Szymanska, E., E. Saccenti, AK Smilde, JA Westerhuis (2012). Ikki marta tekshirish:
metabolomik tadqiqotlarda
PLS-DA modellari uchun diagnostika statistikasini tekshirish.
Metabolomika 8, 3-16 doi: 10.1007/
s11306-011-0330-3 330 [pii]
Timmerman, ME, E. Ceulemans, K. De Roover, K. Van Leeuwen (2013). K subfazosi klasterlashni bildiradi.
Xulq-
atvorni tadqiq qilish usullari 45, 1011-1023 Timmerman, ME, E. Ceulemans, HA Kiers, M. Vichi (2010).
Faktorial va qisqartirilgan K-o'rtachalar qayta ko'rib chiqildi.
Hisoblash statistikasi va ma'lumotlarni tahlil qilish 54,
1858-1871 Timmerman, ME, HC Hoefsloot, AK Smilde, E. Ceulemans (2015).
ANOVA bir vaqtning
o'zida komponentlar tahlilida masshtablash.
Metabolomika, 1-12 Tomar, N., RK De (2013). Metabolik tarmoqni
tahlil qilish usullarini solishtirish va an
Ultsch, A. (2003).
U*-matritsa: yuqori o'lchamli ma'lumotlarda klasterlarni ko'rish vositasi, Fachbereich
Onaning glyukemik nazoratini tavsiflash: yarim parametrik regressiyadan foydalangan holda ko'proq
informatsion yondashuv.
Maternal-Fetal and Neonatal Medicine jurnali 25, 15-19 Velagapudi, VR, va
boshqalar. (2010). Ichak mikrobiotasi mezbon energiya va lipid metabolizmini modulyatsiya qiladi
Markazlash, masshtablash va transformatsiyalar: metabolomik ma'lumotlarning biologik ma'lumotlar
mazmunini yaxshilash.
BMC genomikasi 7, 142 VanDyke, R., Y. Ren, HJ Sucharew, M. Miodovnik, B.
Rosenn, JC Khoury (2012).
Tibshirani, R., G. Valter, T. Hastie (2001). Bo'shliqlar statistikasi orqali ma'lumotlar to'plamidagi
klasterlar sonini
baholash.
Qirollik statistika jamiyati jurnali: B seriyasi (Statistik metodologiya) 63, 411-423
Molekulyar tizimlar biologiyasi 8, doi:10.1038/msb.2012.43
Wiechert, W. (2002). Modellashtirish va simulyatsiya: metabolik muhandislik vositalari.
J Biotechnol 94, 37-63
doi:S0168165601004187 [pii]
Vettukattil, R. (2015). Xom metabonomik ma'lumotlarni oldindan qayta ishlash.
Metabonomika: usullar va
Tomasi, G., F. van den Berg, C. Andersson (2004). Xromatografik ma'lumotlarni qayta ishlash usullari sifatida
optimallashtirilgan korrelyatsiya va dinamik vaqtni burish.
Chemometrics jurnali 18, 231-241
Metabolik muhandislik uchun ariza.
gen,
sichqonlarda.
Lipid tadqiqotlari jurnali 51, 1101-1112
Vichi, M., HA Kiers (2001). Faktorial k-ikki tomonlama ma'lumotlar uchun tahlilni anglatadi.
Hisoblash statistikasi
va ma'lumotlarni tahlil qilish 37, 49-64
Vang-Sattler, R., va boshqalar. (2012). Metabolomikalar tomonidan
aniqlangan pre-diabet uchun yangi biomarkerlar.
Szczesniak, RD, GL McPhail, LL Duan, M. Macaluso, RS Amin, JP Clancy (2013). Kistik fibrozda o'pka
funktsiyasining tez pasayishini baholash uchun yarim parametrik yondashuv.
Epidemiologiya yilnomalari
23, 771-777
Chemometrics 16, 119-128
Trygg, J., S. Wold (2002). Yashirin tuzilmalarga ortogonal proyeksiyalar (O-PLS).
jurnali
Protokollar, 123-136
16
van Den Berg, RA, HC Hoefsloot, JA Westerhuis, AK Smilde, MJ van der Werf (2006).
