Toshmuxamedova muqaddamning bioinformatika fanidan

DDBJ MA'LUMOTLAR 
2015-yilda ddbj (3826 marta; 75,3%) da to'g'ridan-to'g'ri taqdim etilgan 
nukleotidlar haqidagi ma'lumotlarning aksariyati yapon tadqiqot guruhlari 
tomonidan amalga oshirildi, qolganlari Erondan (238 marta; 4,7%), Hindiston 
(188 marta; 3,7%), Tailanddan olingan. (154 marta, 3,0%), Xitoy (111 marta, 
2,2%) va boshqa mamlakatlar va hududlar (563 marta, 11,1%). 2015 yilning 
iyun oyidan 2016 yilning may oyigacha ddbj davriy nashri 10 317 427 ta yozuv 
va 20 978 161 726 juft bazaga oshdi. Davriy nashr to'liq gen shotgun (WGS), 
shotgun transkriptom Assemblies (TSA) ning katta qismlari yoki uchinchi 
tomon ma'lumotlar fayllari (TPA) ni o'z ichiga olmaydi. DDBJ doimiy ravishda 
Yaponiya patent idorasi (JPO, http://www.jpo.go.jp ) va Koreya intellektual 
mulk idoralari (KIPO, http://www.kipo.go. o'tish: saytda harakatlanish, qidiruv 
YAPV o'z ma'lumotlarini DDBJ ga to'g'ridan-to'g'ri topshirdi, KVIS esa Koreya 
bioinformatsion markazi bilan kelishuv ma'lumotlarini uzatdi. DDBJ 19,20% 
yozuvlar va insd ning asosiy nukleotid ma'lumotlariga qo'shilgan bazalar 
juftlarining umumiy sonining 12,84% ni tashkil etdi.

---

Yozuvlar sonining batafsil statistik taqsimoti ddbj bosh sahifasida 
ko'rsatilgan (http://www.ddbj.nig.ac.jp/breakdown_stats/prop_ent-e.html).
Yuqoridagi ma'lumotlarga qo'shimcha ravishda, DDBJ jami 11 909 516 
WGS (1694 genom), 1 505 087 contig/constructed (CON) yozuvlari, 1 313 171 
tsa yozuvlari (18 loyiha), 786 TPA yozuvlari, 6374 TPA-WGS yozuvlari (bir 
genom) va 1272 TPA yozuvlari-2016 yil 27 may holatiga CON 2015-dan iyun 
2016-yilgacha bo'lgan davrda 23 974-dan keyingi avlod tartiblash ma'lumotlari 
DRA-da qayd etildi. Ddbj ketma-ketlik ma'lumotlar bazasidan chiqarilgan 
mashhur ma'lumotlar to'plamlari jadvalda keltirilgan.Jadval Xususan, ko'plab 
tadqiqotchilar kutgan Rays Annotation Project loyihasi doirasida amalga 
oshirilgan izoh bilan mos yozuvlar guruch genomining ketma-ketligi haqidagi 
so'nggi ma'lumotlarni qabul qildik va e'lon qildik. 
2015-yilning iyunidan 2016-yilning may oyigacha Yaponiyaning DNK 
ma'lumotlar banki (DBJ) serial ma'lumotlar bazalaridan chiqarilgan ajoyib 
ma'lumotlar to'plamlari ro'yxati. 
Ma'lumotlar turi 
Organizm 
Izohli 
ketma-
ketliklar 
uchun 
kirish 
raqamlari 
(yozuvlar soni) 
Xom o'qish uchun 
kirish raqamlari 
genom 
Turp ( Raphanus 
sativus 
sinf 
Aokubi W ) 
WGS: 
BAOO01000001-
BAOO01072909 
72 909 yozuvlar) 
Ishkala 
son: 
DF196826-
DF236948 
(40 
123 yozuvlar) 
ДРР012610-
ДРР012624
Transkript 
Turp ( Raphanus n/d 
ДРР010353-

---

sativus 
sinf 
Aokubi W ) 
ДРР010355 
ДРР014743-
ДРР014781
Soya( Glycine 
max sinf Enrei)
n/d 
ДРР031435