Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

ZSPA-1 (II, III) affikorining biofizik tavsifi
8.2 Strukturaviy va dinamik tadqiqotlar
Namunaga 1-1,6 M TMAO qo'shilishi 15N-HSQC ko'rinishini sezilarli darajada yaxshilagan.
Baskakov 2001 yil; Celinski va Scholtz 2002). Osmolit trimetilamin N
ZSPA-1 ning murakkab shaklida mavjud bo'lgan NOE diapazoni kuzatildi, bu esa ni yanada qo'llab-quvvatlaydi
oqsilning barqarorligiga ta'sir qilishi ajablanarli. Shunga qaramay, u fag displeyining 107 variantidan A proteiniga
bog'lovchi sifatida tanlangan, ammo buklanish kutubxonasi o'rtasidagi bog'liq hodisalarga
qaramay.
ZSPA-1 uchun qiziqarli muqobil deb hisoblanadi (Baskakov va Bolen, 1998; Bolen va
oksidi (TMAO) affibody molekulasini barqarorlashtiradi, strukturaviy tadqiqotlar uchun muqobil yo'l ochildi.
ZSPA -1(III) holati. Shuningdek, tipik a-spiral yadroviy Overhauser effekti (NOE) naqsh va uzoq
58 ta pozitsiyadan 13 tasini o'z ichiga olgan keng mutagenezni hisobga olsak, bu ko'rinmasligi mumkin.
osmolitlar deb ataladigan birikmalar oqsillarning buklangan holatiga barqarorlashtiruvchi ta'sir ko'rsatishi mumkin, bu edi
etishmayotgan bo'lsa, natija erigan globulada uchta spiral mavjudligiga to'g'ri keldi
Z:ZSPA-1 kompleksidagi tuzilishga o'xshaydi . Bundan spirallik pasaygan degan xulosaga keldi
Yadroning yomon qadoqlanishi 1 va 2 spirallardagi qoldiqlar dinamikasini oshirishga olib keladi,
43
davlat. Chunki bir nechta hisobotlar bir guruh kichik, tabiiy, organik ekanligini ko'rsatdi
ikkilamchi bashorat (Wishart va Sykes 1994). Ba'zi kimyoviy o'zgarishlarni hisobga olgan holda
o'zaro konformatsiyalar. Dinamikaning miqdori barqaror holatdagi NOE, eng yuqori intensivlik / integral nisbatlar
va to'yinganlik uzatish tajribalari bilan o'rganildi. Bu tajribalar
NMR spektrlarining past sifati hozirgi kunga qadar ZSPA-1 ning boshqa strukturaviy tadqiqotlariga to'sqinlik qildi.
magistral atomlar (N, HN, Ca, Ha, C´) uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan ikkilamchi siljishlarni ta'minladi.
bitta konformatsiyadan kelib chiqadi yoki ular o'rtacha bir necha tezlikni ifodalasa
ota-ona Z-domeni bilan solishtirganda, bu affitelning xatti-harakati.
takomillashtirish ZSPA-1 ning 15N-HSQC ni qisman belgilashga imkon berdi. ning topshirilishi
1 va 2 spirallarning ochilishi. Biroq NOE ulanishlarini aniqlash mumkin emas.
Tadqiqotlar molekulyar darajada mutatsiyalar nima uchun bunga olib kelganini tushunishga qaratilgan
Dispersiya o'zgarmagan holda aniqroq rezonanslar bilan ko'rilgan NMR spektri (8.5c-rasm). The
har uch spiralning mavjudligi va erigan globulaning uchinchi darajali tuzilishi haqidagi tushuncha
ZSPA-1 bitta spiralning yo'qligi natijasi emas, buning o'rniga natijalar vaqtinchalik bilan mos keladi.
va bog'lanish, ehtimol, bog'lanish yaqinligiga salbiy hissa qo'shadi. Strukturaviy
Machine Translated by Google

---