|
4.11. Qon plazmasi oqsillarining elektroferogrammasi (normal): a - elektroforez paytida tarqalish bo'sh: b intensivligi.
Hujayralar, to'qimalar, organlar va biologik suyuqliklar proteomini to'liq tahlil qilish ikki o'lchovli yuqori aniqlikdagi elektroforez yoki HPLC yordamida amalga oshiriladi, so'ngra alohida oqsillarni mikrochiplash orqali mass-spektrometrik identifikatsiya qilish. Bu sizga bitta namunada 10000 tagacha individual oqsillarni tahlil qilish va kasallik paytida ularning kontsentratsiyasidagi o'zgarishlarni qayd etish imkonini beradi.
Hozirgacha protozomani ochish uchun ikki tomonlama elektroforez kompleks usuli keng qo'llanilgan (3-bobga qarang). Ikki o'lchovli elektroforezning rezolyutsiya kuchi bir o'lchovli elektroforezning rezolyutsiya kuchidan bir necha baravar katta bo'lib, uning yordamida molekula og'irliklari farqiga ko'ra oqsil aralashmalari ajratiladi. Ikki o'lchovli elektroforez (2-D-PAGE) bir o'lchovliga qaraganda bir necha barobar ko'proq turli xil oqsillarni ochib berishga qodir. 2D elektroforez proteomik tadqiqotlarda muhim rol o'ynamoqda. Shu bilan birga, o'tkazilishi kerak bo'lgan tahlillar hajmining o'sib borishi yuqori samarali suyuq xromatografiya va tandem mass-spektrometriyasini birlashtirgan usullar va asbobsozlik tizimlarining rivojlanishiga olib keldi. Ushbu usullar yuqori ishlash, sezgirlik va axborot tarkibini ta'minlaydi. Shu bilan birga, mikrochiplar tobora ko'proq foydalanilmoqda (4.7-rasmga qarang).
2. Funktsional proteomika
Organizmdagi ma'lum funktsiyalar va / yoki molekulyar tuzilmalarni ta'minlash uchun har bir alohida oqsilning katta ahamiyati ularning turli fiziologik va patologik jarayonlarda ishtirok etishini belgilaydi. Funktsional proteomika proteomning funktsional xususiyatlarini aniqlash bilan bog'liq. Vazifalar. Funktsional proteomikaning echimi, masalan, ketma-ketlikka qaraganda ancha murakkabroq. Oqsilning tuzilishi va uning organizmdagi funktsiyalari o'rtasidagi bog'liqlikni aniqlash orqali alohida oqsillarning funktsional rolini bashorat qilish proteomikaning asosiy vazifalaridan biridir. Bunda proteomika organizmning ma'lum funktsiyalarini tegishli genlar faoliyati (ekspression) bilan bog'laydi. Tananing hujayralarida, hayotning turli bosqichlarida genlarning faqat bir yoki boshqa qismi namoyon bo'ladi. Gen ekspressionining yakuniy bosqichi, qoida tariqasida, mos keladigan oqsildir. Oqsillar organizmga turli xil biologik funktsiyalarni chiqaradi. Bular, masalan, fermentlar, gormonlar, retseptorlar va boshqaruvchi oqsillar.Oqsillar va hujayralar tarkibi hujayra tsiklining fazasiga, to'qima tarkibiga kirishiga va boshqa harakatlarga qarab doimo o'zgarib turadi. Proteomikaning muhim maqsadlaridan biri inson organizmidagi o'zaro ta'sir mexanizmini 300 mingga yaqin oqsildan iborat. Turli xil patologiyalarga xos bo'lgan oqsil-oqsil komplekslarini o'rganish ushbu natologiyalarning paydo bo'lishi va rivojlanish mexanizmlarini aniqlashning samarali usuli hisoblanadi. Oqsillarning o'zaro ta'sir mexanizmlarini yaratish tegishli dorilarni va turli patologiyalarni davolash usullarini ishlab chiqarishni tezlashtiradi. Masalan, insupinaning muqobil shakllari sintezlarini ishlab chiqish. Natijada, millionlab diabetga chalingan odamlarning hayoti saqlanib qoldi va uzaytirildi. Ko'pgina kasalliklarning, shu jumladan o'smalarning sabablari signal uzatish zanjiridagi turli oraliq moddalar sintezining oqsil-oqsil komplekslarini hosil bo'lishi yoki oraliq mahsulotlarning sintezini kodlovchi genlardagi mutatsiyalar natijasida buzilish ekanligi aniqlandi.
TNF-a ekspression, hujayralar ko'payishi va hayotini tartibga solishga xalaqit beradi. Ushbu regulyatsiyani buzish o'smaning o'sishi, yallig'lanish va otoimmun patologiyalar kabi patologik jarayonlarning rivojlanishiga olib keladi, masalan, genlar faktori bo'lgan retseptorlari va hujayra ichidagi effektorlari komplekslari, Tegishli nekroz. Neyrodejenerativ patologiyalar, o'roqsimon hujayra anemiyasi va shizofreniya bilan bog'liq bo'lgan isimoaktiv juft oqsillar aniqlandi. Proteom diagnostikasining yutuqlaridan biri bu Altsgeymer kasalligida etnologinni yaratishdir. Ushbu neyrodejenerativ patologiyaning asosiy sabablaridan biri bu asab to'qimalarida modifikatsiyalangan beta-amiloid oqsilining cho'kishi. O'zgargan beta-amiloidning hosil bo'lishi aspartatning izomerizatsiyasiga bog'liq (4.12-rasm).
Do'stlaringiz bilan baham: |
