|
[Bu rasmda] Retikulotsitlar sitoplazmada to'q ko'k nuqta va egri chiziqli tuzilmalarni (retikulum) o'z ichiga oladi. Ribosomal RNKning to'rga o'xshash tarmog'i mikroskop ostida ma'lum dog'lar bilan ko'rinadigan bo'lgani uchun ular retikulotsitlar deb atashgan.
Surat krediti: Ed Uthman, MD
Bakteriyada bitta hujayradan iborat Escherichia coli (E. coli) 15000 ta ribosomani o'z ichiga oladi va bu hujayraning umumiy massasining to'rtdan bir qismini tashkil qiladi.
MRNK tarjimasi paytida ribosoma dinamikasining max-plus modeli
APA
Standart
Garvard
Vankuver
Muallif
BIBTEX
RIS
Tadqiqot natijalari: jurnalga qo'shilish ›Maqola› peer-review
T1 - mRNK tarjimasi paytida ribosoma dinamikasining max-plus modeli
AU - Brakli, Kristofer A.
N1 - Ushbu jurnal uchun pullik ochiq kirish opsiyasi mavjud. Muallifning ixtiyoriy depoziti Institutlarning ochiq ilmiy veb-saytida va bosmaxonadan oldingi serverlarida. Mualliflar muallifining ixtiyoriy depoziti institutlarning ochiq ilmiy veb-saytida chop etishdan keyin ruxsat etilgan, shu jumladan Moliyaviy organ, institutsional va hukumat vakolati bo‘yicha Institutsional saqlash depoziti. Repozitariy va nashriyot o'rtasida alohida kelishuv mavjud Depozitga qo'shiladigan bayonotni o'rnatish Nashr etilgan manba tan olinishi kerak Jurnalning bosh sahifasiga yoki maqolalarning DOI nashriyot versiyasi/PDF dan foydalanish mumkin emas. maqolalar 12
months
dan keyin PubMed Central'ga yuboriladi. Mavzuga asoslangan omborlarga saqlashi kerak bo'lgan mualliflar homiylik opsiyasidan ham foydalanishlari mumkin.
N2 - Biz hujayra oqsillarini ishlab chiqarishning tarjima bosqichining dinamikasini ko'rib chiqamiz, bunda ribosomalar mRNK zanjiri bo'ylab bir yo'nalishda harakatlanadi va ular ketayotganda aminokislotalar zanjirlarini yaratadi. Biz tizimni vaqtli hodisalar grafigi yordamida tasvirlaymiz - cheklovlarni qondirishi kerak bo'lgan diskret hodisalarni o'rganish uchun foydali bo'lgan Petri tarmog'i sinfi. Modelning deterministik versiyasini tavsiflash uchun biz max-plus algebrasidan foydalanamiz, bu erda cheklovlar ma'lum bir vaqtda ma'lum bir kodonni bir nechta ribosoma o'qishiga to'sqinlik qiluvchi sterik effektlarni va turli tRNKlarning mavjudligi bilan bog'liq kechikishlarni aks ettiradi. Biz mRNKda oqsil ishlab chiqarish tezligi va ribosomalarning zichligini hisoblaymiz va bu analitik natijalar va deterministik modelning raqamli simulyatsiyalari o'rtasida, hatto heterojen mRNKlar bo'lsa ham, aniq kelishuvni topamiz.
AB - Biz hujayra oqsillarini ishlab chiqarishning tarjima bosqichining dinamikasini ko'rib chiqamiz, bunda ribosomalar mRNK zanjiri bo'ylab bir yo'nalishda harakatlanib, aminokislotalar zanjirlarini quradilar. Biz tizimni vaqtli hodisalar grafigi yordamida tasvirlaymiz - cheklovlarni qondirishi kerak bo'lgan diskret hodisalarni o'rganish uchun foydali bo'lgan Petri tarmog'i sinfi. Modelning deterministik versiyasini tavsiflash uchun biz max-plus algebrasidan foydalanamiz, bu erda cheklovlar ma'lum bir vaqtda ma'lum bir kodonni bir nechta ribosoma o'qishiga to'sqinlik qiluvchi sterik effektlarni va turli tRNKlarning mavjudligi bilan bog'liq kechikishlarni aks ettiradi. Biz mRNKda oqsil ishlab chiqarish tezligi va ribosomalarning zichligini hisoblaymiz va bu analitik natijalar va deterministik modelning raqamli simulyatsiyalari o'rtasida, hatto heterojen mRNKlar bo'lsa ham, aniq kelishuvni topamiz.
Ribosoma kirish va chiqishlari?
Protein sintezida RNKning tripletlari ribosomada aminokislotalarni to'g'ridan-to'g'ri tanlash uchun iste'mol qilinadi / baholanadi. Men bu jarayon RNK zanjiri uchun halokatli yoki yo'qligini yoki ikkalasini ham bilishni xohlayman.
Umuman yo'q. Ribosoma mRNKni skanerlaydi va triplet kod va tRNK-aminokislotalar yordamida oqsil sintezini muvofiqlashtiradi. Ribosoma mRNKning bir hududini o'tgandan so'ng, boshqa ribosoma o'sha mRNKdan ushbu oqsilning boshqa nusxasini hosil qiladi. Shu tarzda biz bitta mRNK dan oqsillarning ko'p nusxalarini yaratishimiz mumkin.
Translyatsiya paytida bitta ribosoma bo'lgan mRNK monosoma, ko'p ribosoma bo'lgan mRNK esa polisoma deb ataladi.
Ya'ni, agar ribosomalar mRNKda bloklangan yoki to'xtab qolsa, ular RNK parchalanishi deb ataladigan jarayonlarni boshlashi mumkin, masalan, bema'ni vositachi RNK parchalanishi yoki Staufen vositachiligidagi RNK parchalanishi.
Ribosomalar mRNKni o'z-o'zidan buzmaydi, aksincha ularning mRNK bo'ylab oldinga siljishga qodir emasligi degradatsiyani keltirib chiqaradi.
Do'stlaringiz bilan baham: |
