Кимеда ахборот технолог иялари

I. Ўкув фанининг долзарблигя ва олнн касбнй таълимдаги ўрнн
Кимё факультета талабалари учун "Кимеда ахборот технолог иялари" фани иккнта асосий масалани ечишни назарда тутади: билим олиш жараёнида талаба сохага тегншли асосий тушунчаларни ўзлаштириши ва ўзининг келажакдагн профессионал со хасида учрайдиган масалаларни компьютер технологияларини кўллаб хал этиш кўннкмаларини ҳосил килиши зарур. Фан дастурининг асосий кием лари куйидагилар:
• Ахборот технология лари: ахборот, компьютер, операцией тюимлар, компьютерда матн, электрон жадваллар, маълумотлар омбори (база данных), ахборотни визуаллаштириш, компьютер тармоклари
• Амалнй дастурларнн куллаш: ахборот, компьютер, операцией тизнмлар, компьютерда матн, электрон жадваллар, маълумотлар омбори (база данных), ахборотни визуаллаштнриш, компьютер тармоклари
• Юкори даражали (сатхли) ал гор ига ик тилларда дастурлаш асосларк ва хнеоблаш усулларн
• Кимёда кўллан клади ган компьютер дастурлари ва уларни кимё масалалар ин и ечишда ишлатиш
П. Ўқув фянинннг вазифасн ва максади
• Замонавий ахборот технология лари б план танншнш.
• Компьютер дастуркй таъминоти билан ишлаш кўникмаларини хосил килиш.
• Алгорнтмик тилда дастурлашнинг элементар принципларнни ўрганиш.
• Ахборотни кайта ишлаш да ва математик моделлашда кўлланиладиган сонли усуллар билан танишиш.
• Кимё сохасида кўлланиладиган махсус компьютер дастурлари билан танишиш ва уларнн кимё масалаларини ечишда ншлатнш.
Ш. Асосий назарий кием (маъруза маинулотлари) Фаннинг наэарнн машғулотлйрн мазмунн Ахборот технологиялари
Ахборот. Сон, матн, график кўринншдаги ахборотни кодлаш усулларн. Ахборотни ўлчов бирликлари. Компьютер - ахборотни кайта ишлаш учун универсал курилма сифатида. Компьютернинг Фон-Нейман архитектурасн. Манзилли хотира. Марказий процессор. Қўшимча курилмалар. Компьютер учун дастурий таъминотнинг ахамияти. Компьютер дастурлари ни н г классификацияси: системавий ва амалий дасгурлар. Вирус дастурлар, турлари. Вирус дастурларга каршн кураш: антивирус дастурлар.
Операцион тизимлар. Амалаий масалалар учун компьютернинг абстракт тасБирини яратишда операцион тизим ахамияти. Компьютер ресуреларини масалалараро ва фойдаланувчилараро такси мл аш. Операцион тизим нинг асосий компоненталари: масалалар диспетчери, хотира диспетчери, файл тизим и, чеклаш тизимн (рус. разграничения доступа). Ой нал ар концепцияен. Ойна,
система менюси. Диалог ойналар билан ишлаш: рўйхатлар, тугмалар. Алмашиш буфери: вазнфасн ва ншлатишга мисоллар.
Матнларни ката ишлаш. Матн ва хнперматн тушунчаси, мисоллар. Белги, сўз, сатр. абзац. Регуляр нфодалар. XML ва унга асосланган тиллар.
Маълумотларнинг реляцион омбори. Реляцион алгебранинг асосий тушунчалари: атрибут, кортеж, муносабатлар. Бирлаштириш, проекциялаш ва сслекциялаш амалларн.
Компьютер тармоклари. Интернет
Компьютер тармоклари. Махаллий ва глобал тармоклар. Файллар билан алмашиниш протоколи (FTP). Масофадан уланиш протоколи (SSH). Интернет, IP ва TCP протоколлар. Электрон почта, телеконференинялар. Адреслар китоби. Электрон хабарларни саклаш: почта кутиси, жилдлар. Почтани тизимлаш. Хужжатлар алмашинуви учун содда схемалар. Клиент-сервер технологияен, IПТР протоколи. World Wide Web ахборот тизими.
. 1:к-1у плат ясосларн ва хисоблаш усулларн.
Дастурлаш. Алгоритм. Дастурлаш тиллари: куйи даражали (сатхли) (ASSEMBLER) ва юкори даражали (сатхли) тиллар (PYTHON, С++, FORTRAN). Компьютер дасгурини компиляция килиш. Компиляция ва бажарилнш жараёнида учрайдиган хатолнклар. Бажарнлувчи дастурни буйруклар сатрида ншга тушириш. Дастур кодини йигиш (рус. отладка), тухташ нукталаринн ишлатнш. Амалий математика усулларн. Такрибий хисоблашлар. Чизиклн хисоблашлар. Циклларни ишлатиб хисоблаш. Кдтор халларннинг йигиндисинн хисоблаш. Хисоблаш хатоликлари. Хосилани ва аник интегрални такрибий хисоблаш усуллари. Ночизнклн тенгламаларни такрибий ечиш усуллари. Энг кичик квадратлар усули. Чизиклн регрессия. Алгебраик тенгламалар системасини такрибий ечиш усуллари. Функцияларни кўллаб хисоблашлар бажариш. Дифференциал тенгламлар системасини такрибий ечиш.
