The objectives of covid-19 surveillance are to: • monitor sars-cov-2 incidence and covid-19 morbidity and mortality

Nucleic acid amplification tests
In the initial stages of the epidemic, nucleic acid amplification test or NAAT (e.g. 
RT
-qPCR ) was the only WHO-recommended 
assay for confirmation of a case. 
RT
-qPCR and other NAAT assays can be manual or have varying degrees of automation that 
simplify use. For the purposes of surveillance, however, all NAAT tests are considered equal. More information can be found in 
Diagnostic testing for SARS-CoV-2
25
.
•
Antigen-detecting rapid diagnostic tests (Ag-RDTs) 
In addition to NAAT tests, which remain the reference standard, Ag-RDTs can serve as a complementary method for diagnostic 
confirmation given certain circumstances as detailed in the case definition. The minimum performance requirements for Ag-RDTs 
is ≥ 80% sensitivity and ≥ 97% specificity, as established through a formal process of target product profile (TPPs) developm
ent 
for priority SARS-CoV-2 diagnostics. 
This technology for SARS-CoV-2 detection is much simpler and faster to perform than nucleic acid amplification tests like 
RT
-
qPCR and can be conducted outside of clinical and laboratory settings, by 
trained individuals
26
.
 Although these Ag-RDTs are less 
sensitive than NAAT, they offer rapid, inexpensive, and early detection of the most infectious SARS-CoV-2 infections in places 
where NAAT testing is not available or results are not timely. However, when there is no transmission or low transmission, the 
positive predictive value of Ag-RDTs will be low, and NAATs are preferable as first-line testing or for confirmation of Ag-RDT 
positive results. 
Further information is available in 
Antigen detection in the diagnosis of SARS-CoV-2 infection using rapid immunoassays
27
and 
use of antigen detection rapid diagnostic testing
28
.
•