Peptidlarning sintezi. Peptidlarni sintez qilishda qo‘llaniladigan kimyoviy va fermentativ usullar

2-amaliy mashg’ulot: Peptidlar sintez uslublari.

REJA:

• REJA:
• 1.Peptidlarning sintezi.
• 2.Peptidlarni sintez qilishda qo‘llaniladigan kimyoviy va fermentativ usullar.

Kimyoviy sintez

• Kimyoviy sintez
• Qisqa oqsillarni organik sintez usullari, masalan, kimyoviy bog'lanish yordamida kimyoviy usulda sintez qilish mumkin. Ko'pincha peptidning kimyoviy sintezi ribosomalardagi biosintezdan farqli o'laroq, C oxiridan N-oxirigacha bo'ladi. Kimyoviy sintez usuli qisqa immunogen peptidlarni (epitoplar) ishlab chiqaradi, ular keyinchalik antikorlar yoki gibridomalarni olish uchun hayvonlarga yuboriladi. Bundan tashqari, ushbu usul ma'lum fermentlarning ingibitorlarini olish uchun ham qo'llaniladi. Kimyoviy sintez odatdagi oqsillarda topilmaydigan aminokislotalar qoldiqlarini, masalan, ularning yon zanjirlariga yopishtirilgan flüoresan yorliqlari bo'lganlarni kiritishga imkon beradi. Oqsillarni sintez qilishning kimyoviy usullari bir qator cheklovlarga ega: ular oqsil uzunligi 300 dan oshiq aminokislotalar qoldiqlari bilan samarasiz, sun'iy ravishda sintezlangan oqsillar tartibsiz uchinchi darajali tuzilishga ega bo'lishi mumkin va xarakterli post-translatsiya o'zgarishlaridan iborat

Umumjahon usul: ribosomal sintez

• Umumjahon usul: ribosomal sintez
• Proteinlar genlarda kodlangan ma'lumotlarga asoslanib tirik organizmlar aminokislotalardan sintezlanadi. Har bir oqsil aminokislotalar qoldiqlarining noyob ketma-ketligidan iborat bo'lib, ular oqsilni kodlaydigan genning nukleotid ketma-ketligi bilan aniqlanadi. Genetik kod bu DNK nukleotidlar ketma-ketligini (RNK orqali) aminokislotalar polipeptid zanjiriga o'tkazish usulidir. Ushbu kod RNKning kodon deb ataladigan trinukleotid qismlarining va oqsil tarkibiga kiradigan ba'zi aminokislotalarning mosligini aniqlaydi: masalan, AUG nukleotidlari ketma-ketligi metioninga to'g'ri keladi. DNK to'rt turdagi nukleotidlardan iborat bo'lganligi sababli, mumkin bo'lgan kodonlarning umumiy soni 64 ta va oqsillarda 20 ta aminokislotalar ishlatilganligi sababli ko'plab aminokislotalar bittadan ko'p kodon bilan belgilanadi. Uch kodon ahamiyatsiz: ular polipeptid zanjiri sintezi uchun to'xtash signallari bo'lib xizmat qiladi va tugatish kodonlari yoki to'xtash kodonlari deb ataladi.