И л мн if г (Ани к маълумотга дойр ма 1нларни яратнш ва тахрнрлаш
Илмий-техник маълумотлар маяжуд матнларни яратиш \ч\ и замонавий дастурий воситалар. Уларнинг еннфлари. Кимёга дойр матнларни тахрирловчи замонавий дастурлар. Уларнинг асосий тавсифлари ва имкониятлари. Кимёвий тахрирлагичларни матн мухаррнрлари билан мослиги. Тажриба маълумотларини кайта ишлаш воситалари. Тажриба маълумогдаринн график, гисто|рамма. диафамма ва х.к. кўрннишда засвирлаш. Илмин ахборотни махсус схемалар. блок-схемалар ва х.к. кўринишда намойиш килшш а им кон берувчи воситалар.
Эмпирика ва назарня.
Ҳисобланишн мумкнн бўЛ1ан кнмёвнй казталнклар. Эмпирик (тажриба) усуллар, бирикмаларнинг боғ >"зунликлари, валет^- ва торсион бурчаклари, нонланнш потенциаллари ва электронга моннллик катгаликлари. Назарий хисоблаш усуллари Срдамида бир нспа эмпирик усулларда аникланадиган катталиклар. Бирикмаларни тавсифловчи катталикларниш хисобланган кийматларини тажрнбада олннгаллари билан таккослаш.
АТОМ ва милою).iM.upmi фяюда ифода.заш. Потенциал )нер1етнк сатх.
Хисоблаш усуллари да ккм мбки i еомефняларнн lyipn киритнш. Дастлабки геометрияларни тайёрлаш вазифасини yiaii 1111 an дастурлар. Бирикма
геометрияларннн уч ўлчамли кўрннншда ифодалаш, элемаггларнинг валетликларннн ннобатга олган холла водород атоми ва бошқа функционал гурухларни кўшиш. Бог узунлнклари, валенг ва торсион богларни кўрсатган холда яратиладнган ташки (илл input) файллар (z-матрица). Хисоблашларнннг эмпирик усулларн
Молекуляр динамика. Молекулаларнинг харакатнни микродаражада моделлаш, физикавий макрохарактсристикаларини аннклаш. Молекулаларнинг маълум вакт лавомида фаю дат и харакати ва траекториясини кайд килиш. Заррачаларнинг харакати, Ньютон конунлари. Эмпирик усулларнинг кимёвий муаммоларни ечишда кўлланилиши.
МОАОЧК (МО ЛКАО). Валент электронлар Еидошуви. Ярим эмпирик усуллар
Молекуляр орбиталлар. Атом орбиталларннинг чизиклн комбинациялари. МО усулида электронлар.Сигма богнинг куйи банд МО-лари. Юкори банд МО-энергияси бирикмаларнинг ионланиш потенниали. Ярим эмпирик усуллар. Валент ёндошув. Бирикмаларнинг МО богларини куриш.
NDO ва.ММХ) усуллари.
ZDO-(/.ero differential overlap). Полинчи даражадаги дифференциал копланнш. NDO (neglect differential overlap) ёндошуви. CNDO, INDO, MINDO хисоблашлар. NDDO (neglect diatomic differential overlap) ёндошуви. Юкори даражада параметрланган MNIX). AMI, РМЗ усуллари. Бирикмаларнинг геометрик кўрсаткичлари, физик-кимёвий катталиклари ва реакцион кобилиятлари.
Ярим эмпирик усулларнинг кимёвий муаммоларни ечишда Кўлланилишн
Кваш кимёси молекуляр снстемаларнн тавсифлашда асосий постулат ва приншшлар. Молекуляр орбиталлар назарияси. Квант кимёси усуллари билан молекуляр структураларни курса г иш, Z-магрицаларни аниклаш, молекуляр системаларнинг электрон, спектрал ва бошка тавсифларини фафиклар оркали ифодалаш. Кнмёвий масалапарни ярнм-эмпирик усуллар ёрдамида ечиш. Компьютер учун масалалар тузиш ва уларнинг счимлари баённомалари билан ишлаш.
Ноэмпнрик усуллар.
Ноэмпнрик хисоблаш усулуларинннг амалиётда кўлланилиши. Хартри-Фок-Рутан тенгламси. Ah initio усулн. Слейтер дстермшшплари. Борн-Опенгеймер якинлашуви. Атомларнинг сферик симметрияси ва молекулаларнинг фазола жойлашиши.
Мнннмал, кнчик, Vpia ва катга базис тўпламлари.
Базис тупламларининг МО-лар курилишига таъсири. Ноэмпнрик хисоблаш усуллари. МО-лар куришда атомларнинг ички электронлари. Мнннмал, кнчик. ўрта ва катта базис тўпламлари таргиби. Банд МО-лар сони ва МО-лар ООНННИНГ ўзгарнши. Электрон корреляннялар.
