Bog'liq Hosilbekov Jasurbek va Umirzakov Samandarning Genomika fanidan tayyorlagan mustaqil ishi
Molekulyar filogeniyaning ko'plab shakllari ketma-ketlikni tartibga solish bilan chambarchas bog'liq va turli turlarning genomlarida paydo bo'ladigan homolog genlar o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarni tasniflash uchun ishlatiladigan filogenetik daraxtlarni qurish va tozalashda keng qo'llaniladi. Hisoblash usulida qurilgan filogenetik daraxt tahlil qilinayotgan turlar orasidagi tarixiy munosabatlarni ifodalovchi evolyutsion daraxtni mukammal tarzda takrorlashi dargumon. Tarixiy turlar daraxti, shuningdek, ushbu turga tegishli bo'lgan individual homolog genlarning tarixiy daraxtidan farq qilishi mumkin.
Molekulyar filogeniyaning ko'plab shakllari ketma-ketlikni tartibga solish bilan chambarchas bog'liq va turli turlarning genomlarida paydo bo'ladigan homolog genlar o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarni tasniflash uchun ishlatiladigan filogenetik daraxtlarni qurish va tozalashda keng qo'llaniladi. Hisoblash usulida qurilgan filogenetik daraxt tahlil qilinayotgan turlar orasidagi tarixiy munosabatlarni ifodalovchi evolyutsion daraxtni mukammal tarzda takrorlashi dargumon. Tarixiy turlar daraxti, shuningdek, ushbu turga tegishli bo'lgan individual homolog genlarning tarixiy daraxtidan farq qilishi mumkin.
Filogenetik daraxtlar va tarmoqlarning turlari Hisoblash filogeniyasi natijasida hosil bo'lgan filogenetik daraxtlar kirish ma'lumotlari va ishlatiladigan algoritmga qarab ildiz otishi yoki ildiz otishi mumkin emas. Ildiz daraxti - bu eng so'nggi umumiy ajdodni (MRCA) aniq belgilaydigan yo'naltirilgan grafik va [iqtibos keltirish kerak] - odatda kirishda aks ettirilmaydigan kirish ketma-ketligi. Genetik masofa o'lchovlari barg tugunlari sifatida kirish ketma-ketligini olish va gipotetik MRCAda ildizdan masofa genetik masofaga mutanosib bo'lgan daraxtni chizish uchun ishlatilishi mumkin. Ildizni aniqlash uchun kiritilgan ma'lumotlar odatda qiziqishlar ketma-ketligidan uzoq bo'lgan bir yoki bir nechta "tashqi guruhlar" ni o'z ichiga olishi kerak.
Filogenetik daraxtlar va tarmoqlarning turlari Hisoblash filogeniyasi natijasida hosil bo'lgan filogenetik daraxtlar kirish ma'lumotlari va ishlatiladigan algoritmga qarab ildiz otishi yoki ildiz otishi mumkin emas. Ildiz daraxti - bu eng so'nggi umumiy ajdodni (MRCA) aniq belgilaydigan yo'naltirilgan grafik va [iqtibos keltirish kerak] - odatda kirishda aks ettirilmaydigan kirish ketma-ketligi. Genetik masofa o'lchovlari barg tugunlari sifatida kirish ketma-ketligini olish va gipotetik MRCAda ildizdan masofa genetik masofaga mutanosib bo'lgan daraxtni chizish uchun ishlatilishi mumkin. Ildizni aniqlash uchun kiritilgan ma'lumotlar odatda qiziqishlar ketma-ketligidan uzoq bo'lgan bir yoki bir nechta "tashqi guruhlar" ni o'z ichiga olishi kerak.