Сборник содержит материалы научной мультиконференции «Биотех- нология медицине будущего»

Зависимость эффективности удаления повреждений ДНК в составе 
кластера от их взаимного расположения
Лукьянчикова Н.В., Петрусева И.О., Ломзов А.А., Лаврик О.И.
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН,
Новосибирск, Россия
Эксцизионная Репарация Нуклеотидов — один из важнейших путей репарации 
ДНК в клетках высших эукариот. Этот процесс обеспечивает удаление широкого 
спектра повреждений, вызывающих значительные нарушения регулярной структуры 
ДНК, таких как объемные химические модификации и УФ-повреждения. Возник-
новение кластеров из двух и более повреждений в пределах одного или двух витков 
спирали ДНК может приводить к затруднению процесса репарации [1]. Для изучения 
взаимодействий белков ЭРН с ДНК, содержащими объемное повреждение в составе 
кластера с AP-сайтом в одной или обеих цепях дуплекса, были выбраны модельные 
повреждения: ненуклеозидная вставка, содержащая остаток флуоресцеина (nFlu, 
N-[6-(дипивалоил-5(6)-флуоресцеинил-карбамоил)гексаноил]-О1-(4,4'-диметокситри-
тил)-О2-[(диизопропил-амино)(2-циано-этокси)фосфино]-3-амино-1,2-пропандиол)
и вставка на основе фосфодиэфира диэтиленгликоля (DEG), аналог АР-сайта [2].
Сродство к ДНК сенсора объемных повреждений ХРС несколько повышалось, если 
расстояние между повреждениями в противоположных цепях было меньше 6 п.н. В то же
время, уровень ЭРН-катализируемой специфической эксцизии nFlu-содержащего фраг- 
мента был резко снижен, если повреждения в противоположных цепях разделяло менее 
4 п.н. При расположении DEG и nFlu в одной цепи на расстоянии 5 нт эксцизия nFlu-
содержащего фрагмента происходила так же эффективно, как в случае одиночного 
повреждения. 
Полученные данные в совокупности с результатами выполненного компьютерного 
моделирования ДНК, содержащих модельные повреждения DEG и nFlu, позволяют 
проанализировать процесс репарации кластерных повреждений ДНК в клетках млеко-
питающих и оценить зависимость скорости удаления объемного повреждения в составе 
кластера от структуры и взаимного расположения повреждений. 
1. Georgakilas A., O'Neill p., Stewart R. Induction and repair of clustered DNA lesions: what 
do we know so far? // Radiat Res. - 2013. - 180(1), p. 100-9.
2. Kutuzov M., Ilina E., Sukhanova M., pyshnaya I., pyshnyi D., др. всего 7 человек. Inter-
action of poly(ADp-ribose) polymerase 1 with Apurinic/Apyrimidinic Sites within Clus-
tered DNA Damage // Biochemistry (Moscow). - 2011. - V.76 (1), p. 147-156.
Исследование было выполнено при финансовой поддержке гранта РФФИ № 19-04-00018.

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
130