Ноэмпнрик усулларннш кнмёвий муаммоларни сини ia кўлляннлиши
Ҳисоблашнннг змпнрик усуллари. Эмпирик услублар билан ишлашникг асосий коидалари, Молекуляр тузилншни хисоблаш учун вазифани ва хисоблаш бае'нномаларни расмийлаипириш. Молекуляр механика усулуи билан иамуиавий кимёвнй масллалар ечиш: молекуланннг реакцион траекторияси, чнергиялари. зарядларн ва бошка тавснфларнни хисоблаш. Эмпирик усулларнинг кимёвнй муаммолар ечимида кўлланилнши.
Чичлик функпноиалн назариягига асосланган гибрид усуллар.
Ҳисоблашларда эритувчи таъсирини инобатга олиш усуллари. Атом зарядларини хисоблаш усуллари. Бнрнкмаларниш реакпион кобилиятларнни бахолаш.
Структура асоснда турли хил параметрлярни хисоблаш.
Термодинамик параметрларнн хисоблаш усуллари. Структура асосида турли хил параметрларни хисобловчи мажму&тар. Ьирнкмаларнинг тажрнбада олинган курсаткичларини ифодаловчи математик моделлар. ChemOlTicc дастурида бнрикмаларнинг ЯМР спектрларини олиш.
Янги доривор моддаларнн яратишнннг назарий усуллари.
InSilico ва Драг дизайн тушупчалари. QSAR сохаси. Дескрипторлар. Build QSAR дастурн. Молекуляр докинг ва внртуал скрининг. Натижаларни кайта ншлаш. Назарий ва экспериментал характсристикаларнинг бир-бирига боғликлиги.
IV. Амалий маш1у.тотлар буйнча курсатма ва тавенялар
1. 11ерсонал компьютернинг тавсифларини аникдаш
2. Аудио-, видиео-воситалар ва уларнинг тавсифлари билан танишиш
3. Тармок картаси тавсифлари
4. Компьютерра тнзим ва амалий дастурий таъминотларнн урнатиш. Зарур булма! анларннн олиб ташлаш.
5. Компьютер вируслари. Антивирус дастурлар. Уларнинг лурлари. Компьютер вируслари базасини янгилаш.
6. Алгорнтмик тиллар. PYTHON, О 1, FORTRAN тнлларида компьютер дастурларини яратишга мисоллар.
7. PYTHON, С++, FORTRAN тилларида яратилган дастурларни биргаликда ишлатиш.
8. Компьютер тармогинн яратиш. Тармокдаги комиьютерлар орасида маълумот алмашиш. Тармокда ахборот хавфеизлиги.
9. Интернет тармогига уланиш. Веб сахифалар. Электрон почта билан ишлаш.
10. И1ггернетдан ким£| а дойр маълумотлар кидириш.
11. Кндирув серверлари: google, yandex, yahoo, bing
12. Махаллий тармокда файллар алмашинуви: ГГР, SSH протоколлар билан ишлаш.
13. Стандарт ёрдамчи редактор ва фафик дааурларн билан ишлаш (ChemWin).
14. AK'hemy. Куч майлондари мухитнла компькчер моделлаштнрнш дастурлари билан ишлаш.
15. Молекуляр механика ММ112 дастури билан ишлаш.
16. РСМ дастури мухитида молекуляр механика услубида намунавий масалалар билан ишлаш.
17. Молекуляр тузилиш назарияси билан классик ва квант-кимёвий йўиалишларини таккослаш.
18. Молекуляр Орбиталлар назарияси ва унинг кимёвий бирикмалар хусусиятларинн бае'н килиш учун ншлатилишн.
19. Ярим-эмпирик услублари билан кимёвий масала счимини топиш.
20. Ab initio услуби учун компьютер топширигини тузиш.
21. HypcrChem ва Cheml.ab дасзурлар мисолида замонавий жамланган хисоб дастурлари билан ишлаш.
22. Кимёвий бирикмазарнинг хоссалари ва электрон тузилиши, намунавий кимёвий масалани ечиш ко1гуниятлари.
23. 1 абиий бирикмаларнинг QSAR тахлили.
24. DRAGON дастурини ишлатиб дескрипторлар танлаш ва структура-фаолликни математик моделини тузиш.
25. Argusl^b дастури. Оксил-лнганд комплексларннн тузиш, ўрганиш ва уларнинг богланиши хакида ахборот олиш.
26. Халкаро кимёвий идентификатор InChI
27. Молекулаларнинг содда тасвирлаш спсцификацияси SMILE
28. Кимёвий бирикмалар тузулишнни тасвирлаш усуллари
29. BOINC плагформаси асосида кимёвий ва биокимёвий ёйнлган хисоблашларга дойр проектлар
30. Очик манба кодига (OpenSource) асосланган молекуляр захрнрлагичлар
31. Кимёвий структураларга донр маълумотлар билан И1шювчн очик манба колли дастурлар
32. Ноорганик бирикмалар хакида кристаллографик маълумотларга до!ф очик маълумот омборлари
33. Органик молекулаларнинг ПМР-спектрларини NMRShiftDB маълумотлар омборидан кидириш