To'liq genomlar. Ushbu texnologiyalarning paydo bo'lishi tezligi va yakunlanish tezligi tez sur'atlarda kuchayishiga olib keldi genomlarni tartiblashtirish bo'yicha loyihalar. A ning birinchi to'liq genom ketma-ketligi eukaryotik organelle, inson mitoxondriya (16.568 bp, taxminan 16.6 kb [kilobase]), 1981 yilda xabar qilingan, va birinchi xloroplast genomlar 1986 yilda kuzatilgan. 1992 yilda birinchi ökaryotik xromosoma, pivo xamirturushining III xromosomasi Saccharomyces cerevisiae (315 kb) ketma-ketligi aniqlandi. Birinchi navbatda ketma-ket tuzilgan erkin tirik organizm Gemofilus grippi (1,8 Mb [megabaza]) 1995 yilda. Keyingi yil laboratoriyalarning tadqiqotchilari konsortsiumi Shimoliy Amerika, Evropava Yaponiya eukaryotning birinchi to'liq genom ketma-ketligi tugaganligini e'lon qildi, S. cerevisiae (12.1 Mb), va shu vaqtdan boshlab genomlar ketma-ketligi jadal o'sib boruvchi tempda davom ettirilmoqda. 2011 yil oktyabr holatiga ko'ra, to'liq ketma-ketliklar mavjud: 2,719 viruslar, 1,115 arxey va bakteriyalarva 36 eukaryotlar, shundan taxminan yarmi qo'ziqorinlar.
4-rasm. genom loyihalari soni
Texnologik takomillashtirish ketma-ketlik narxini pasaytirishda davom etar ekan, genom loyihalari soni ortdi. (A) 1995 yildan beri genomlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazalarining eksponent o'sishi. (B) Bir million bazani ketma-ketlashtirish uchun AQSh dollaridagi (AQSh dollaridagi) narx. (C) Jurnalning o'zgargan shkalasi bo'yicha 3000 Mb (odamga teng) genomni ketma-ketlashtirish uchun AQSh dollaridagi xarajatlar.
Genomlari to'liq sekvensiya qilingan mikroorganizmlarning aksariyati muammoli patogenlar, kabi Gemofilus grippimikroorganizmlarning xilma-xilligi bilan taqqoslaganda ularning filogenetik tarqalishida aniq tanqidga uchradi. Boshqa ketma-ket turlarning ko'plari tanlangan, chunki ular yaxshi o'rganilgan model organizmlar yoki yaxshi model bo'lishga va'da berishgan. Xamirturush (Saccharomyces cerevisiae) azaldan muhim bo'lgan model organizm uchun eukaryotik hujayra, meva uchib ketganda Drosophila melanogaster juda muhim vosita bo'lgan (xususan, molekulyargacha bo'lgan davrda) genetika). Qurt Caenorhabditis elegans uchun tez-tez ishlatiladigan oddiy modeldir ko'p hujayrali organizmlar. Zebrafish Brachydanio rerio molekulyar darajadagi ko'plab rivojlanish tadqiqotlari va o'simlik uchun ishlatiladi Arabidopsis talianasi gullaydigan o'simliklar uchun namunali organizmdir. The Yapon pufferfish (Takifugu rubripes) va dog'li yashil puferfish (Tetraodon nigroviridis) juda oz bo'lgan kichik va ixcham genomlari tufayli qiziqarli kodlamaydigan DNK ko'p turlarga nisbatan. Sutemizuvchilar iti (Kanis tanish), jigarrang kalamush (Rattus norvegicus), sichqoncha (Muskul mushak) va shimpanze (Pan trogloditlari) barchasi tibbiyot tadqiqotlarida muhim model hayvonlardir.
Ning qo'pol loyihasi inson genomi tomonidan yakunlandi Inson genomining loyihasi 2001 yil boshida ko'plab shov-shuvlarni keltirib chiqardi. 2003 yilda yakunlangan ushbu loyiha butun bir genomni ma'lum bir odam uchun ketma-ketligini ajratib ko'rsatdi va 2007 yilga kelib ushbu ketma-ketlik "tugatilgan" deb e'lon qilindi (20000 bazada bitta xato va barcha xromosomalar yig'ilgan). O'shandan beri o'tgan yillarda ko'plab boshqa shaxslarning genomlari, qisman 1000 genom loyihasi2012 yil oktyabr oyida 1092 genomning sekvensiyasini e'lon qildi. Ushbu loyihaning yakunlanishi keskin samaraliroq ketma-ketlik texnologiyalarini ishlab chiqish natijasida amalga oshirildi va juda muhim majburiyatlarni talab qildi bioinformatika yirik xalqaro hamkorlik manbalari. Inson genomik ma'lumotlarini doimiy ravishda tahlil qilish insoniyat jamiyatlari uchun chuqur siyosiy va ijtimoiy ta'sirga ega.
Do'stlaringiz bilan baham: |