Определитель бактерий берги. Научная классификация 1 Принципы классификации прокариот

1.2 Научная классификация нитрифицирующих бактерий

В «Определителе бактерий-9» (1984-1989) прокариоты в зависимости от строения клеточной стенки разделены на 17 частей. Нитрифицирующие бактерии относятся к Части 12 - Аэробные хемолитотрофные бактерии и близкие к ним организмы. Группа разделена на 3 подгруппы в зависимости от химической природы окисляемых неорганических соединений .

Подгруппа 1: Бесцветные сероокисляющие бактерии. В подгруппе объединены бактерии, способные окислять неорганические восстановленные соединения серы, образуя в качестве конечного продукта сульфат. Семейство Thiobacillaceae. Обитатели почвы, воды, серных ключей или серных месторождений. Их можно обнаружить невооруженным глазом по наличию обильных белых отложений серы, взвесей, тяжей, розеток или пленок.
Подгруппа 2: Железо- и марганец-окисляющие и / или осаждающие бактерии, получают энергию в процессе окисления двухвалентного железа или марганца кислородом воздуха. Семейство Siderocapsaceae и несколько других родов. Они способны откладывать оксиды железа или марганца вне клетки. В основном обитают в железосодержащих водах.
Подгруппа 3: Нитрифицирующие бактерии, получают энергию в процессе окисления аммиака до нитрата. В подгруппу включены бактерии семейства Nitrobacteriaceae.
Процесс окисления аммиакиа до нитрата происходит в два этапа. На первом этапе происходит окисление аммимка до нитритов, а на втором нитриты окисляются до нитратов. Эти два процесса требуют различных наборов нитрифицирующих ферментов и выполняются двумя различными группами бактерий. В зависимости от того, какую фазу процесса осуществляют нитрифицирующие бактерии их причисляют к одной из двух секций. Секция А: окисление аммиака до нитритов производят бактерии родов Nitroso- : роды Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosolobus, Nitrosospira и др. Секция В: окисление нитритов до нитратов производят бактерии родов Nitro- : Nitrobacter, Nitrospira, Nitrococcus
Таким образом, научная классификация нитрифицирующих прокариот выглядит следующим образом:
Царство: Procariotaе
Подцарство (домен): Bacteria
Отдел: Gracilicites
Класс: Scotobacteria
Группа Proteobacteria
Семейство: Nitrobacteriaceae
Секция А
Род: Nitrosomonas
Род: Nitrosospira
Род: Nitrosococcus
Род: Nitrosolobus
Секция В
Род: Nitrobacter
Род: Nitrococcus
Род: Nitrospira
Так же можно придерживаться другой классификацией, по которой нитрифицирущие бактерии относятся к двум типам Nitrospira и Proteobacteria, пяти классам Nitrospira, Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria и Deltaproteobacteria
Домен Bacteria
Тип Nitrospira или Nitrospirae
Класс Nitrospira
Порядок Nitrospirales
Семейство Nitrospiraceae
Род Nitrospira
Тип Proteobacteria
Класс Alphaproteobacteria
Порядок Rhizobiales
Семейство Bradyrhizobiaceae
Род Nitrobacter
Класс Betaproteobacteria
Порядок Nitrosomonadales
Семейство Nitrosomonadaceae
Род Nitrosolobus
Род Nitrosospira
Род Nitrosomonas
Класс Gammaproteobacteria
Порядок Chromatiales
Семейство Ectothiorhodospiraceae
Род Nitrococcus
Семейство Chromatiaceae
Род Nitrosococcus
Класс Deltaproteobacteria or Deltabacteria
Порядок Desulfobacterales
Семейство Nitrospinaceae
Род Nitrospina