Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

Protein barqarorligi
O
a
CH3
NH SO3H
• HCl
b
NH
c
NH2
CH3
d
C
15
d) 8-anilino-1-
a) guanidin gidroxlorid
(GuHCL), b) tuzilishi
3.3-rasm Kimyoviy
naftalensulfonik kislota (ANS).
Mehribonlik bilan tasvirlang
karbamid, c)
trimetil-N aminoksid (TMAO) va
C. Lendel tomonidan taqdim etilgan
H2N
H2N C NH2
H3C NO
Machine Translated by Google

---

Protein-oqsil o'zaro ta'siri
oqsillar o'rtasida bu aloqa asosan oqsil-oqsil o'zaro vositachilik qiladi.
2002; Rayan va Metyus 2005). Shubhasiz, molekulyar mexanizmlarni chuqur tushunish
moment. To'g'ri vaqtda to'g'ri ishni qilish uchun molekulalar muloqot qilish usuliga muhtoj va
Protein-oqsil o'zaro ta'siri yangi bog'lanishning rivojlanishi uchun juda muhim bo'ladi
Proteinlar umurtqa pog'onasi tuzilishida ham o'zgarishlarni boshdan kechiradi, ko'pincha menteÿe,
Bugungi kunda qo'rqinchli kasalliklar, masalan, saraton va oqsillarni noto'g'ri qatlamlash kasalliklari (Dobson
Agar tirik hujayrani kuzatadigan bo'lsak, har qanday vaqtda juda ko'p harakatlar sodir bo'ladi
1894 yilda Emil Fischer tomonidan kiritilgan qulf va kalit o'zaro ta'sirlari (Goh va boshq. 2004). Boshqa
zanjir aylanishlari va orqa suyak konformatsiyasida o'zgarish yo'q, odatda qattiq tana yoki deb ataladi
mos bo'lmagan vaqtda yoki joyda kompleksning shakllanishi. Bu bizning ko'pchiligimiz uchun amal qiladi
ligandga "qo'lqopdagi qo'l" sifatida mos keladigan protein interfeysining konformatsion o'zgarishi. The
oqsil konformatsiyalar ansambli bilan ifodalanadi. Ushbu konformatsiyalarni vizual tarzda ko'rsatish mumkin
Endogen oqsillarning noto'g'ri ishlashi muhim o'zaro ta'sirning yo'qolishiga yoki yo'qolishiga olib kelishi mumkin
ularni tavsiflash uchun turli modellar qo'llaniladi. Ba'zi oqsillar faqat kichik tomoni bo'lgan komplekslarni hosil qiladi
katlamaning pastki qismidagi qo'pollikdan hosil bo'lgan turli energiya minimallarining egalari sifatida
muvozanat gipotezasi, (Tsai va boshq. 1999; Goh va boshq. 2004) mahalliy holatdagi interfeys.
Ajablanarlisi shundaki, ko'plab inson kasalliklari oqsil-oqsillarning g'ayritabiiy o'zaro ta'siridan kelib chiqadi.
huni (Tsai va boshq. 1999). Ligand faqat faol konformatsiya va bilan bog'lanishi kerak
16
Murakkab hosil bo'lganda va turli darajadagi konformatsion o'zgarishlar mavjud
1958 yilda Daniel Koshland tomonidan kiritilgan (Koshland 1958). Oldindan mavjud bo'lgan holatda
O'zaro ta'sirlar bugungi kunda oqsil fanining asosiy maqsadi hisoblanadi.
bog'lovchi substratlar (Gerstein va boshq. 1993; Jones va Thornton 1996). Ko'pincha bu modelga murojaat qilinadi
mexanizm, ayniqsa, ko'pincha domen o'zgarishiga duchor bo'lgan ferment komplekslari uchun tegishli
Biologik jarayonlar uchun ularning ahamiyati tufayli ularni batafsil tushunish
komplekslar.
halqa va/yoki domen harakati. Mexanizmni a ni keltirib chiqaradigan ligand orqali ko'rsatish mumkin
ma'lum oqsillarni yoki oqsil-oqsillarni bog'lash, inhibe qilish yoki faollashtirishga qodir bo'lgan molekulalar
4 Protein-oqsil o'zaro ta'siri
4.1 Kompleks shakllanishdagi konformatsion o'zgarishlar
Machine Translated by Google

---