Аннотации рабочих программ дисциплин основной профессиональной образовательной программы – программы магистратуры по направлению подготовки


Многомерный анализ биологических данных



Download 89,21 Kb.
bet19/21
Sana19.04.2022
Hajmi89,21 Kb.
#563267
1   ...   13   14   15   16   17   18   19   20   21
Bog'liq
annotatsii-rabochikh-programm-distsiplin-06.04.01-biologiya

Многомерный анализ биологических данных
аздел 1. Публичные базы данных и базовые инструменты для работы с ними.
Тема 1. Введение в биоинформатику и функциональную геномику. Основные задачи и набор инструментов.
Тема 2. Банки данных биологических последовательностей. Геномные браузеры. База данных NCBI. GenBank.
Тема 3. Сравнение нуклеотидных и белковых последовательностей. Попарное выравнивание. BLAST.
Тема 4. «Продвинутый» поиск гомологичных последовательностей. PSI-BLAST, MegaBLAST, BLASTZ, BLAT. Скрытые марковские модели.
Тема 5. Множественное выравнивание последовательностей: основные алгоритмы и их особенности. ClustalW, MAFFT, MUSCLE и другие методы.
Тема 6. Молекулярная филогения и эволюция. Ортологи и паралоги. Филогенетические деревья и алгоритмы их построения и анализа.
Тема 7. Модели эволюции. Гипотеза молекулярных часов. Скорости замен и время дивергенции.
Тема 8. Методы предсказания в биологии. Поиск сигналов в нуклеотидных последовательностях. Распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов.
Тема 9. Транскриптомика. Особенности анализа полногеномных данных по экспрессии генов. Статистические методы обработки данных микрочип экспериментов.
Тема 10. Протеомика. Специализированные базы данных по белкам. Белковые семейства (домены и мотивы). Поиск и предсказание физических свойств белков.
Раздел 2. Статистическая геномика.
Тема 11. Анализ ассоциаций количественных признаков. Регрессия, корреляция, значимость. Основные дизайны генетико-эпидемических исследований. Анализ ассоциации бинарных признаков. Относительный риск, отношение шансов, тестирование.
Методы статического анализа ассоциаций.
Тема 12. Логистическая регрессия. Закон Харди-Вайнберга. Неравновесие по сцеплению. Введение в анализ генетических ассоциаций. Методы контроля качества генетических данных. Знакомство с пакетом GenABEL, контроль качества, полногеномный анализ ассоциаций.
Тема 13. Множественное тестирование и ошибка первого рода. Метод полногеномного анализа ассоциаций. Пакеты ProbABEL, MixABEL.
Тема 14. Мощность. Геномное покрытие. Популяционная стратификация. Полногеномный анализ ассоциаций при сложной популяционной структуре.
Тема 15. Мета-анализ. Анализ сцепления. Обзор доступных баз данных (Hapmap, 1000g, dbGAP).





Download 89,21 Kb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   ...   13   14   15   16   17   18   19   20   21




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©hozir.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling

kiriting | ro'yxatdan o'tish
    Bosh sahifa
юртда тантана
Боғда битган
Бугун юртда
Эшитганлар жилманглар
Эшитмадим деманглар
битган бодомлар
Yangiariq tumani
qitish marakazi
Raqamli texnologiyalar
ilishida muhokamadan
tasdiqqa tavsiya
tavsiya etilgan
iqtisodiyot kafedrasi
steiermarkischen landesregierung
asarlaringizni yuboring
o'zingizning asarlaringizni
Iltimos faqat
faqat o'zingizning
steierm rkischen
landesregierung fachabteilung
rkischen landesregierung
hamshira loyihasi
loyihasi mavsum
faolyatining oqibatlari
asosiy adabiyotlar
fakulteti ahborot
ahborot havfsizligi
havfsizligi kafedrasi
fanidan bo’yicha
fakulteti iqtisodiyot
boshqaruv fakulteti
chiqarishda boshqaruv
ishlab chiqarishda
iqtisodiyot fakultet
multiservis tarmoqlari
fanidan asosiy
Uzbek fanidan
mavzulari potok
asosidagi multiservis
'aliyyil a'ziym
billahil 'aliyyil
illaa billahil
quvvata illaa
falah' deganida
Kompyuter savodxonligi
bo’yicha mustaqil
'alal falah'
Hayya 'alal
'alas soloh
Hayya 'alas
mavsum boyicha


yuklab olish