Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa, Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa

Fitch-Margoliash usuli Fitch-Margoliash usuli genetik masofaga asoslangan klasterlash uchun eng kichik kvadratlar usulidan foydalanadi. Daraxt qurish jarayonida uzoqdan bogʻlangan ketma-ketliklar orasidagi masofani oʻlchashdagi noaniqlikni toʻgʻirlash uchun yaqindan bogʻliq ketma-ketliklarga koʻproq ogʻirlik beriladi. Algoritmga kirish sifatida foydalaniladigan masofa bir-biriga yaqin va uzoqdan bog'langan guruhlar o'rtasidagi hisoblash munosabatlarida katta artefaktlarning oldini olish uchun normallashtirilishi kerak. Shu tarzda hisoblangan masofalar chiziqli bo'lishi kerak. Masofa uchun chiziqlilik mezoni shundan iboratki, ikkita alohida filial uchun filial uzunligining kutilayotgan qiymati ikki masofa yig'indisining kutilgan qiymatiga teng bo'lishi kerak. Bu xususiyat biologik ketma-ketliklarga faqat individual saytlar teskari mutatsiya ehtimoli uchun tuzatilgan taqdirdagina qo'llaniladi. Ushbu modifikatsiya DNK evolyutsiyasining Jukes-Cantor modelidan olinganlar kabi almashtirish matritsalari yordamida amalga oshiriladi.

• Fitch-Margoliash usuli Fitch-Margoliash usuli genetik masofaga asoslangan klasterlash uchun eng kichik kvadratlar usulidan foydalanadi. Daraxt qurish jarayonida uzoqdan bogʻlangan ketma-ketliklar orasidagi masofani oʻlchashdagi noaniqlikni toʻgʻirlash uchun yaqindan bogʻliq ketma-ketliklarga koʻproq ogʻirlik beriladi. Algoritmga kirish sifatida foydalaniladigan masofa bir-biriga yaqin va uzoqdan bog'langan guruhlar o'rtasidagi hisoblash munosabatlarida katta artefaktlarning oldini olish uchun normallashtirilishi kerak. Shu tarzda hisoblangan masofalar chiziqli bo'lishi kerak. Masofa uchun chiziqlilik mezoni shundan iboratki, ikkita alohida filial uchun filial uzunligining kutilayotgan qiymati ikki masofa yig'indisining kutilgan qiymatiga teng bo'lishi kerak. Bu xususiyat biologik ketma-ketliklarga faqat individual saytlar teskari mutatsiya ehtimoli uchun tuzatilgan taqdirdagina qo'llaniladi. Ushbu modifikatsiya DNK evolyutsiyasining Jukes-Cantor modelidan olinganlar kabi almashtirish matritsalari yordamida amalga oshiriladi.
• Masofaviy tuzatish faqat evolyutsiya tezligi filialdan filialga o'zgarib tursagina kerak bo'ladi. Algoritmning yana bir modifikatsiyasi, ayniqsa fokuslangan masofalar uchun foydali boʻlishi mumkin (oʻlchov konsentratsiyasi fenomeni va oʻlchovlarning laʼnati boʻyicha hisobot): da tavsiflangan oʻzgartirishlar algoritmning samaradorligi va mustahkamligini oshirishga qaratilgan. Ushbu masofalarga qo'llaniladigan eng kichik kvadratlar mezoni qo'shni birlashma usulidan ko'ra aniqroq, ammo unchalik samarali emas. Ma'lumotlar to'plamidagi bir-biriga chambarchas bog'liq bo'lgan ko'plab ketma-ketliklarda yuzaga keladigan masofalar orasidagi korrelyatsiyalarni tuzatish uchun qo'shimcha yaxshilanishlar hisoblash xarajatlarini oshirishda ham qo'llanilishi mumkin. Barcha tuzatish omillaridan foydalangan holda optimal eng kichik kvadratlar daraxtini topish NP-to'liq bo'lgani uchun, daraxt bo'shlig'i orqali qidirishda maksimal passimoniya tahlilida qo'llaniladigan bir xil evristik qidiruv usuli qo'llaniladi.