Fasta va Blast tushunchalari

Fasta va Blast tushunchalari

FASTA - matn formati nukleotidlar yoki aminokislotalar bitta harfli kodlar yordamida belgilanadigan nukleotid yoki polipeptid ketma -ketligi. Oddiyligi va amaliyligi tufayli hozirda ko'pchilik biologik ketma -ketlik dasturlari tomonidan ishlatiladi. Ushbu formatdagi fayllar ketma -ket nomlarni, ma'lumotlar bazalaridagi identifikatorlarini va izohlarni o'z ichiga olishi mumkin. FASTA fayli tarkibidagi biologik ketma -ketliklarning xususiyatiga qarab, har xil kengaytmali bo'lishi mumkin.

BLAST o’zi nima?

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool – asosiylokal tekislanishni izlash vositasi) bu kompyuter dasturlaridan biri bo’lib, u oqsil yoki nuklein kislotalar gomologlarini mavjud bazadan izlab topishga xizmat qiladi. Sodda qilib tushuntirilganda sizda oqsil yoki nuklein kislotalarning ma’lumbir ketma-ketligi bor. Lekin siz bu nuklein kislota qaysi turga tegishli ekanligini bilmaysiz. BLAST sizga mana shu qo’lingizdagi nukleotidlar ketma-ketligi qaysi turga tegishli ekanligini aniqlashga yordam beradi. Albattau bazada mavjud bo’lgan millionlab namunalarga solishtirish asosida sizga kerakli natijani chiqarib beradi. BLAST dasturini 1990-yilda AQSHlik bir guruh tadqiqotchilar ishlab chiqqanlar.