Kurs ishi mavzu: Oqsil ketma-ketliklari bazalari-Trembl

SWISS-PROT va TrEMBL-ga interaktiv kirish
SWISS-PROT yoki TrEMBL-da interaktiv ko'rib chiqishning eng samarali va foydalanuvchilarga qulay usuli bu WWW molekulyar biologiya serveri ExPASy va EBI tomonidan ishlab chiqilganidan foydalanishdir. 1993-yil sentabrida ExpASy veb-server ommaga taqdim etildi. 1999-yil oktyabr oyida jami 60 million ulanishga erishildi. Uning manzili:
http://www.expasy.ch/
ExPASy-ning to'liq va yangilangan oyna saytlari Avstraliya, Kanada va Tayvanda mavjud:
http://expasy.proteome.org.au/ (Avstraliya Proteome Analysis Facility, Sidneyda)
http://expasy.cbr.nrc.ca/ (Kanada bioinformatika resursida, Halifax)
http://expasy.nhri.org.tw/ (Milliy sog'liqni saqlash tadqiqot institutlarida, Taypey)
EBI serveriga quyidagi manzilda kirish mumkin:
http://www.ebi.ac.uk/
ExPASy va EBI veb-serverlarida ketma-ketlik yozuvlarini so'rash va olish uchun Sequence Retrieval System (SRS) dasturiy paketidan foydalanishingiz mumkin. EBI va SIB, shuningdek, Smit-Waterman, FASTA va BLAST ketma-ketligi o'xshashligini ishlatish uchun bir qator qidiruv xizmatlarini taklif qiladi. SWISS-PROT + TrEMBL ga qarshi qidiruvlar.
To'liq SWISS-PROT va/yoki TrEMBL relizlarini qanday olish mumkin
SWISS-PROT + TrEMBL EBI tomonidan CD-ROMda tarqatiladi. CD-ROMlar shuningdek, MS-DOS va Apple Macintosh kompyuterlari uchun ma'lumotlar bazasi so'rovlari va qidirish dasturlarini o'z ichiga oladi. Barcha savollar uchun quyidagi manzilga murojaat qiling: EMBL Outstation — Yevropa bioinformatika instituti, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Kembrij CB10 1SD, Buyuk Britaniya. Tel: [phone]; Faks: [phone]; Elektron pochta: [e-mail]
Internetga ulangan kompyuterdan SWISS-PROT va TrEMBL ni anonim FTP (Fayl uzatish protokoli) yordamida quyidagi serverlardan olishingiz mumkin: ftp.expasy.ch va ftp.ebi.ac.uk
SWISS-PROT-ga ma'lumotlar yoki yangilanishlar/tuzatishlarni qanday yuborish kerak
Yangi ketma-ketlik ma'lumotlarini SWISS-PROTga yuborish va topshirish jarayoniga oid barcha so'rovlar uchun quyidagi manzilga murojaat qiling: SWISS-PROT, The EMBL Outstation — The European Bioinformatika Instituti, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, Buyuk Britaniya. Tel: [phone]; Faks: [phone]; Elektron pochta: [e-mail] (yuborish uchun) yoki datalib@ebi. ac.uk (so'rovlar uchun).
SWISS-PROT-ga yangilanishlar va/yoki tuzatishlar yuborish uchun siz [e-mail] elektron pochta manzilidan yoki http://www.expasy.ch/sprot/sp_update_form.html WWW manzilidan foydalanishingiz mumkin.