Bog'liq genomika labortoriya 3 kurslar uchun ishalnma
Ishdan maqsad: Talabalarga Molekulyar markerlarni farqlash va ularni ishlatishni
o`rgatish
DNK markerlari o`zining yuqori informativligi, spetsifikligi, polimorfikligi va foydalanish
qulayligi sababli molekulyar-genetik tadqiqotlarda mustahkam o`rin egallab kelmoqda. Quyida
ularning ba`zilari haqida misollar keltirilgan.
DNK markerlar praymer juftliklar faqat aniq gen yoki genga yondosh hudududlarni
ko`paytirib beradi. Masalan 10 odamdan DNK ajratib olindi siz o`sha odamlar DNK sini asosida
pzr tahlini amalgam oshirib kasalikka chidamli geni bor yoki yo`qligini tekshirish mumkin.buning
uchun siz kassalikka chidamlilik geniga tuzilgan maxsus praymer juftligiga ega bo`lishingiz kerak
. Mos tushgan praymer Marker deb ataladi.
RFLP – Restricted Fragment Length Polymorphism (Bo`laklangan Fragmentlar
Uzunliklari Polimorfizmi - BFUP). RFLP tahlili ilk bor Jeffris tomonidan 1985-yil olib borilgan
(Jeffreys et al., 1985).
Bu usulda restriktazalar DNKni maxsus uchastkalarda, odatda palindrom ketma-ketliklarda
parchalaydi. Mutatsiya natijasida shunday ketma-ketliklarning asoslaridan biri o`zgarib qolgan
bo`lsa bu uchastkalar restriktazalar yordamida parchalanmaydi. Aksincha mutatsiya natijasida
restriktazalarga chidamli bo`lgan boshqa yangi uchastkalar paydo bo`lishi mumkin. Xolbuki
gipervariabel uchastkalar genomning transpozitsiya, noteng rekombinatsiyalar va DNK-
polimeraza kompleksining "sirg`alishi" kabi anchayin murakkab tarkib topishidan kelib chiqqan.
Natijada esa ikki genetik noo`xshash individrardan kelib chiqqan bir-biriga mos keluvchi DNK
fragmentlari tez-tez har xil uzunlikda restriksion fragmentlarni yuzaga keltiradi. Bu marker
tizimining bir qancha kamchiliklari mavjud, jumladan yuqori mehnat, qimmatliligi shuningdek
irsiylanishning dominant ko`rinishi (geterozigota genotipini aniqlash imkoniyati yo`q).
RAPD
markerlari
(Random
Amplified
Polymorphic
DNA
-
Tasodifiy
Amplifikatsiyalangan DNKlar Polimorfizmi) PZRga (Polimeraza Zanjir Reaksiyasi) asoslangan
bo`lib, usulning asosiy mohiyati DNK regionlarining qisqa (10 nukleotidgacha) erkin
oligonukleotidlar tomonidan tasodifiy amlifikatsiyalanishi bilan belgilanadi. Praymerlarning
kerakli uchastkalarga borib (gibridizatsiya) juda yumshoq sharoitda amalga oshiriladi. RAPD
praymerlari DNKning o`ziga komplementar bo`lgan uchastkasi bilan bog`lanadi va amplifikatsiya
ikkala zanjirda ikki yo`nalish bo`ylab amalga oshadi. Praymerlanish o`rtacha holda har bir million
juft asosga bir marta to`g`ri keladi (Jones et al. 1997). Bitta praymer tegishli tur yoki individuum
DNK o`xshash uchaskasiga bog`liq holda bir necha PZR mahsulotlari berishi mumkin. RAPD
markerlayi odatda populatsiyaning genetik strukturasini o`rganishda yoki genetik kartalashtirishda
foydalanilishi mumkin.