Филогенетические деревья

2. ДНК-полимераза термостабиллиги (Taq-полимераза). ДНК- полимеразанинг умумий хусусияти шундаки, 5‘→3' йўналишида нуклеин кислоталарнинг матрицияланган синтезини олиб бориши. Кўпчилик ДНК-полимеразалар хатолик орқали қўшилган нуктеотидларни олиб ташлаш учун мўлжалланган 3'→5' экзонуклеазали фаолликга эга бўлади. Одатда реакция ўтказиш учун 0.25-.0.5 (мкл) бирликда термостабил полимеразанинг Thermus aquaticus ўзи кифоя.

• 2. ДНК-полимераза термостабиллиги (Taq-полимераза). ДНК- полимеразанинг умумий хусусияти шундаки, 5‘→3' йўналишида нуклеин кислоталарнинг матрицияланган синтезини олиб бориши. Кўпчилик ДНК-полимеразалар хатолик орқали қўшилган нуктеотидларни олиб ташлаш учун мўлжалланган 3'→5' экзонуклеазали фаолликга эга бўлади. Одатда реакция ўтказиш учун 0.25-.0.5 (мкл) бирликда термостабил полимеразанинг Thermus aquaticus ўзи кифоя.
• 2'-дезоксинуклеозид-5'-трифосфат аралашмаси (дНГФ (dNTP) - дАТФ, дГТФ, дЦТФ и дТТФ) - Taq-полимераза ёрдамида иккинчи ДНК занжири синтези учун фойдаланилади. Ностабилланган дНТФ аралашма ДНК полимераза иши аниқлигини камайтиради. дНГФ баланд концентрацияси Mg2+, ионлари концентрациясини камайтиради ва ДНК полимераза фаоллигини пасайтиради.
• ПЗР буфери – маълум концентрациядаги катион ва анионлар аралашмаси бўлиб, реакция учун оптимал шароит яратади: стабил рН ва эритманинг ион кучи.

5. Таҳлил қилинаётган намуна – реакция аралашмасига киритиш учун тайёрланган ПЗР махсулоти бўлиб, ПЗР-амплификацияси учун нишон ҳисобланган ДНКни ўзида сақлайди.

• 5. Таҳлил қилинаётган намуна – реакция аралашмасига киритиш учун тайёрланган ПЗР махсулоти бўлиб, ПЗР-амплификацияси учун нишон ҳисобланган ДНКни ўзида сақлайди.
• Mg2+ иони - Taq-полимераза иши учун керакли. Ишчи концентрациялар диапазони: 0,5-5,0 мМ (10 мМ - ДНК-полимеразани 40-50% га сусайтиради Mg2+ концентрациясининг ошиши полимера занжир реаксиясининг ўзига хослигига ва самарадорлигига кучли тасир кўрсатади: ПЗР- махсулотлар чиқишини кўпайтиради, лекин праймерлар гибридланиши хослиги сусаяди. Mg2+ оптимал концентрацияси ДНК- матрицаси ва праймерлари нуклеотид кетма-кетлигига боғлиқ. Mg2+ дНТФ билан комплекс ҳосил қилади, айнан шу коплекслар Taq- полимераза учун субстрат хисобланади. Mg2+ концентрацияси кўтарилиши ДНК эриш температурасини кўтарилишига ва праймерлар гибридланиши аниқлигини пасайишига олиб келади.
• Дистиллаган сув.