"Bioinformatika va Biomexanika" fanidan Amaliy ishi- №3 Mavzu: dnk va rnk ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish

MUHAMMAD AL-XORAZMIY NOMIDAGI TOSHKENT AXBOROT TEXNOLOGIYALARI UNIVERSITETI SAMARQAND FILIALI


Kompyuter Injiniring Fakulteti
"Bioinformatika va Biomexanika" fanidan


Amaliy ishi- №3

Mavzu: DNK va RNK Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish.

Fan: Bioinformatika va Biomexanika Talaba: Nematov Dilshod.
TATU SF 2022

MAVZU : DNK va RNK Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish.
Reja:

1. 
   UGENE dasturi orqali genlarni tekshirish.
   
2. 
   Nukleotid ketma-ketliklar ma’lumotlar bazasi (EMBL, DDBJ, NCBI, UniGene, STACK, EMBL-SVA) resurslari bilan tanishish.
   

NCBI bu genlar boyicha malumot oluvchi sayt bolib biz unda turli xil osimliklarni geni olishimiz mumkin. Biz NCBI da ozimizga kerakli bolgan gen tuzilmasini olib uni tekshirib korishimiz va qanday tuzilgan ekanligini korib chiqishimiz mumkin. Gen bu har bir ozimlik tarkibida bolib uni drugaylash orqali yanigi nav hosil qilshida yani sodda qilib aytganda chatishtirish orqali o’simlik urug’ini yanada hosildorligini oshirishda genlarda foydalaniladi. Har bir Geni ozini kodi bolib bir biridan farq qiladi.Genlarni kodini korish uchun quydagi sayt orqali qarab chiqamiz.

NCBI dastur sayti orqli biz G’o’za turi G.hirustum dan foydalanib qarab chiqamiz.
Bu NCBI dasturini web-sayt ko’rinishi.

NCBI dasturi orqali biz g’o’za turi olish uchun bir nechta ketma ketlikni olamiz.

Bunda biz G.hitustum tanlanadi.

Bunda gen malumotini olib text faylga saqlaymiz.

Text saqlangan gen malumotini olib Sequence Massager orqali gen saqlaymiz va

Blank spaces tugmasi orqali bosamiz va u bizga genratsiya qilib beradi.



Genlarni quydagicha saqalb olamiz.

UGENE dasturini ishga tushiramiz va saqlangan faylni chaqiramiz.

UGENE dasturi bizga quydagicha malumotlarni bizga korsatadi.

Xulosa:
Ushbu topshiriqda men o’zimga keraklicha xulosaga ega boldim. Bunda turli xil o’simliklarni chatishtirish ularni gen tuzulishi va yangi navlarni hosil qilishlarni ko’rib chiqdim.BUnda assosan o’simliklarni yangi navini olishi uni unumdorligini oshirishda bizga kerak boladigan genlarni qarab chiqdim.