Замонавий биоинформацион дастурлар. Режа


Маъруза мавзусининг қисқача баёни



Download 26,72 Kb.
bet2/4
Sana02.07.2022
Hajmi26,72 Kb.
#731645
1   2   3   4
Bog'liq
3-dars (3)

Маъруза мавзусининг қисқача баёни:
Замонавий биоинформатика фанининг ривожланишида ва бу фаннинг кенг соҳалар бўйича тадқиқ қилиниши янгидан янги усулларнинг юзага келишига сабаб бўлди. Ўрганилаётган объектнинг хусусиятларига қараб замонавий биоинформатикада қуйидагича усуллар мавжуд:
ACT (Artemis Comparison Tool) — геном таҳлили
Arlequin — анализ популяцион-генетик маълумотларнинг таҳлили
BioEdit — нуклеотидли ва аминокислотали кетма-кетликларни кўплик текислашларнинг муҳаррири
BioNumerics — универсал тижорат дастурлар пакети
BLAST — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликлари бўйича маълумотлар базаларидан қариндош кетма – кетликларни излаш
Clustal W — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари
Clustal X — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари
DnaSP — ДНК кетма – кетликларидаги полиморфизмларни таҳлили
FigTree — филогенетик дарахтларнинг муҳаррири
Genepop — популяцион-генетик таҳлил
Genetix — популяцион-генетик таҳлил (дастур фақат француз тилида тақдим этилади)
JalView — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастур муҳаррири
MacClade — маълумотларни интерактив эволюцион таҳлили учун зарур тижорат дастури
MEGA — молекуляр-эволюцион генетик таҳлил
Mesquite — қиёсий биология учун Java тилидаги дастур
Muscle — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастури. ClustalW га нисбатан анча тез ва аниқ ишлайди.
PHYLIP — филогенетик дастурлар пакети
Phylo_win — филогенетик таҳлил. Дастур график интерфейсга эга.
PopGene — Популяциянинг генетик хилма- хиллик таҳлили
Populations — популяцион-генетик таҳлил
PSI Protein Classifier — PSI-BLAST дастури воситасида олинган натижаларнинг жамланиши
Seaview — филогенетик таҳлил (график интерфейси билан)
Sequin —кетма-кетликларни GenBank, EMBL, DDBJ даги тўпланиши
T-Coffee — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастури. ClustalW ва ClustalX га қараганда анча сезгирроқ
UGENE — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари, филогенетик таҳлил, аннотирлаш, маълумотлар базалари билан ишлаш учун эркин ҳолатдаги рус тилидаги дастур.



Download 26,72 Kb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   2   3   4




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©hozir.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling

kiriting | ro'yxatdan o'tish
    Bosh sahifa
юртда тантана
Боғда битган
Бугун юртда
Эшитганлар жилманглар
Эшитмадим деманглар
битган бодомлар
Yangiariq tumani
qitish marakazi
Raqamli texnologiyalar
ilishida muhokamadan
tasdiqqa tavsiya
tavsiya etilgan
iqtisodiyot kafedrasi
steiermarkischen landesregierung
asarlaringizni yuboring
o'zingizning asarlaringizni
Iltimos faqat
faqat o'zingizning
steierm rkischen
landesregierung fachabteilung
rkischen landesregierung
hamshira loyihasi
loyihasi mavsum
faolyatining oqibatlari
asosiy adabiyotlar
fakulteti ahborot
ahborot havfsizligi
havfsizligi kafedrasi
fanidan bo’yicha
fakulteti iqtisodiyot
boshqaruv fakulteti
chiqarishda boshqaruv
ishlab chiqarishda
iqtisodiyot fakultet
multiservis tarmoqlari
fanidan asosiy
Uzbek fanidan
mavzulari potok
asosidagi multiservis
'aliyyil a'ziym
billahil 'aliyyil
illaa billahil
quvvata illaa
falah' deganida
Kompyuter savodxonligi
bo’yicha mustaqil
'alal falah'
Hayya 'alal
'alas soloh
Hayya 'alas
mavsum boyicha


yuklab olish