«биоинформатикага муқаддима»

Фаннинг ишлаб чиқаришдаги ўрни: ―Биоинформатикага муқаддима‖ фанининг 
ишлаб чиқаришдаги асосий ўрнини тиббиѐт, фармацевтика соҳаси ва замонавий таҳлил 
лабораториялари ташкил этади. Тиббиѐтда бу фан ютуқларидан фойдаланган ҳолда 
генларни кўчириб ўтказишда, фармацевтикада янги дори воситаларини яратиш ва 
уларнинг организмдаги оқсиллар билан боғланиш механизмларини ўрганишда ва 
замонавий диагностик лабораторияларда фойдаланилади. 
Фойдаланилган адабиѐтлар: 
1. С.Игнасимуту «Основы биоинформатики». Москва 2007 
2. Аrthur M. Lesk «Introduction to Bioinformatics»/ Oksford University Press 2002. 
3. В.Д.Лахно «Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии». Москва 2002 
4. B. Alberts, A.Johnson, J.Lewis, M.Raff, K.Roberts, P.Walter. «Molecular biology of the 
cell». Fifth edition. USA. Nyu-York. 2008 
 
 
Асосий интернет сайтлари 
5. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/ 
6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/GenbankOverview.html 
7. http://www.ebi.ac.uk/embl/ 
8. http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php 
9. http://www.genome.ad.jp/kegg/ 
10. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene 
11. http://ornl.gov/TechResources/Human_Genome/. 
12. http://compbio.ornl.gov/gac/index.html. 
13. http://fp.mcs.anl.gov/~gasterland/genomes.html 

---

5-МАЪРУЗА 
Мавзу: Биологик макромолекулаларни визуализациялаштиришнинг замонавий 
методлари.
 
Режа: 
1. Биологик макромолекулаларнинг бирламчи структураси асосида уларни 
визуализациялаштириш 
2. RasMol дастури ва унда ишлаш тартиби 
3. PyMol ва Modeller дастурларида ишлаш. Яратилган структураларни PDB, MMDB 
маълумотлар базаларига жойлаштириш 

Мавзунинг долзарблиги: Агарда кетма –кетлик тахлилида қандайдир ютуқларга 
эришилган бўлса, юқори структураларни тўлиқ тахлил этиш учун ҳали кўп йиллар 
давомида иш олиб боришга тўғри келади. Кетма –кетликларни тўғри жойлаштириш 
муаммоси –замонавий молекуляр биологиянинг асосий мавзуси ҳисобланади. 
Аминокислоталарнинг чизиқли кетма–кетлиги қандай қилиб оқсилнинг учламчи 
структурасини белгилайди. 1961 йилда рибонуклеазанинг тўлиқ денатурацияга 
учраганлиги ва ферментатив фаоллиги ва дастлабки структурасининг тўлиқ қайта 
тикланганлиги намойиш этилган. Шундан сўнг бирламчи структура учламчи структурани 
белгилайди деган хулосага келинган. Дастлаб оқсил молекулаларнинг жойлашишини 
белгиловчи қонуниятлар белгиланган. 1998 йилда иккиламчи структурани белгиловчи 
усул 50-60% ишончлилик даражасига эга бўлган. Биологик макромолекулаларнинг 
бирламчи структураси асосида уларнинг фазовий структураларини аниқлаш, уларнинг 
тўғри тахланиш қонуниятларини тушуниш учун RasMol, PyMol, Modeller каби бир қанча 
биоинформацион дастурлар мавжуд. Улар ѐрдамида кетма-кетлиги аниқланган 
макромолекулаларни визуализациялаштириш мумкин.