Сборник содержит материалы научной мультиконференции «Биотех- нология медицине будущего»

Исследование вирома мелких млекопитающих,
обитающих в лесопарковых зонах г. Новосибирска
Бабкин И.В.
1
, Тикунов А.Ю.
1
, Ткачев С.Е.
1
, Панов В.В.
2
, Кабилов М.Р.
1
, Тикунова Н.В.
1
1
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН,
Новосибирск, Россия 
2
Институт систематики и экологии животных СО РАН, Новосибирск, Россия
Известно, что мелкие грызуны являются основным резервуаром различных зоо- 
нозных инфекций. В работе проведено изучение кишечных виромов широко распро-
страненных видов полевок – красной полевки и полёвки-экономки методом массового 
параллельного секвенирования и выявлены последовательности ДНК и РНК-содер-
жащих вирусов. 
Основная доля изученных вирусных последовательностей представлена бактерио-
фагами; были обнаружены представители семейств 
Myoviridae, podoviridae
и Siphoviridae 
порядка 
Caudovirales
, а также значительное количество последовательностей, отнесенное 
к семейству 
Microviridae
. Установлены полные геномы 65 различных вирусов семейства 
Microviridae
, около половины из них относятся к подсемейству
 Gokushovirinae
, часть 
к подсемейству 
Alpavirinae
, остальные к ранее неописанным ранее подсемействам 
семейства 
Microviridae
. На основе анализа генной синтении и филогении предложены 
новые таксономические группы семейства 
Microviridae
. В геноме двух неклассифи-
цированных изученных бактериофагов был обнаружен ген пептидазы M15, ранее он 
был открыт в геномах некоторых gokushovirus и alpavirus. Впервые в геномах вирусов 
семейства 
Microviridae
были найдены гены N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase и lytic 
transglycosylase, что свидетельствует о большом разнообразии генов лизинов в геномах 
этих вирусов. Это может быть объяснено широким распространением горизонтального 
переноса генов между этими вирусами и их бактериальными хозяевами. 
Другая многочисленная группа исследованных вирусных последовательностей 
отнесена к различным семействам эукариотических CRESS вирусов млекопитающих, 
насекомых и растений. Определены полные геномы 14 различных CRESS вирусов.
У разных грызунов выявлены высокогомологичные по нуклеотидной последова-
тельности CRESS вирусов, отличающиеся только наличием делеций/инсерций. 
Большинство исследованных последовательностей CRESS вирусов уникальны, и воз- 
можно относятся к новым вирусным семействам. Остальные выявленные вирусные 
последовательности отнесены к семействам 
parvoviridae, Adenoviridae
и неклассифи-
цированным представителям порядка 
picornavirales
. Все эти последовательности также 
значительно отличаются от известных вирусов. Можно заключить, что виром диких 
грызунов, обитающих вблизи человеческих поселений, требует дальнейшего изучения.

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
145