I bob koilin rnk bog’lovchi funksiyalarga EGA multidomen

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

---

29 
Xulosa. 
Xulosa qilib shuni aytish mumkinki oldingi tadqiqotlar in vivo CLIP3,13,25 va 
in vitro tanlovlari (SELEX, RNAcompete va Bind-N-seq) 5,26,27,28 ga asoslangan 
IMPlarni qisqacha tanib olish ketma-ketligini taklif qildi, bularning barchasi CA ga 
boy umumiy konsensusni taklif qildi. . Biroq, in vitro tanlash yondashuvlarining 
asosiy cheklovi shundaki, ular odatda faqat bitta RNK-bog'lovchi motivni sig'dira 
oladigan qisqa degenerativ ketma-ketliklardan boshlanadi. Shu sababli, alohida 
domenlarning hissasi qiyin bo'lib qoldi. Va nihoyat, oldingi tadqiqotlar KH 
domenlarining RNK o'zaro ta'sirida muhim rol o'ynashini isbotlagan bo'lsa-da, ikkita 
RRM 5,14,15,16,29,30 ga hali hech qanday funktsiya belgilanmagan. 
IMP3-ni ko'p domenli RBPning prototip namunasi sifatida o'rganish uchun biz 
RNK-seq va kombinatoryal bioinform bilan birlashtirilgan tizimli, domenda 
echilgan SELEX protsedurasini o'rnatdik. atik yondashuvlar. Muhimi, biz SELEX 
uchun asos sifatida juda uzoq degeneratsiya ketma-ketligini (N40) ishlatdik, bu 
bittadan ortiq RNK-bog'lovchi domenga ega bo'lgan bir nechta RNK kontaktlariga 
ruxsat berish va tegishli bioinformatik intervallarni tahlil qilish. Bu bizni IMP3 
o'zining barcha tandem RNK-bog'lovchi domenlarining faolligi orqali - umumiy 
GGC yadrosi bo'lgan CA ga boy motivlar va ketma-ketliklardan tashkil topgan bir 
nechta cis-ta'sir qiluvchi RNK elementlarining kengaytirilgan qatorini tan olishini 
kashf qilishga olib keldi. Ushbu biokimyoviy topilmalar IMP3 KH va RRM-tandem 
domenlarining strukturaviy tahlili va RNK-bog'lanish tadqiqotlari uchun 
kristallografiya va NMRni birlashtirgan integratsiyalashgan strukturaviy biologiya 
tomonidan qo'llab-quvvatlanadi. 
Birgalikda biz RNK elementlarining tartiblangan qatorini IMP3 tomonidan 
tanib olish uchun biokimyoviy, bioinformatik va tizimli dalillarni taqdim etamiz, 
ular ma'lum bir oraliq naqshida joylashtirilgan va 100 nts dan ortiq bo'lishi mumkin 
bo'lgan hududlarni qamrab oladi. Ushbu model endogen IMP3 maqsadli 
mRNKlarini, shu jumladan yaxshi o'rganilgan HMGA2 transkriptini tahlil qilish 
bilan qo'llab-quvvatlanadi, buning uchun biz IMP3 va let-7 miRNK o'rtasidagi 
funktsional o'zaro tartibga solishni o'rgandik. Xulosa qilib aytganda, biz yirik 

---

30 
tartibga soluvchi mRNP komplekslarini tekshirish uchun asosni taqdim etamiz. 
Shunday qilib, biz har qanday ko'p domenli RNK-bog'lovchi oqsilga qo'llanilishi 
mumkin bo'lgan murakkab va kombinatoryal RNP tarmoqlarini tizimli ravishda 
ajratish uchun umumiy yondashuvni o'rnatamiz. 
IMP3 bir qator ketma-ketlik elementlarini taniydi 
IMP3 ning murakkab RNK-bog'lash xususiyatlarini sindirish uchun biz 
individual, GST yorlig'i ostidagi subdomenlardan foydalandik va in vitro SELEX 
protsedurasini qo'lladik, shu jumladan tasodifiy N40-RNK hovuzi va keyingi RNK-
seq tahlili bilan to'rtta tur tanlovi (1a-rasm, b va qo'shimcha 1-rasm). E'tibor bering, 
standart qisqa degeneratsiya hududlari o'rniga biz bir nechta motiflarning 
massivlarini, jumladan, ularning oralig'ini ajratish va tahlil qilish imkoniyatiga ega 
bo'lish uchun N40-RNK hovuzidan foydalanganmiz; bundan tashqari, biz 
tanlovning har bir bosqichidan keyin ketma-ketlikni amalga oshirdik, bu SELEX 
protsedurasi davomida ketma-ketlikni boyitish imkonini berdi.

---

31