiy o'zgarishlarini o'rganadi (Epigenetik meros) - DNKdagi nukleotidlar ketma-ketligini o'zgartirmaydigan mexanizmlar tufayli oqsil sintezidagi o'zgarishlar. Epigenetik o'zgarishlar somatik hujayralarning bir qator mitotik bo'linishlarida saqlanib qoladi va keyingi avlodlarga ham o'tishi mumkin. Protein sintezining regulyatorlari (genetik ketma-ketliklarning faolligi) - DNK metilatsiyasi va demetilatsiyasi, giston atsetilatsiyasi va deasetilatsiyasi, transkripsiya omillarining fosforillanishi va defosforilatsiyasi va boshqa hujayra ichidagi mexanizmlar [1].
Epigenom - bu genlarning faolligini tartibga soluvchi, lekin DNKning birlamchi tuzilishini o'zgartirmaydigan molekulyar belgilar to'plamidir [2].