Filogenetik daraxt evolyutsion daraxt, hayot daraxti

---

Filogenetik daraxt
Filogenetik daraxt
( 
evolyutsion daraxt
, 
hayot daraxti
) - umumiy ajdodga ega bo'lgan turli
turlar
yoki boshqa mavjudotlar o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarni aks ettiruvchi 
daraxt .
Filogenetik
daraxtning uchlari uch sinfga bo'linadi: barglar, tugunlar va (ko'pi bitta) ildiz. Barglar -
terminal cho'qqilari, ya'ni har birining bir chetidan iborat; har bir barg qandaydir 
tirik organizmni
(yoki evolyutsiyaga uchragan boshqa ob'ektni, masalan, 
oqsil domenini
) ifodalaydi. Har bir
tugun evolyutsion hodisani ifodalaydi: ajdodlar turining ikki yoki undan ko'pga bo'linishi,
Filogenetik daraxt har uch sohadagi
 organizmlarning umumiy kelib chiqishini ko'rsatadi . 
Bakteriyalar
 ko'k rangda,
eukariotlar
  qizil rangda, 
archaea
  yashil rangda. 
Ba'zi turlarning
 tegishli pozitsiyalari daraxt atrofida ko'rsatilgan.

---

keyinchalik ular mustaqil ravishda rivojlanadi. Ildiz ko'rib chiqilayotgan barcha ob'ektlarning
umumiy ajdodini ifodalaydi. Filogenetik daraxtning qirralari "novdalar" deb ataladi.
"Daraxt" g'oyasi hayotning dastlabki qarashlarida oddiy shakllardan murakkab shakllarga o'tish
jarayoni sifatida paydo bo'lgan. Zamonaviy evolyutsion biologlar evolyutsiyani tasvirlash uchun
daraxtlardan foydalanishda davom etmoqdalar, chunki ular tirik organizmlar o'rtasidagi
munosabatlarni aniq ko'rsatib beradi.
rRNK genlari
 uchun nazariy jihatdan ildiz otgan daraxt har uch 
sohada
 organizmlarning umumiy kelib chiqishini
ko'rsatadi : 
bakteriyalar
 , 
arxeya
 , 
ökaryotlar
 .
Filogenetik daraxtlarning turlari

---

Ildizli
daraxt tanlangan cho'qqi - ildizni o'z ichiga olgan daraxtdir. Ildizli daraxtni yo'naltirilgan
grafik deb hisoblash mumkin, chunki u tabiiy yo'nalishga ega - ildizdan barglargacha. Ildizli
daraxtning har bir tuguni daraxt tagidagi barglarning oxirgi umumiy ajdodiga to'g'ri keladi.
Rasmda tirik organizmlarning uch domenli tizimiga ko'ra rangli ildizli filogenetik daraxt
ko'rsatilgan 
[2]
.
Ildizsiz
daraxt ildizni o'z ichiga olmaydi va umumiy ajdodning taxminiy pozitsiyasisiz barglar
munosabatlarini aks ettiradi. Ildizsiz daraxtlarni ko'rib chiqish zarurati, ko'pincha evolyutsiya
yo'nalishidan ko'ra tugunlar orasidagi aloqalarni tiklash osonroq ekanligidan kelib chiqadi.
Rasmda ildiz olmagan filogenetik daraxt ko'rsatilgan 
[3]
. Ildizsiz daraxtni ildiz otgan daraxtga
aylantirishning eng ishonchli usuli (buning uchun tugunlardan birini ildiz deb e'lon qilish yoki
novdalardan birini ildizdan chiqadigan ikkita novdaga bo'lish kerak) "tashqi guruh" dan
foydalanishdir. Turlar - bizni qiziqtirgan turlar to'plamiga etarlicha yaqin (turlarning birlashtirilgan
to'plami uchun daraxt topologiyasini ishonchli tiklash uchun), lekin ayni paytda alohida guruh
bo'lishi aniq. Ba'zida ildizning holatini o'rganilayotgan ob'ektlarning (turlar, oqsillar va boshqalar)
tabiati haqidagi qo'shimcha ma'lumotlarga asoslanib taxmin qilish mumkin.
Ildizli va ildizsiz filogenetik daraxt