Сборник содержит материалы научной мультиконференции «Биотех- нология медицине будущего»

СИМПОЗИУМ
«СТРУКТУРНАЯ БИОЛОГИЯ: 
ПЕРСПЕКТИВЫ ПРОЕКТА СКИФ»

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
118
Возможности ЭПР для исследования структуры нуклеиновых кислот
и их комплексов с протеинами
Елена Багрянская
1,2
1
Новосибирский институт органической химии имени Н.Н.Ворожцова СО РАН, 
проспект Лаврентьева 9, Новосибирск, 630090, РФ 
2
Новосибирский Государственный Университет, Пирогова 2, Новосибирск, 630090, РФ
В последние годы импульсная дипольная спектроскопия ЭПР в сочетание с направ-
ленным введением спиновых меток широко применяется для исследования третичной 
структуры и свойств протеинов, нуклеиновых кислот и их комплексов. В этом методе 
в качестве спиновых меток используются нитроксильные радикалы и комплексы 
гадолиния радикалы. Относительно недавно было предложно использовать тритильные 
радикалы, преимуществом которых является возможность измерения относительно 
больших расстояний при низких температурах. Кроме того было показано, что 
тритильные радикалы можно использовать для измерения расстояний между метками 
до 6.5 нм при комнатных и физиологически важных температурах [1]. 
В докладе показаны возможности дипольной ЭПР спектроскопии для исследования 
структуры нуклеиновых кислот и их комплексов с протеинами на примере ряда исследо-
ваний, выполненных в сотрудничестве трех институтов НИОХ СО РАН, МТЦ СО РАН, 
ИХБиФМ СО РАН. Исследование конформационных изменений ДНК с апуриновым/
ампиримидиновым сайтом или АР сайтом), который является наиболее распростра-
ненным повреждением ДНК, а также структуры комплекса ДНК с человеческой апири-
новой/ апуримидиновоый эндонуклеазой 1 с использование спиновых меток на основе 
тритильных радикалов [2]. Разработка новых спиновых меток на основе гидрофильного 
тритильного радикала OX063 с низкой токсичностью и не склонным к агрегации 
с альбумином и мембранах клеток. [3] Разработка спиновых меток на основе С
60
.
На примере ковалентно связанных пар C
60
с тритильным радикалов (С
60-
TAM) показана 
рекордная чувствительность и возможность измерения расстояний при комнатных 
температурах [4]. Применение новых высокостабильных спиновых меток на основе 
тетраэтилзамещенных пирролидиновых нитроксильных радикалов для исследования 
процессов с участием протеина RL2 в клетках [5].
1. O. Krumkacheva, E. Bagryanskaya. Trityl radicals as spin labels, From the book: Electron 
paramagnetic Resonance: Volume 25, 2016, 25, 35-60. ISSN:978-1-78262-857-6.
2. O.A. Krumkacheva, G.Shevelev, A.Lomzov, N.Dyrkheeva, A.A. Kuzhelev, V.V. Koval,
V.M. Tormyshev, I. Kirilyuk, M. Fedin, D. pyshnyi, O. Lavrik, E.G. Bagryanskaya. NAR, 
2019, in press.
3. V.M. Tormyshev, O.A. Krumkacheva, A.Chubarov, D.V.Trukhin, O.Yu.Rogozhnikova,
A. Spitsina, A.A. Kuzhelev, V.V. Koval, M.Fedin, T. Godovikova, M. Bowman, E.G. Bagryan- 
skaya. Chem. Eur. Jour. 2019, submitted.
4. O.A. Krumkacheva, I.O. Timofeev, L.V. politanskaya, E.V. Tretyakov, O. Yu. Rogozhnikova,
D.V. Trukhin, A. Chubarov, E.G. Bagryanskaya and M.V. Fedin, Angwante, 2019, submitted.
5. O. Chinak, A. Shernuykov, V.M. Tormyshev, I. Kirilyuk, V.Rikhter, E.G. Bagryanskaya.
J. phys. Chem. C, 2019, submitted.
Исследования выполнены при поддержке гранта Министерства образования и науки, 
грант 14.W03.31.0034 и грант РФФИ № 18-04-0038.

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
119