Генетика, геномика ва биотехнологиянинг замонавий муаммолари


АННОТАЦИЯ SSR ЛОКУСОВ, СЦЕПЛЕННЫХ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ



Download 2,5 Mb.
Pdf ko'rish
bet12/123
Sana12.03.2022
Hajmi2,5 Mb.
#491646
TuriСборник
1   ...   8   9   10   11   12   13   14   15   ...   123
Bog'liq
konfer 2016 cgb

АННОТАЦИЯ SSR ЛОКУСОВ, СЦЕПЛЕННЫХ С УСТОЙЧИВОСТЬЮ 
ХЛОПЧАТНИКА К ПОЧВЕННОМУ ПАТОГЕНУ 
V. dahliae
Клюева М.В., Салахутдинов И.Б., Шерматов Ш.Э., Абдурахмонов И.Ю. 
Центр Геномики и биоинформатики АН РУз 
111215, Узбекистан, Ташкентская обл., Кибрайский р-он, ул. Университетская, д. 2 
m.klyueva@genomics.uz 
Хлопчатник - одна из важнейших культур служащая источником 
природного волокна, масла и биотоплива. Одним из заболеваний наносящих 
серьезный вред хлопководству является вертициллезный вилт, вызываемый 
патогенным грибком 
Verticillium dahliae
, часто встречаемым в нашем 
регионе. Вертициллезный вилт вызывает пожелтение, увядание, опадение 
листьев и даже гибель растения, что в результате сказывается на 
урожайности и качестве волокна. На сегодняшний день наиболее 
эффективным и экологически безопасным путем контроля над вилтом 
является разработка новых устойчивых сортов. Современная генетика 
предлагает для этого использовать маркер-ассоциированную селекцию, 
позволяющую получать новые сорта в короткие сроки, отбирая растения по 
ДНК-маркерам, ассоциированным с теми или иными хозяйственно-ценными 
признаками. Данная работа была направлена на анализ микросателлитных 


Материалы конференции «Современные проблемы генетики, геномики и биотехнологии», 18 мая 2016г. 
23 
маркеров, ассоциированных с устойчивостью к 
V. dahliae
, с целью 
обнаружения кандидатных генов, находящихся в маркированных регионах 
коррелирующих с устойчивостью к 
V. dahliae.
В данной работе были проанализированы 4 микросателитных маркера, 
описанных Zhang и др. (2014) - NAU4925, NAU2893, NAU2274 и NAU3324, 
сцепленных с признаком устойчивости хромосомо-замещенной линии 
хлопчатника 
G. hirsutum
к изоляту V991
 
(
V. dahlia
). Маркированные регионы 
были проанализированы на референтном геноме 
G. hirsutum
(Yu и др., 2015) 
при помощи 
in silico
PCR в пакете UGENE 1.20.0 (Okonechnikov и др., 2012). 
Виртуальные маркированные регионы (~100 т.п.н.) далее сравнивались с 
кодирующими последовательностями генов, представленных в NCBI с 
использованием BLAST для обнаружения в них кандидатных генов. 
Верификация полученных кодирующих регионов далее осуществлялась при 
помощи приложения для предсказания генов AUGUSTUS. Последующим 
тщательным анализом литературы определялись кандидатные гены, которые 
прямо или косвенно связаны с устойчивостью растений к патогену 
V. dahliae.
Многие из обнаруженных генов, расположенных в регионах, 
прилегающим к маркерам, оказались связанными с солеустойчивостью и 
засухоустойчивостью растений. Это вероятно связано с тем, что эти два вида 
стресса как и вилтовое увядание напрямую связаны с нарушением водного 
баланса в растениях, и при этих стрессах начальные симптомы увядания 
растений проявляются одинаково. Это дает основания полагать, что 
обнаруженные нами гены участвуют в ответах растений на вышеуказанные 
типы стрессов. В результате биоинформатического анализа, были 
аннотированы гены, в регионах, прилегающих к следующим маркерам:
NAU3324
– дирижент-подобные белки принимают участие в ответах 
растения на засуху и засоленность почв. В 
G. hirsutum
препятствуют 
распространению 
V. dahliae
посредством лигнификации клеточных стенок 
(Shi и др., 2012); 
NAU2274
– аннексин-подобный белок, влияет на 
устойчивость 
G. hirsutum
к засоленности и засухе. (Zhang и др., 2015); 


Материалы конференции «Современные проблемы генетики, геномики и биотехнологии», 18 мая 2016г. 
24 
NAU2893
– α-Галактозидаза, уровень которой повышается в 
A. thaliana
при 
заражении 
Verticillium longisporum
, активно участвует в формировании 
клеточной стенки (барьерная функция) при инфицировании (Floerl и др., 
2012); 
NAU4925
– белок 18а, связанный с аутофагией, необходимый при 
засухе и солевом стрессе растений в процессах разрушения белков 
пораженных клеток (Liu и др., 2009). 
Таким образом, с помощью инструмента 
in silico
PCR и BLAST анализа 
были определены кандидатные гены, напрямую или косвенно участвующие в 
обеспечении механизмов устойчивости 
G. hirsutum
к вертицеллезному вилту. 
Информация о данных генах может быть в последующем использована в 
биотехнологии хлопчатника для получения устойчивых сортов. 

Download 2,5 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   ...   8   9   10   11   12   13   14   15   ...   123




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©hozir.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling

kiriting | ro'yxatdan o'tish
    Bosh sahifa
юртда тантана
Боғда битган
Бугун юртда
Эшитганлар жилманглар
Эшитмадим деманглар
битган бодомлар
Yangiariq tumani
qitish marakazi
Raqamli texnologiyalar
ilishida muhokamadan
tasdiqqa tavsiya
tavsiya etilgan
iqtisodiyot kafedrasi
steiermarkischen landesregierung
asarlaringizni yuboring
o'zingizning asarlaringizni
Iltimos faqat
faqat o'zingizning
steierm rkischen
landesregierung fachabteilung
rkischen landesregierung
hamshira loyihasi
loyihasi mavsum
faolyatining oqibatlari
asosiy adabiyotlar
fakulteti ahborot
ahborot havfsizligi
havfsizligi kafedrasi
fanidan bo’yicha
fakulteti iqtisodiyot
boshqaruv fakulteti
chiqarishda boshqaruv
ishlab chiqarishda
iqtisodiyot fakultet
multiservis tarmoqlari
fanidan asosiy
Uzbek fanidan
mavzulari potok
asosidagi multiservis
'aliyyil a'ziym
billahil 'aliyyil
illaa billahil
quvvata illaa
falah' deganida
Kompyuter savodxonligi
bo’yicha mustaqil
'alal falah'
Hayya 'alal
'alas soloh
Hayya 'alas
mavsum boyicha


yuklab olish