Mundarija: Kirish I bob. Biologik ketma – ketliklar

Ketma-ketlikni tekislash/tahlil qilish uchun cheklash dasturlashni qo'llash - Biologiya

NIAID Gripp genomlarini ketma-ketlashtirish loyihasi va GenBank ma'lumotlari to'plami. U gripp ketma-ketligini tahlil qilish, izohlash va GenBankga topshirish uchun vositalarni taqdim etadi. Ushbu resursda grippning boshqa ketma-ketlik manbalariga, nashrlar va gripp viruslari haqida umumiy ma'lumotlarga havolalar mavjud.
Mahalliy foydalanish uchun BLAST bajariladigan dasturlari Solaris, LINUX, Windows va MacOSX tizimlari uchun taqdim etilgan. Qo'shimcha ma'lumot olish uchun ftp katalogidagi README fayliga qarang. BLAST nukleotidlari, oqsillari va tarjima qilingan qidiruvlar uchun oldindan formatlangan maʼlumotlar bazalari, shuningdek, db quyi katalogida yuklab olish mumkin.
Mustaqil BLAST dasturlari bilan foydalanish uchun ma'lumotlar bazalarini ketma-ket joylashtiring. Ushbu katalogdagi fayllar BLAST bilan foydalanishga tayyor bo'lgan oldindan formatlangan ma'lumotlar bazalaridir.
Mustaqil BLAST dasturlari bilan foydalanish uchun ma'lumotlar bazalarini FASTA formatida ketma-ket joylashtiring. Ushbu ma'lumotlar bazalarini BLAST bilan ishlatishdan oldin formatdb yordamida formatlash kerak.
Tanlangan toʻliq eukaryotik va prokaryotik genomlardan oʻxshash ketma-ketliklar uchun BLAST qidiruvini amalga oshiradi.
RefSeqGene/LRG to'plamidagi genomik ketma-ketliklarning BLAST qidiruvini amalga oshiradi. Standart displey Grafik displeydagi hizalanishlarni ko'rib chiqish uchun tayyor navigatsiyani ta'minlaydi.
Biologik ketma-ketliklar orasidagi mahalliy o'xshashlik hududlarini topadi. Dastur nukleotid yoki oqsil ketma-ketliklarini ketma-ketlik ma'lumotlar bazalari bilan taqqoslaydi va o'yinlarning statistik ahamiyatini hisoblab chiqadi. BLAST ketma-ketliklar orasidagi funktsional va evolyutsion munosabatlarni aniqlash, shuningdek, gen oilalari a'zolarini aniqlashga yordam berish uchun ishlatilishi mumkin.
2.3. DNKning ketma-ketligi.
DNKning ketma-ketligi ni aniqlash jarayoni nuklein kislota ketma-ketligi - tartibi nukleotidlar yilda DNK. U to'rtta asosning tartibini aniqlash uchun ishlatiladigan har qanday usul yoki texnologiyani o'z ichiga oladi: adenin, guanin, sitozinva timin. DNKning tez sekvensiya usullarining paydo bo'lishi biologik va tibbiy tadqiqotlar va kashfiyotlarni juda tezlashtirdi.
Bilim DNK ketma-ketliklari kabi ko'plab amaliy sohalarda asosiy biologik tadqiqotlar uchun ajralmas bo'lib qoldi tibbiy diagnostika, biotexnologiya, sud biologiyasi, virusologiya va biologik sistematik. Sog'lom va mutatsiyaga uchragan DNK ketma-ketligini taqqoslash natijasida turli xil kasalliklar, shu jumladan turli xil saraton kasalliklari aniqlanishi mumkin, antikor repertuarini tavsiflash va bemorni davolashni boshqarish uchun ishlatilishi mumkin. DNKni ketma-ketlashtirishning tezkor usuliga ega bo'lish tibbiy yordamni tezroq va individual ravishda amalga oshirishga, ko'plab organizmlarni aniqlash va kataloglashtirishga imkon beradi.
Zamonaviy DNK sekvensiya texnologiyasi bilan erishilgan ketma-ketlikning tezligi to'liq DNK sekanslarini ketma-ketlikda muhim rol o'ynagan yoki genomlar, hayotning ko'plab turlari va turlari, shu jumladan inson genomi ko'plab hayvon, o'simlik va mikrob turlarining boshqa to'liq DNK ketma-ketliklari.