Matematik va informatika.
Theodoridis, GA, HG Gika, EJ Want, ID Wilson (2012). Suyuq xromatografiya - massa spektrometriyasiga
asoslangan global metabolit profilini aniqlash: sharh.
Analytica chimica acta 711, 7-
Wetmore, DR va boshqalar. (2010). Metabolomik profilni aniqlash Kistik fibroz hujayralarida patogenez bilan
bog'liq biokimyoviy yo'llar va biomarkerlarni ochib beradi.
Biologik kimyo jurnali 285, 30516-30522 doi:
10.1074/jbc.M110.140806
58
Machine Translated by Google
Bioinformatika 8, 279-293
Umumlashtirilgan teskarilarga qisman eng kichik kvadratlar (PLS) yondashuvi.
SIAM Journal on
Scientific and Statistical Computing 5, 735-743
Xia, J., R. Mandal, IV Sinelnikov, D. Broadhurst, DS Wishart (2012). MetaboAnalyst 2.0 - metabolomik
ma'lumotlarni tahlil qilish uchun keng qamrovli server.
Nuklein kislotalar tadqiqoti 40, W127-
Biometrik 63, 1031-1037
Yan, M., K. Ye (2007). Og'irlangan bo'shliqlar statistikasi yordamida klasterlar sonini aniqlash.
Wold, H. (1966). Iterativ eng kichik kvadratlar bo'yicha asosiy komponentlar va tegishli modellarni baholash.
Ko'p o'lchovli tahlil 1, 391-420 Wold, S., A. Ruhe, H. Wold, I. Dunn, WJ (1984).
Chiziqli
regressiyadagi kollinearlik muammosi.
Chjan, S., GN Gowda, V. Asiago, N. Shanaiah, C. Barbas, D. Raftery (2008). Korrelyativ va miqdoriy 1 H
NMR-ga asoslangan metabolomikalar diabetik kalamushlarda o'ziga xos metabolik yo'llarning
buzilishlarini aniqlaydi.
Analitik biokimyo 383, 76-84
Mass-spektrometriya ma'lumotlarini tahlil qilish.
BMC Bioinformatika 10, 4
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems 58, 109-130 Xi,
Y., DM Rocke (2008). NMR spektroskopik metabolomikasi ma'lumotlari uchun asosiy tuzatish
Wold, S., M. Sjöström, L. Eriksson (2001). PLS-regressiya: kimyometrikaning asosiy vositasi.
Yang, C., Z. He, W. Yu (2009). MALDI uchun ommaviy cho'qqilarni aniqlash algoritmlarini solishtirish
va bioo'tkazgich.
Bioinformatika 25, 1470-1471
Wishart, DS (2007). Hisoblash metabolomikasidagi hozirgi taraqqiyot.
Brifinglar
Xia, J., DI Broadhurst, M. Wilson, DS Wishart (2012). Klinik metabolomikada tarjima biomarkerining
kashfiyoti: kirish qo'llanma.
Metabolomika 9, 280-299 doi: 10.1007/s11306-012-0482-9
tahlil.
BMC Bioinformatika 9, 324
Chjan, JD, S. Wiemann (2009). KEGGgraph: R da KEGG PATHWAY ga grafik yondashuv
Kislotalar Res 41, D801-7 doi: 10.1093/nar/gks1065 gks1065 [pii]
Xia, J., N. Psixogios, N. Young, DS Wishart (2009). MetaboAnalyst: metabolomik ma'lumotlarni tahlil qilish
va sharhlash uchun veb-server.
Nuklein kislotalari tadqiqoti 37, W652-W660 Xing, EP, MI Jordan,
S. Russell, AY Ng Yon ma'lumotlar bilan klasterlash uchun qo'llanilishi bilan masofaviy metrikani o'rganish.
In: Neyron axborotni qayta ishlash tizimlaridagi yutuqlar, 2002. p 505-512
W133
Wishart, DS va boshqalar. (2013). HMDB 3.0 - 2013 yilda inson metabolomlari ma'lumotlar bazasi.
Nukleik
59
Machine Translated by Google